MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 20244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015510	CAT	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015510	CT	3	6	46	51	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_015510	TATT	2	8	67	74	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015510	ACAA	2	8	1594	1601	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015510	AAT	2	6	1646	1651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015510	ACAA	2	8	2948	2955	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_015510	TGT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015510	A	6	6	2990	2995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015510	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015510	AAT	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015510	A	6	6	3043	3048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015510	ACC	2	6	3069	3074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_015510	CCT	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015510	CA	3	6	4573	4578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_015510	ATG	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015510	TG	3	6	4601	4606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015510	T	8	8	5785	5792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015510	TGA	2	6	5797	5802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015510	T	6	6	5829	5834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015510	TCA	2	6	5855	5860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015510	CTC	2	6	7462	7467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_015510	A	6	6	11123	11128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015510	T	6	6	11150	11155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015510	AG	3	6	11184	11189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015510	T	6	6	12753	12758	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015510	T	6	6	12771	12776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015510	T	6	6	12811	12816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015510	GCT	2	6	12835	12840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_015510	CAAAA	2	10	13643	13652	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015510	A	6	6	15633	15638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015510	TTGG	2	8	15694	15701	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015510	AAT	2	6	15712	15717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015510	A	7	7	17284	17290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015510	T	6	6	17309	17314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015510	TTA	2	6	18267	18272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015510	T	7	7	18307	18313	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015510	AAT	2	6	18317	18322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015510	AGT	2	6	20205	20210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015510	T	8	8	20241	20248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015510	A	6	6	20302	20307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015510	CA	3	6	20342	20347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_015510	GCG	2	6	20380	20385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015510	T	8	8	20387	20394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015510	CAT	2	6	20407	20412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015510	A	6	6	20840	20845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015510	CAG	2	6	21448	21453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015510	TGC	2	6	21593	21598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015510	T	8	8	21600	21607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015510	AC	3	6	21640	21645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_015510	GAT	2	6	23177	23182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015510	GAT	2	6	23189	23194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015510	T	6	6	23232	23237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015510	TGATT	2	10	23245	23254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015510	AAAG	2	8	23905	23912	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015510	CTTT	2	8	23945	23952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_015510	A	8	8	25787	25794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015510	AACA	2	8	25870	25877	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_015510	AGAC	2	8	28676	28683	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_015510	TGA	2	6	28715	28720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015510	AGT	2	6	28726	28731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015510	GGAT	2	8	28749	28756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015510	A	6	6	29358	29363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015510	CTT	2	6	30497	30502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_015510	CCG	2	6	30550	30555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_015510	T	6	6	30577	30582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015510	AAT	2	6	30824	30829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015510	TTC	2	6	30848	30853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015510	GCG	2	6	30854	30859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015510	TC	3	6	32733	32738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_015510	TCA	2	6	33192	33197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015510	T	7	7	34466	34472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015510	AGC	2	6	34664	34669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015510	CTTT	2	8	34670	34677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_015510	T	7	7	34675	34681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015510	A	7	7	34693	34699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015510	A	6	6	34718	34723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015510	ATC	2	6	34743	34748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015510	C	6	6	35098	35103	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
79	NC_015510	GC	3	6	35109	35114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015510	AGG	2	6	35196	35201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015510	ATT	2	6	35255	35260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015510	A	6	6	35270	35275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015510	AAC	2	6	35280	35285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015510	TGA	2	6	36485	36490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015510	TGA	2	6	36516	36521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015510	TGA	2	6	36537	36542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015510	TGA	2	6	36557	36562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015510	TGG	2	6	37544	37549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015510	T	6	6	37643	37648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015510	GTT	2	6	37660	37665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015510	T	6	6	38155	38160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015510	T	8	8	38215	38222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015510	ACTT	2	8	38291	38298	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_015510	T	6	6	38297	38302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015510	ATC	2	6	38326	38331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_015510	TTA	2	6	40131	40136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015510	TGC	2	6	40152	40157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_015510	A	9	9	40175	40183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015510	T	6	6	40190	40195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015510	TGA	2	6	40220	40225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015510	A	8	8	40274	40281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015510	GTT	2	6	40324	40329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015510	TGA	2	6	41212	41217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015510	T	6	6	41266	41271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015510	GAA	2	6	41289	41294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015510	A	7	7	41296	41302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015510	T	7	7	41325	41331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015510	A	7	7	41335	41341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015510	A	6	6	41350	41355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015510	AAAAT	2	10	41366	41375	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015510	GAA	2	6	42965	42970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015510	GAA	2	6	43058	43063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015510	GGT	2	6	43089	43094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015510	TTC	2	6	43101	43106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015510	T	8	8	45849	45856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015510	TTTTG	2	10	45900	45909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015510	AGAAA	2	10	45914	45923	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015510	CA	3	6	45929	45934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_015510	GCCC	2	8	46046	46053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
120	NC_015510	TG	3	6	46118	46123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015510	ATG	2	6	46153	46158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015510	A	6	6	46166	46171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015510	ACG	2	6	46199	46204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_015510	A	6	6	47245	47250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015510	AAT	2	6	47288	47293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015510	ATT	2	6	48591	48596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015510	ATTG	2	8	49338	49345	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015510	GT	3	6	49577	49582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015510	AGTTT	2	10	49584	49593	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015510	A	9	9	49645	49653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015510	GCAA	2	8	49680	49687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_015510	AATT	2	8	49689	49696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015510	TAA	2	6	49741	49746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015510	TCATT	2	10	49747	49756	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015510	A	8	8	51681	51688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015510	TTTAT	2	10	51719	51728	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015510	GCA	2	6	51732	51737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_015510	A	6	6	51751	51756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015510	T	6	6	52744	52749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015510	G	7	7	52764	52770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015510	A	8	8	52783	52790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015510	GTA	2	6	52804	52809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015510	CAATT	3	15	53592	53606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_015510	AAT	2	6	53626	53631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015510	TTGA	2	8	55193	55200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015510	A	6	6	59054	59059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015510	A	8	8	59089	59096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015510	AGT	2	6	59130	59135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015510	GGT	2	6	59142	59147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015510	T	6	6	59153	59158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015510	CTTTA	2	10	59161	59170	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_015510	ATA	2	6	59177	59182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015510	CTA	2	6	59203	59208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_015510	ACAT	2	8	59229	59236	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
155	NC_015510	T	6	6	60743	60748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015510	T	6	6	60751	60756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015510	A	7	7	60761	60767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015510	T	8	8	60823	60830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015510	A	7	7	60859	60865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_015510	A	7	7	69073	69079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015510	A	6	6	69083	69088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015510	CAA	2	6	69104	69109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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180	NC_015510	A	6	6	69160	69165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_015510	A	6	6	72017	72022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_015510	T	8	8	72057	72064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_015510	TTA	2	6	72076	72081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_015510	TACCTT	2	12	72085	72096	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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286	NC_015510	ATT	2	6	116555	116560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_015510	A	6	6	117942	117947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_015510	C	6	6	117987	117992	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
290	NC_015510	AACA	2	8	117993	118000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
291	NC_015510	TCA	2	6	118570	118575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_015510	TTTC	2	8	118622	118629	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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435	NC_015510	TCA	2	6	188029	188034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
436	NC_015510	ATT	2	6	195359	195364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_015510	ATT	2	6	200866	200871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
438	NC_015510	TGA	2	6	201824	201829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_015510	T	6	6	203595	203600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_015510	A	7	7	203682	203688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_015510	A	6	6	206617	206622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_015510	TGA	2	6	207407	207412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015510	A	9	9	207485	207493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015510	TCT	2	6	207543	207548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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446	NC_015510	ATT	3	9	207591	207599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_015510	CTT	2	6	208113	208118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
449	NC_015510	TAT	2	6	208168	208173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_015510	AGC	2	6	209529	209534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_015510	GAAAAA	2	12	209580	209591	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015510	GAT	2	6	209685	209690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015510	A	6	6	209734	209739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_015510	T	11	11	209783	209793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015510	TC	3	6	209808	209813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
457	NC_015510	T	6	6	211404	211409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_015510	AGG	2	6	211426	211431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
459	NC_015510	CCT	2	6	211479	211484	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_015510	AAC	2	6	211538	211543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_015510	A	6	6	213103	213108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_015510	TGA	2	6	213117	213122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_015510	T	6	6	213703	213708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_015510	A	6	6	213732	213737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_015510	A	6	6	213796	213801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
469	NC_015510	TCAAT	2	10	213864	213873	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
470	NC_015510	TTAC	2	8	215500	215507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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472	NC_015510	TGGT	2	8	217101	217108	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
473	NC_015510	CCT	2	6	217136	217141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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479	NC_015510	AAC	2	6	223431	223436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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483	NC_015510	GCT	2	6	225349	225354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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492	NC_015510	AAGC	2	8	227851	227858	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
493	NC_015510	AAAT	2	8	227914	227921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_015510	CAA	2	6	230909	230914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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