MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halopiger xanaduensis SH-6 plasmid pHALXA01

Total Repeats: 1702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015658	GCG	2	6	135113	135118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_015658	GAC	3	9	135193	135201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_015658	GGC	2	6	135206	135211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_015658	GCCG	2	8	135245	135252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_015658	TCGA	2	8	135302	135309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_015658	GGT	2	6	135329	135334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_015658	TAT	2	6	135463	135468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_015658	TCT	3	9	136215	136223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_015658	TGGT	2	8	136232	136239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
510	NC_015658	CGT	2	6	136284	136289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_015658	GAT	2	6	136298	136303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_015658	TC	3	6	136316	136321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_015658	CCG	2	6	137109	137114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_015658	GCAC	2	8	137128	137135	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
515	NC_015658	TTG	2	6	139031	139036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_015658	CGG	2	6	139061	139066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_015658	AGA	2	6	139139	139144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_015658	CG	3	6	139222	139227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
519	NC_015658	TCTT	2	8	139231	139238	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
520	NC_015658	GACA	2	8	139885	139892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
521	NC_015658	AGAC	2	8	139893	139900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
522	NC_015658	ACG	2	6	141150	141155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_015658	CGAAC	2	10	142109	142118	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
524	NC_015658	ACGC	2	8	142140	142147	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
525	NC_015658	TGC	2	6	142166	142171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_015658	CCG	2	6	142183	142188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_015658	CGCT	2	8	142200	142207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
528	NC_015658	CAG	2	6	142258	142263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_015658	GAC	2	6	142298	142303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_015658	CGT	2	6	142667	142672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_015658	ATG	2	6	143484	143489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_015658	CTG	2	6	144283	144288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_015658	CCG	2	6	144292	144297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_015658	TCG	2	6	144376	144381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_015658	TC	3	6	144390	144395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_015658	AG	3	6	144406	144411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_015658	ATC	2	6	144423	144428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_015658	AC	3	6	144429	144434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_015658	CCG	2	6	148817	148822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
540	NC_015658	CGT	2	6	149040	149045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_015658	TTTCGT	2	12	149061	149072	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
542	NC_015658	TCGA	2	8	149074	149081	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_015658	CGA	3	9	149087	149095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_015658	CG	3	6	149099	149104	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
545	NC_015658	ACC	2	6	149109	149114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
546	NC_015658	ACG	2	6	149123	149128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_015658	GAACG	2	10	149156	149165	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
548	NC_015658	GCG	2	6	149182	149187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_015658	CGT	2	6	149782	149787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_015658	GGTCG	2	10	149788	149797	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
551	NC_015658	GTC	2	6	149834	149839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_015658	TTCGA	2	10	150087	150096	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
553	NC_015658	CCGA	2	8	150107	150114	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
554	NC_015658	AGTAT	2	10	150147	150156	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
555	NC_015658	TAC	2	6	150847	150852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_015658	CCG	2	6	153481	153486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_015658	AT	3	6	153530	153535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_015658	ACG	2	6	153585	153590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_015658	CGG	2	6	153629	153634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_015658	GAC	2	6	153660	153665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_015658	AGT	2	6	153683	153688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_015658	CGC	3	9	154232	154240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_015658	CAA	2	6	154291	154296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_015658	AAT	2	6	155428	155433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_015658	AAC	2	6	155442	155447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_015658	AGC	2	6	155509	155514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_015658	CCGT	2	8	156644	156651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
568	NC_015658	CGG	2	6	156704	156709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_015658	CGA	2	6	156752	156757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_015658	AAC	2	6	156823	156828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_015658	ACG	2	6	156841	156846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_015658	ACG	2	6	156923	156928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_015658	TAC	2	6	156933	156938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_015658	TCG	2	6	158747	158752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_015658	CCG	2	6	158762	158767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_015658	ACCC	2	8	158769	158776	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
577	NC_015658	CCG	2	6	161783	161788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_015658	ACT	2	6	162008	162013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_015658	G	6	6	162014	162019	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
580	NC_015658	GTC	2	6	162078	162083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_015658	AT	4	8	162107	162114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_015658	ATTA	2	8	164043	164050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_015658	ACG	2	6	164060	164065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_015658	ACG	2	6	166224	166229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_015658	CGAC	2	8	166245	166252	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
586	NC_015658	ACC	2	6	166265	166270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
587	NC_015658	ACGCCG	2	12	166279	166290	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
588	NC_015658	CGAC	2	8	166301	166308	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
589	NC_015658	GGC	2	6	168595	168600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_015658	GCG	2	6	168924	168929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_015658	CGCGA	2	10	168978	168987	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
592	NC_015658	TAG	2	6	169046	169051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_015658	CGC	2	6	169058	169063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_015658	CTAC	2	8	169128	169135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
595	NC_015658	TA	3	6	169144	169149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_015658	GA	3	6	169179	169184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_015658	TCAC	2	8	171199	171206	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_015658	TGGA	2	8	171222	171229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_015658	GCG	2	6	171236	171241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_015658	CGGC	2	8	171250	171257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_015658	CGG	2	6	171292	171297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_015658	AT	3	6	171342	171347	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_015658	CGT	2	6	171861	171866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_015658	CGC	2	6	171905	171910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_015658	ATC	2	6	171930	171935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_015658	GCAC	2	8	171940	171947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
607	NC_015658	TGAC	2	8	173445	173452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_015658	GACG	2	8	173513	173520	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
609	NC_015658	CCG	2	6	173539	173544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_015658	CGCT	2	8	175471	175478	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
611	NC_015658	CCG	2	6	175498	175503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_015658	CCGA	2	8	175513	175520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
613	NC_015658	GA	3	6	175519	175524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_015658	CTA	2	6	177335	177340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_015658	CGA	2	6	177376	177381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_015658	CGGC	2	8	177400	177407	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
617	NC_015658	TGG	2	6	178504	178509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_015658	GAC	2	6	178609	178614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_015658	GAC	2	6	178704	178709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_015658	GCTTCG	2	12	181029	181040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_015658	CGCT	2	8	181076	181083	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
622	NC_015658	ATCG	2	8	181089	181096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_015658	GAG	2	6	181166	181171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_015658	AT	3	6	181341	181346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_015658	GTCG	2	8	181347	181354	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
626	NC_015658	CCG	2	6	181454	181459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_015658	GAA	2	6	181460	181465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_015658	GATT	2	8	181474	181481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_015658	TCCG	2	8	181486	181493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
630	NC_015658	CGAC	2	8	183419	183426	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
631	NC_015658	CCG	2	6	184336	184341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_015658	C	6	6	184356	184361	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
633	NC_015658	TACCG	2	10	184370	184379	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
634	NC_015658	AGGT	2	8	184381	184388	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_015658	TCG	2	6	184390	184395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_015658	TGT	2	6	185619	185624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_015658	G	6	6	185631	185636	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
638	NC_015658	CGGCT	2	10	185649	185658	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
639	NC_015658	GTC	2	6	185703	185708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_015658	TAAT	2	8	187925	187932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_015658	TAA	2	6	187977	187982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_015658	CGC	2	6	192474	192479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_015658	CGT	2	6	192539	192544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_015658	CTG	2	6	192582	192587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_015658	GTG	2	6	192594	192599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
646	NC_015658	TTTG	2	8	192600	192607	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
647	NC_015658	AACA	2	8	192613	192620	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
648	NC_015658	A	6	6	192632	192637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
649	NC_015658	GAA	2	6	195249	195254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
650	NC_015658	TCG	2	6	197189	197194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
651	NC_015658	CGT	2	6	197974	197979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_015658	GCC	2	6	197998	198003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
653	NC_015658	CGACGT	2	12	198392	198403	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
654	NC_015658	GATC	2	8	198426	198433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
655	NC_015658	CCGA	2	8	201715	201722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
656	NC_015658	CTA	2	6	201774	201779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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658	NC_015658	TCA	2	6	201827	201832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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660	NC_015658	TAAA	2	8	201913	201920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
661	NC_015658	AT	3	6	201935	201940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
662	NC_015658	AT	3	6	203075	203080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
663	NC_015658	CCA	2	6	203084	203089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
664	NC_015658	TCGA	2	8	203919	203926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
665	NC_015658	ATG	2	6	204755	204760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
666	NC_015658	ACG	2	6	204815	204820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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668	NC_015658	TA	3	6	208266	208271	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
669	NC_015658	G	6	6	208307	208312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
670	NC_015658	GTC	2	6	208356	208361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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672	NC_015658	GCCC	2	8	209948	209955	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
673	NC_015658	TGGT	2	8	209991	209998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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675	NC_015658	CTT	2	6	210029	210034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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681	NC_015658	CTC	2	6	210316	210321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
682	NC_015658	TGG	2	6	210352	210357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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686	NC_015658	AAT	2	6	210528	210533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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721	NC_015658	TA	3	6	222671	222676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
722	NC_015658	ATA	2	6	222691	222696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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752	NC_015658	TCA	2	6	227273	227278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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762	NC_015658	CGTC	2	8	227673	227680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
763	NC_015658	GGC	2	6	227919	227924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_015658	GCG	2	6	228580	228585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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769	NC_015658	CG	3	6	234079	234084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
770	NC_015658	CGT	2	6	234088	234093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_015658	GTT	2	6	238012	238017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_015658	TA	3	6	238265	238270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_015658	GAC	2	6	239729	239734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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785	NC_015658	CCGA	2	8	241138	241145	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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912	NC_015658	CGA	2	6	283596	283601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
913	NC_015658	GTC	2	6	283607	283612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
914	NC_015658	GCG	2	6	283615	283620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
915	NC_015658	TTG	2	6	283643	283648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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955	NC_015658	GA	3	6	289446	289451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
956	NC_015658	AGA	2	6	289471	289476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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959	NC_015658	GCC	2	6	289535	289540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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