MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 20244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015510	T	6	6	614777	614782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015510	TCT	2	6	614933	614938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_015510	ATG	2	6	615044	615049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015510	GGT	2	6	615114	615119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015510	CCG	2	6	615332	615337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1506	NC_015510	ACTC	2	8	615369	615376	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_015510	AC	3	6	615435	615440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_015510	GCT	2	6	615454	615459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_015510	GGA	2	6	615787	615792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015510	GCA	2	6	615850	615855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_015510	CAG	2	6	615975	615980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_015510	GTC	2	6	615997	616002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_015510	TCAA	2	8	616102	616109	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1514	NC_015510	TGA	2	6	616190	616195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015510	CAT	2	6	616246	616251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_015510	ACA	2	6	616426	616431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_015510	AGA	2	6	616432	616437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015510	CGG	2	6	616439	616444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_015510	GAA	2	6	616520	616525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015510	CTGA	2	8	616584	616591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_015510	TGC	2	6	616654	616659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_015510	GAAA	2	8	616830	616837	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015510	A	6	6	616846	616851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015510	TTG	2	6	616958	616963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015510	ATG	2	6	616964	616969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015510	A	6	6	616971	616976	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015510	TCCA	2	8	617173	617180	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_015510	CTT	2	6	617305	617310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_015510	GAAT	2	8	617311	617318	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015510	GACG	2	8	617447	617454	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_015510	TCA	2	6	617489	617494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_015510	CTT	2	6	617507	617512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_015510	TC	3	6	617519	617524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_015510	TGC	2	6	617553	617558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_015510	ACC	2	6	617770	617775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_015510	AAT	2	6	617776	617781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015510	ATCA	2	8	619295	619302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_015510	ATT	2	6	620112	620117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_015510	GGT	2	6	620118	620123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015510	ATG	2	6	620167	620172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015510	CGG	2	6	620241	620246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_015510	AGC	2	6	620288	620293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_015510	CAG	2	6	620296	620301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_015510	CCA	2	6	620367	620372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_015510	AAC	2	6	620489	620494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_015510	CCT	2	6	620579	620584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1547	NC_015510	TG	3	6	620634	620639	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015510	AAC	2	6	620648	620653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_015510	CCTC	2	8	620825	620832	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1550	NC_015510	TGC	2	6	620907	620912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_015510	CCGCTC	2	12	620973	620984	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_015510	ACT	2	6	621010	621015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_015510	ACC	2	6	621039	621044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1554	NC_015510	GTA	2	6	621079	621084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015510	GTA	2	6	621094	621099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015510	ATAA	2	8	621412	621419	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015510	TTA	2	6	621431	621436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015510	CTT	2	6	621495	621500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_015510	T	6	6	621561	621566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015510	TGC	2	6	621805	621810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_015510	TAGC	2	8	621818	621825	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_015510	GCC	2	6	621890	621895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_015510	TCA	2	6	622031	622036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_015510	AGG	2	6	622283	622288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015510	GAA	2	6	622472	622477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015510	TAC	2	6	622489	622494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_015510	TTGA	2	8	622608	622615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015510	CCT	2	6	622626	622631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_015510	ATA	2	6	622684	622689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015510	GAA	2	6	622804	622809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015510	TCC	2	6	622930	622935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_015510	CTT	2	6	622938	622943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_015510	TTG	2	6	623059	623064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015510	CTAT	2	8	623189	623196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_015510	TC	3	6	623213	623218	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_015510	AT	3	6	623256	623261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_015510	CTAT	2	8	623387	623394	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_015510	CTC	2	6	623460	623465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_015510	GAC	2	6	623659	623664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_015510	TGTT	2	8	623722	623729	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015510	T	6	6	623734	623739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015510	A	6	6	623743	623748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015510	TG	3	6	623800	623805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015510	T	6	6	623813	623818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015510	TTG	2	6	623851	623856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015510	TAC	2	6	623868	623873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_015510	TTCC	2	8	623933	623940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_015510	CAA	2	6	623990	623995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_015510	TTC	2	6	624130	624135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1591	NC_015510	GTT	2	6	624249	624254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015510	GTT	2	6	624259	624264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_015510	ATAG	2	8	624407	624414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015510	ATC	2	6	624476	624481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_015510	ATT	2	6	624664	624669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015510	ATA	2	6	624726	624731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015510	CTTTT	2	10	624776	624785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_015510	CTA	2	6	624850	624855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1600	NC_015510	GAG	2	6	625049	625054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015510	G	6	6	625179	625184	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_015510	TTC	2	6	625186	625191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_015510	GCT	2	6	625205	625210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_015510	AAG	2	6	625391	625396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015510	ATT	2	6	625406	625411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015510	A	8	8	625434	625441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015510	T	6	6	625461	625466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015510	TAT	2	6	625496	625501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_015510	AAG	2	6	626895	626900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1611	NC_015510	ATA	2	6	626927	626932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015510	A	6	6	626951	626956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015510	CGCT	2	8	627640	627647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_015510	CGA	2	6	627719	627724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_015510	T	7	7	627816	627822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015510	ATTA	2	8	627837	627844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015510	AATT	2	8	627855	627862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015510	A	6	6	628958	628963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_015510	TGG	2	6	628965	628970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_015510	CAG	2	6	629014	629019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_015510	A	6	6	629051	629056	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015510	TAC	2	6	629089	629094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_015510	A	7	7	629095	629101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015510	T	6	6	630248	630253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015510	TAA	2	6	630341	630346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015510	T	7	7	631432	631438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015510	AAAAC	2	10	631489	631498	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1628	NC_015510	CTA	2	6	631516	631521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_015510	T	7	7	634001	634007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_015510	AC	3	6	634028	634033	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_015510	T	6	6	634048	634053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015510	CCGCA	2	10	634181	634190	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1633	NC_015510	A	6	6	634200	634205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015510	TG	3	6	634219	634224	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1636	NC_015510	T	6	6	634284	634289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_015510	TTG	2	6	774566	774571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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