MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 20244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015510	CAA	2	6	1464088	1464093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_015510	TCC	2	6	1464125	1464130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_015510	TCAA	2	8	1464141	1464148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_015510	A	6	6	1464237	1464242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_015510	ACG	2	6	1464378	1464383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_015510	GCA	2	6	1464448	1464453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_015510	AAC	2	6	1464591	1464596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_015510	CAG	2	6	1464667	1464672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_015510	ATG	2	6	1464753	1464758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_015510	TGA	2	6	1464793	1464798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_015510	AAC	2	6	1464807	1464812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_015510	T	6	6	1464821	1464826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_015510	ATC	2	6	1464833	1464838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_015510	CTT	2	6	1464849	1464854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_015510	TGA	2	6	1464876	1464881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_015510	TGC	2	6	1464904	1464909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_015510	CAC	2	6	1464952	1464957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4018	NC_015510	AAG	2	6	1465061	1465066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_015510	CAT	2	6	1465131	1465136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_015510	GGC	2	6	1465198	1465203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_015510	ACA	2	6	1465229	1465234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_015510	GTG	2	6	1465282	1465287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_015510	CAA	2	6	1465473	1465478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4024	NC_015510	TCCT	2	8	1465554	1465561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4025	NC_015510	AGC	2	6	1465587	1465592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_015510	A	6	6	1465615	1465620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_015510	AAG	2	6	1465653	1465658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_015510	CGG	2	6	1465659	1465664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_015510	CGC	2	6	1465681	1465686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_015510	T	6	6	1465691	1465696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_015510	GGA	2	6	1466715	1466720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_015510	TCC	2	6	1467219	1467224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_015510	AAGG	2	8	1467242	1467249	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_015510	TGCA	2	8	1467496	1467503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_015510	TAC	2	6	1467507	1467512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_015510	T	8	8	1467576	1467583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_015510	TCA	2	6	1467596	1467601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_015510	ACAA	2	8	1467609	1467616	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_015510	GTT	2	6	1469681	1469686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_015510	GTT	2	6	1469706	1469711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_015510	GTT	2	6	1469731	1469736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_015510	TGT	2	6	1475909	1475914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_015510	A	6	6	1475924	1475929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_015510	AGC	2	6	1475978	1475983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_015510	GGT	2	6	1476075	1476080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_015510	T	6	6	1476096	1476101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_015510	A	6	6	1476160	1476165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_015510	ATT	2	6	1476178	1476183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_015510	A	6	6	1476223	1476228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_015510	ATA	2	6	1476268	1476273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_015510	TTG	2	6	1476282	1476287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_015510	ATT	2	6	1476333	1476338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_015510	AGC	2	6	1476369	1476374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_015510	CAT	2	6	1476383	1476388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_015510	ACA	2	6	1476394	1476399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_015510	AAG	2	6	1476449	1476454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_015510	CGT	2	6	1477546	1477551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_015510	AC	4	8	1477580	1477587	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_015510	CAA	2	6	1477642	1477647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_015510	AG	3	6	1477686	1477691	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_015510	GAA	2	6	1477719	1477724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_015510	A	6	6	1477784	1477789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_015510	T	6	6	1477819	1477824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_015510	T	6	6	1477828	1477833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_015510	T	6	6	1477849	1477854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_015510	T	6	6	1477866	1477871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_015510	AAGG	2	8	1478883	1478890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_015510	TG	3	6	1479046	1479051	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_015510	TAT	2	6	1480485	1480490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_015510	CGG	2	6	1480504	1480509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_015510	T	6	6	1480515	1480520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_015510	ACA	2	6	1480528	1480533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_015510	ATTT	2	8	1480574	1480581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_015510	ACTTCG	2	12	1481458	1481469	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_015510	TTCC	2	8	1481515	1481522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4076	NC_015510	T	7	7	1483768	1483774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_015510	A	7	7	1483835	1483841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_015510	CCG	2	6	1483843	1483848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_015510	CAC	2	6	1486942	1486947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_015510	AGTAG	2	10	1486955	1486964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_015510	AG	3	6	1486963	1486968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_015510	GCG	2	6	1486971	1486976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_015510	CTT	2	6	1487040	1487045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_015510	CTC	2	6	1488486	1488491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_015510	ACT	2	6	1488518	1488523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_015510	CTAA	2	8	1488721	1488728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4087	NC_015510	TC	3	6	1488738	1488743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4088	NC_015510	TCC	2	6	1488773	1488778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4089	NC_015510	CCT	2	6	1488791	1488796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_015510	TTTTA	2	10	1488845	1488854	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_015510	T	7	7	1488895	1488901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_015510	GTG	2	6	1488949	1488954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_015510	ACA	2	6	1490849	1490854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_015510	TCA	2	6	1490868	1490873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_015510	CAAT	3	12	1490912	1490923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4096	NC_015510	CGAAGT	2	12	1490994	1491005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4097	NC_015510	GCA	2	6	1491966	1491971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_015510	ATGAA	2	10	1492533	1492542	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_015510	ATTG	2	8	1492543	1492550	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_015510	ACC	2	6	1492587	1492592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_015510	AAT	2	6	1492662	1492667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_015510	A	6	6	1495420	1495425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_015510	ACA	2	6	1498436	1498441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_015510	TCTTT	2	10	1498510	1498519	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4105	NC_015510	A	6	6	1499548	1499553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_015510	T	7	7	1501232	1501238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_015510	T	7	7	1501257	1501263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_015510	GCA	2	6	1501310	1501315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_015510	ATGTTG	2	12	1501335	1501346	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_015510	TTGAT	2	10	1508423	1508432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_015510	ACG	2	6	1509363	1509368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_015510	ACG	2	6	1509386	1509391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_015510	A	7	7	1510098	1510104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_015510	AAAG	2	8	1510236	1510243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_015510	AAC	2	6	1510252	1510257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_015510	TCC	2	6	1510318	1510323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_015510	TCT	2	6	1510414	1510419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_015510	T	9	9	1510456	1510464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_015510	A	7	7	1510474	1510480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_015510	T	7	7	1510580	1510586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_015510	A	6	6	1510605	1510610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_015510	GTT	2	6	1510667	1510672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_015510	CA	3	6	1510730	1510735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_015510	ATC	2	6	1510741	1510746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_015510	T	6	6	1510798	1510803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_015510	TCC	2	6	1511435	1511440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_015510	CAGCG	2	10	1511471	1511480	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4128	NC_015510	TCA	2	6	1511498	1511503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_015510	AC	3	6	1511505	1511510	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_015510	AAC	2	6	1515510	1515515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_015510	AATT	2	8	1515566	1515573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_015510	TCTCAA	2	12	1518086	1518097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4134	NC_015510	A	8	8	1518225	1518232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_015510	T	6	6	1521554	1521559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_015510	A	7	7	1521623	1521629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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