MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 chromosome

Total Repeats: 11425

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015666	GTCGC	2	10	1377970	1377979	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4502	NC_015666	CGCC	2	8	1378044	1378051	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4503	NC_015666	GAA	2	6	1378058	1378063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_015666	CCCG	2	8	1378795	1378802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4505	NC_015666	GTG	2	6	1378813	1378818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_015666	CGG	2	6	1378834	1378839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_015666	CCG	2	6	1379358	1379363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_015666	GTA	2	6	1379377	1379382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_015666	ACGG	2	8	1379414	1379421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4510	NC_015666	GGCG	3	12	1379450	1379461	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4511	NC_015666	GCGA	2	8	1379462	1379469	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4512	NC_015666	CCGT	2	8	1379494	1379501	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_015666	CTGGTA	2	12	1379518	1379529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4514	NC_015666	GGC	2	6	1379542	1379547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_015666	AGC	2	6	1379565	1379570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_015666	CTCA	2	8	1379594	1379601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4517	NC_015666	GTGTT	2	10	1381716	1381725	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_015666	CCCT	2	8	1381801	1381808	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4519	NC_015666	CGGT	2	8	1383111	1383118	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4520	NC_015666	ACGCG	2	10	1383122	1383131	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4521	NC_015666	ACC	2	6	1384323	1384328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4522	NC_015666	GAGT	2	8	1384355	1384362	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_015666	GTT	2	6	1384411	1384416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_015666	GCG	2	6	1386041	1386046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_015666	GAA	2	6	1386060	1386065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015666	TCCG	2	8	1388541	1388548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_015666	GATC	2	8	1388556	1388563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4528	NC_015666	ACGG	2	8	1388582	1388589	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4529	NC_015666	GTCGT	2	10	1388601	1388610	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4530	NC_015666	GTT	2	6	1389846	1389851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_015666	CGCT	2	8	1389863	1389870	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4532	NC_015666	GAC	2	6	1389893	1389898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_015666	CGC	2	6	1390845	1390850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4534	NC_015666	CGGAG	2	10	1390854	1390863	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4535	NC_015666	ACG	2	6	1390864	1390869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_015666	TTCG	2	8	1390960	1390967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4537	NC_015666	CG	3	6	1390974	1390979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_015666	CGA	2	6	1391104	1391109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4539	NC_015666	GTTC	2	8	1393866	1393873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4540	NC_015666	CGAT	2	8	1393948	1393955	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4541	NC_015666	CT	4	8	1394428	1394435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4542	NC_015666	CAG	2	6	1394439	1394444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_015666	CGA	2	6	1394476	1394481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4544	NC_015666	CGC	2	6	1394498	1394503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_015666	GCC	2	6	1395320	1395325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_015666	GTC	2	6	1395356	1395361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_015666	ACC	2	6	1397522	1397527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_015666	GCT	2	6	1397600	1397605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_015666	CGA	2	6	1398373	1398378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_015666	TGCG	2	8	1399284	1399291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4551	NC_015666	GATC	2	8	1399328	1399335	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4552	NC_015666	CGC	2	6	1399340	1399345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4553	NC_015666	CT	3	6	1400339	1400344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_015666	ACT	2	6	1400346	1400351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_015666	TACC	2	8	1400363	1400370	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_015666	CTC	2	6	1400439	1400444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4557	NC_015666	ATA	2	6	1400490	1400495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015666	AATA	2	8	1400497	1400504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_015666	CGG	2	6	1400527	1400532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_015666	ACT	2	6	1400681	1400686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_015666	ATCGAT	2	12	1400687	1400698	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4562	NC_015666	TTCGA	2	10	1402398	1402407	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4563	NC_015666	CCG	2	6	1402419	1402424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4564	NC_015666	GCC	2	6	1402474	1402479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_015666	ACG	2	6	1403410	1403415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_015666	GCG	2	6	1403416	1403421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_015666	TCC	2	6	1404699	1404704	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4568	NC_015666	GGGT	2	8	1404775	1404782	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_015666	AGG	2	6	1404818	1404823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_015666	CGT	2	6	1405446	1405451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_015666	ACGG	2	8	1405452	1405459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_015666	ACA	2	6	1405480	1405485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_015666	CGG	3	9	1405494	1405502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_015666	CG	3	6	1405503	1405508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4575	NC_015666	CG	3	6	1405513	1405518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_015666	CGAG	2	8	1405541	1405548	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4577	NC_015666	GAC	2	6	1405564	1405569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_015666	CGT	2	6	1405612	1405617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_015666	TCG	2	6	1407079	1407084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_015666	CG	3	6	1407089	1407094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_015666	TCG	2	6	1407130	1407135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_015666	CGA	2	6	1407160	1407165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_015666	CA	4	8	1407174	1407181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_015666	CGAAA	2	10	1407187	1407196	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4585	NC_015666	GCT	2	6	1408606	1408611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_015666	CGA	2	6	1408700	1408705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_015666	GCCG	2	8	1408721	1408728	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_015666	CG	3	6	1408977	1408982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_015666	GTC	2	6	1409046	1409051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_015666	CCGC	2	8	1409056	1409063	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4591	NC_015666	CGG	2	6	1409074	1409079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_015666	TCG	2	6	1409114	1409119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_015666	GCC	2	6	1409376	1409381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_015666	CGTC	2	8	1410078	1410085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4595	NC_015666	GTCA	2	8	1410182	1410189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4596	NC_015666	AGTC	2	8	1410200	1410207	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_015666	CGC	2	6	1410231	1410236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4598	NC_015666	GAAC	2	8	1410239	1410246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_015666	TCC	2	6	1411608	1411613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4600	NC_015666	GACC	2	8	1412172	1412179	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4601	NC_015666	CG	3	6	1412323	1412328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4602	NC_015666	ACTCTC	3	18	1415354	1415371	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_015666	TGT	2	6	1415384	1415389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_015666	AAC	2	6	1415396	1415401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_015666	CCG	3	9	1415413	1415421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4606	NC_015666	GCG	2	6	1416219	1416224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_015666	GCG	2	6	1417966	1417971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4608	NC_015666	CGGG	2	8	1417982	1417989	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_015666	GCCG	2	8	1417994	1418001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_015666	TAA	2	6	1418369	1418374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_015666	CGA	2	6	1418432	1418437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_015666	CGG	2	6	1418438	1418443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_015666	CG	3	6	1418448	1418453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_015666	TAG	2	6	1418534	1418539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015666	GCCG	2	8	1419027	1419034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_015666	GACCG	2	10	1419070	1419079	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4617	NC_015666	GGC	2	6	1421556	1421561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_015666	TCGCTT	2	12	1421562	1421573	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_015666	TCG	2	6	1423681	1423686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_015666	CGC	2	6	1423694	1423699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_015666	TC	3	6	1423716	1423721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_015666	CGG	2	6	1424439	1424444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_015666	GGC	2	6	1424466	1424471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_015666	ACC	2	6	1425762	1425767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_015666	GCC	2	6	1425854	1425859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_015666	CGT	2	6	1425864	1425869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_015666	GCT	2	6	1425874	1425879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_015666	GCC	2	6	1425884	1425889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4629	NC_015666	GCGCG	2	10	1425917	1425926	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4630	NC_015666	GT	3	6	1428622	1428627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_015666	TGC	2	6	1428642	1428647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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