MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015666	GGA	2	6	1914455	1914460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_015666	GTA	2	6	1914548	1914553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_015666	CCGG	2	8	1915035	1915042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6004	NC_015666	CGG	2	6	1915052	1915057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_015666	TCG	2	6	1915061	1915066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_015666	GCGCG	2	10	1915125	1915134	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6007	NC_015666	CGC	2	6	1915138	1915143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6008	NC_015666	CGTAC	2	10	1915177	1915186	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6009	NC_015666	GAGC	2	8	1915235	1915242	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_015666	CGA	2	6	1915247	1915252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_015666	GGA	2	6	1915260	1915265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_015666	GGAG	2	8	1915283	1915290	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_015666	GAGCG	2	10	1915303	1915312	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6014	NC_015666	GCA	2	6	1915331	1915336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_015666	TCA	2	6	1915374	1915379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_015666	GA	3	6	1915413	1915418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_015666	GCC	2	6	1915449	1915454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_015666	GGC	2	6	1915458	1915463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_015666	GTCT	2	8	1916643	1916650	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6020	NC_015666	CGAT	2	8	1916655	1916662	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6021	NC_015666	CGT	2	6	1918733	1918738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_015666	AAGG	2	8	1918739	1918746	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_015666	CGG	2	6	1918777	1918782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_015666	GAT	2	6	1918834	1918839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_015666	TCG	2	6	1918841	1918846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_015666	GTT	2	6	1918861	1918866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_015666	CATG	2	8	1918907	1918914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6028	NC_015666	GAT	2	6	1918931	1918936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_015666	TGA	2	6	1918940	1918945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_015666	CGGT	2	8	1919542	1919549	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6031	NC_015666	CGGC	2	8	1919626	1919633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6032	NC_015666	GTCC	2	8	1919645	1919652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6033	NC_015666	CGG	2	6	1919703	1919708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_015666	CGTT	2	8	1919795	1919802	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6035	NC_015666	CCGT	2	8	1920318	1920325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6036	NC_015666	GGT	2	6	1921526	1921531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_015666	CGGC	2	8	1921590	1921597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6038	NC_015666	CGGT	2	8	1921605	1921612	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6039	NC_015666	GTG	2	6	1924125	1924130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_015666	CGA	3	9	1924160	1924168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_015666	CCG	2	6	1924189	1924194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6042	NC_015666	GCG	2	6	1924213	1924218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_015666	GAC	2	6	1924716	1924721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_015666	ATA	2	6	1925165	1925170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_015666	AATATT	2	12	1925186	1925197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015666	CCG	2	6	1925251	1925256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6047	NC_015666	GATC	2	8	1926149	1926156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6048	NC_015666	CGA	2	6	1926163	1926168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_015666	GGT	2	6	1926186	1926191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_015666	TCGA	3	12	1926266	1926277	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6051	NC_015666	GCG	2	6	1926289	1926294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_015666	TCC	2	6	1926295	1926300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6053	NC_015666	ATGA	2	8	1926312	1926319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_015666	ACCG	2	8	1926379	1926386	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6055	NC_015666	AC	3	6	1926406	1926411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_015666	CGGT	2	8	1926433	1926440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6057	NC_015666	GC	3	6	1926441	1926446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_015666	CGAA	2	8	1926459	1926466	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6059	NC_015666	ATCGAT	2	12	1926480	1926491	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6060	NC_015666	CGCT	2	8	1926543	1926550	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6061	NC_015666	CGC	2	6	1926551	1926556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_015666	CG	3	6	1927440	1927445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_015666	CCG	2	6	1927450	1927455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_015666	CGC	2	6	1927457	1927462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6065	NC_015666	T	6	6	1927464	1927469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_015666	C	6	6	1927900	1927905	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6067	NC_015666	CCG	2	6	1927911	1927916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_015666	TCG	2	6	1928003	1928008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_015666	TGT	2	6	1928028	1928033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_015666	GTC	2	6	1928053	1928058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_015666	CGAGCG	2	12	1928070	1928081	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_015666	CGGAG	2	10	1928591	1928600	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6073	NC_015666	GCC	2	6	1928618	1928623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_015666	GTC	2	6	1928634	1928639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_015666	GGC	2	6	1931648	1931653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_015666	GAG	2	6	1932883	1932888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_015666	GCC	2	6	1932983	1932988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_015666	CGAC	2	8	1933034	1933041	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6079	NC_015666	AGT	2	6	1933617	1933622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6080	NC_015666	TAC	2	6	1933643	1933648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_015666	GTT	2	6	1933690	1933695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015666	CGA	2	6	1934695	1934700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_015666	ACCGA	2	10	1934731	1934740	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6084	NC_015666	CGAC	2	8	1934741	1934748	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6085	NC_015666	GCA	2	6	1936338	1936343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_015666	CGG	2	6	1936348	1936353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_015666	CGC	2	6	1936873	1936878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6088	NC_015666	CGG	2	6	1936901	1936906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_015666	GC	3	6	1936926	1936931	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_015666	AACGG	2	10	1936944	1936953	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6091	NC_015666	GCC	2	6	1940121	1940126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6092	NC_015666	ACG	2	6	1940158	1940163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_015666	TCGGC	2	10	1940810	1940819	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6094	NC_015666	CGT	2	6	1940836	1940841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_015666	GAC	2	6	1941371	1941376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_015666	GTTC	2	8	1943204	1943211	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_015666	TTCGG	2	10	1943218	1943227	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6098	NC_015666	GTC	2	6	1943267	1943272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_015666	CGT	2	6	1943328	1943333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_015666	CG	3	6	1943362	1943367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_015666	GCGG	2	8	1943372	1943379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_015666	ACT	2	6	1944554	1944559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_015666	CCG	2	6	1944589	1944594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_015666	GCT	2	6	1945580	1945585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_015666	GTC	2	6	1945586	1945591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_015666	AC	3	6	1946843	1946848	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_015666	CG	3	6	1946866	1946871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_015666	GCC	2	6	1947599	1947604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_015666	CT	3	6	1947605	1947610	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6110	NC_015666	GATC	2	8	1947613	1947620	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6111	NC_015666	AAGGC	2	10	1947658	1947667	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6112	NC_015666	CGG	2	6	1948693	1948698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_015666	CGG	2	6	1949999	1950004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_015666	GC	3	6	1950009	1950014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6115	NC_015666	AC	3	6	1950068	1950073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6116	NC_015666	CGA	2	6	1950101	1950106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_015666	GTGGCG	2	12	1950107	1950118	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6118	NC_015666	CGGTG	2	10	1950123	1950132	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6119	NC_015666	GGC	2	6	1950160	1950165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6120	NC_015666	CCGC	2	8	1952692	1952699	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6121	NC_015666	GCC	2	6	1952725	1952730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_015666	GGTCG	2	10	1952751	1952760	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6123	NC_015666	GCG	2	6	1952790	1952795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_015666	GAGC	2	8	1952829	1952836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6125	NC_015666	CA	3	6	1952842	1952847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6126	NC_015666	TGA	2	6	1954970	1954975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6127	NC_015666	TAC	2	6	1954993	1954998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_015666	CTCG	2	8	1955075	1955082	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6129	NC_015666	CG	3	6	1956776	1956781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6130	NC_015666	GGC	2	6	1956798	1956803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6131	NC_015666	CCGA	2	8	1956822	1956829	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6261	NC_015666	GACT	2	8	1988171	1988178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6262	NC_015666	ACG	2	6	1988185	1988190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6264	NC_015666	CGA	2	6	1988251	1988256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6385	NC_015666	TAT	2	6	2038490	2038495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6387	NC_015666	GC	3	6	2038986	2038991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6388	NC_015666	GTC	2	6	2039821	2039826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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