MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_015666	GGCG	2	8	2070467	2070474	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6502	NC_015666	ACA	2	6	2070518	2070523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_015666	CCG	2	6	2070555	2070560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6504	NC_015666	ATA	3	9	2070660	2070668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_015666	TCC	2	6	2070949	2070954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6506	NC_015666	CTA	2	6	2070967	2070972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_015666	GAC	2	6	2071021	2071026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_015666	GACC	2	8	2071629	2071636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6509	NC_015666	CGG	2	6	2071639	2071644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_015666	CGC	2	6	2072651	2072656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6511	NC_015666	ATG	2	6	2072714	2072719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_015666	GAC	2	6	2073092	2073097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6513	NC_015666	CGC	2	6	2073107	2073112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6514	NC_015666	TCA	2	6	2073660	2073665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_015666	GACGC	2	10	2073982	2073991	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6516	NC_015666	AGC	2	6	2073996	2074001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_015666	ACA	2	6	2074015	2074020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_015666	ATTAC	2	10	2074056	2074065	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6519	NC_015666	TGGTG	2	10	2074628	2074637	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_015666	CGG	2	6	2074673	2074678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_015666	CGGC	2	8	2074704	2074711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_015666	AT	3	6	2080571	2080576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_015666	AT	3	6	2080587	2080592	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_015666	TATC	2	8	2080626	2080633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6525	NC_015666	GGT	2	6	2081890	2081895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_015666	ATA	2	6	2081898	2081903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_015666	CG	3	6	2081924	2081929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6528	NC_015666	GCG	2	6	2081963	2081968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_015666	G	6	6	2082036	2082041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_015666	GTGTG	2	10	2084258	2084267	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_015666	GTG	2	6	2084280	2084285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_015666	CGTG	2	8	2084299	2084306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6533	NC_015666	A	6	6	2084307	2084312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_015666	GGTGTG	2	12	2084825	2084836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_015666	GTCTG	2	10	2084855	2084864	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6536	NC_015666	TAA	2	6	2085210	2085215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_015666	GCA	2	6	2085242	2085247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_015666	CCGCG	2	10	2085321	2085330	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6539	NC_015666	ACG	2	6	2085397	2085402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_015666	GATA	2	8	2085417	2085424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_015666	GCC	2	6	2086068	2086073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_015666	CGC	3	9	2086078	2086086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_015666	CCT	2	6	2086100	2086105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6544	NC_015666	AGT	2	6	2086128	2086133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_015666	GAT	2	6	2087597	2087602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_015666	TGG	3	9	2087632	2087640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_015666	CGC	2	6	2087685	2087690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6548	NC_015666	CGA	2	6	2087697	2087702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_015666	GCC	2	6	2092871	2092876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6550	NC_015666	CGT	2	6	2092907	2092912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_015666	CTT	2	6	2092926	2092931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_015666	CGGT	2	8	2092933	2092940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6553	NC_015666	CCCT	2	8	2093864	2093871	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6554	NC_015666	TA	3	6	2093888	2093893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_015666	CG	3	6	2096414	2096419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_015666	TGTC	2	8	2096448	2096455	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6557	NC_015666	GTT	2	6	2096525	2096530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_015666	GGA	2	6	2096543	2096548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_015666	CCGAAC	2	12	2096551	2096562	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_015666	GAA	2	6	2096609	2096614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_015666	CGG	2	6	2096680	2096685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_015666	CGG	2	6	2096697	2096702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_015666	TCGCCG	2	12	2096706	2096717	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_015666	TCGG	2	8	2096743	2096750	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6565	NC_015666	AC	3	6	2096801	2096806	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6566	NC_015666	ACG	2	6	2096808	2096813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_015666	TTGA	2	8	2096830	2096837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_015666	TCC	2	6	2096877	2096882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6569	NC_015666	TA	3	6	2097905	2097910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_015666	AGG	2	6	2097928	2097933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_015666	TCGT	2	8	2099518	2099525	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6572	NC_015666	GCC	2	6	2099570	2099575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6573	NC_015666	TACT	2	8	2099616	2099623	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6574	NC_015666	GCC	2	6	2099676	2099681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6575	NC_015666	CGC	2	6	2099701	2099706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6576	NC_015666	AGA	2	6	2099712	2099717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_015666	TCT	2	6	2099757	2099762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_015666	AAACC	2	10	2099870	2099879	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
6579	NC_015666	ACA	2	6	2102118	2102123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_015666	A	6	6	2102131	2102136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_015666	CGG	2	6	2107632	2107637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_015666	CGC	2	6	2107659	2107664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6583	NC_015666	ATTC	2	8	2107667	2107674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6584	NC_015666	AATAA	2	10	2108457	2108466	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_015666	GAT	2	6	2108506	2108511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_015666	CGG	2	6	2108523	2108528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_015666	CGA	2	6	2108551	2108556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_015666	TCG	2	6	2108792	2108797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_015666	ACG	2	6	2109420	2109425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_015666	GC	3	6	2110843	2110848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6591	NC_015666	TCG	2	6	2110855	2110860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_015666	CAAA	2	8	2110890	2110897	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6593	NC_015666	TCT	2	6	2113380	2113385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_015666	TCG	2	6	2118401	2118406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_015666	T	6	6	2118424	2118429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_015666	CGGC	2	8	2118433	2118440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6597	NC_015666	CTA	2	6	2120126	2120131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_015666	CCG	2	6	2120166	2120171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6599	NC_015666	ATCAA	2	10	2120188	2120197	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6600	NC_015666	TAC	2	6	2120246	2120251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6601	NC_015666	GACTGT	2	12	2120479	2120490	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6602	NC_015666	CG	3	6	2120502	2120507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6603	NC_015666	GCGG	2	8	2120509	2120516	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6604	NC_015666	CCG	2	6	2122452	2122457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6605	NC_015666	CGG	2	6	2122463	2122468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_015666	CGAA	2	8	2122471	2122478	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6607	NC_015666	GCG	2	6	2127628	2127633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_015666	TTA	2	6	2127689	2127694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_015666	CTC	2	6	2127716	2127721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_015666	GAC	2	6	2127740	2127745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_015666	AGC	2	6	2127756	2127761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_015666	CGA	2	6	2127848	2127853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_015666	TCG	2	6	2127861	2127866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6614	NC_015666	CG	3	6	2128519	2128524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_015666	GCCG	2	8	2128557	2128564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6616	NC_015666	GGGC	2	8	2129248	2129255	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6617	NC_015666	CCG	2	6	2129276	2129281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_015666	GCC	2	6	2129300	2129305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6619	NC_015666	CGC	2	6	2129351	2129356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6620	NC_015666	GGC	2	6	2130150	2130155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_015666	CGA	2	6	2130247	2130252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6622	NC_015666	GTTAC	2	10	2131214	2131223	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6623	NC_015666	GCG	2	6	2131230	2131235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_015666	AG	4	8	2131253	2131260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_015666	GGTTC	2	10	2131939	2131948	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6626	NC_015666	CGG	2	6	2132001	2132006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_015666	GAGCG	2	10	2132601	2132610	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6628	NC_015666	CGGGA	2	10	2132622	2132631	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6629	NC_015666	GGA	2	6	2132646	2132651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6630	NC_015666	GACG	2	8	2132652	2132659	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6631	NC_015666	GATC	2	8	2132688	2132695	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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