MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haliscomenobacter hydrossis DSM 1100 chromosome

Total Repeats: 20244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_015510	CTT	2	6	5585299	5585304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_015510	CAC	2	6	5585305	5585310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14003	NC_015510	ACCG	2	8	5585314	5585321	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14004	NC_015510	AGC	2	6	5585395	5585400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_015510	CAA	3	9	5585411	5585419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14006	NC_015510	A	7	7	5585458	5585464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14007	NC_015510	CTG	2	6	5585491	5585496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14008	NC_015510	TAA	2	6	5585501	5585506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14009	NC_015510	CTTC	2	8	5585530	5585537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14010	NC_015510	A	6	6	5587653	5587658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_015510	TCA	3	9	5587664	5587672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_015510	CGA	2	6	5593321	5593326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_015510	ACAAT	2	10	5593374	5593383	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14014	NC_015510	CGA	2	6	5593388	5593393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_015510	AAT	2	6	5593425	5593430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_015510	TAAA	2	8	5594128	5594135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14017	NC_015510	ACT	2	6	5594193	5594198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14018	NC_015510	A	7	7	5595458	5595464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_015510	ACTA	2	8	5595485	5595492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14020	NC_015510	A	6	6	5595495	5595500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14021	NC_015510	ATACA	2	10	5595523	5595532	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14022	NC_015510	ACA	2	6	5595537	5595542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14023	NC_015510	GAA	2	6	5595566	5595571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_015510	AGA	3	9	5595604	5595612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_015510	CAA	2	6	5595627	5595632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14026	NC_015510	CAA	2	6	5595644	5595649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14027	NC_015510	ACA	2	6	5595675	5595680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_015510	CTT	2	6	5595716	5595721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_015510	TCAA	2	8	5597310	5597317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14030	NC_015510	A	6	6	5597399	5597404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_015510	ACT	2	6	5597463	5597468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_015510	AACA	2	8	5597495	5597502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14033	NC_015510	CGTG	2	8	5599057	5599064	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14034	NC_015510	AAG	2	6	5600741	5600746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_015510	AAC	2	6	5600761	5600766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_015510	ATTT	2	8	5600773	5600780	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14037	NC_015510	GGAA	2	8	5600789	5600796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14038	NC_015510	TTTTG	2	10	5600810	5600819	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_015510	T	6	6	5602355	5602360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_015510	AGG	2	6	5605056	5605061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14041	NC_015510	CCT	2	6	5605128	5605133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14042	NC_015510	CCT	2	6	5605137	5605142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_015510	A	7	7	5607174	5607180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_015510	T	6	6	5607221	5607226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_015510	AGTG	2	8	5611954	5611961	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14046	NC_015510	TAAAAA	2	12	5611981	5611992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_015510	TCT	2	6	5612029	5612034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_015510	TTC	2	6	5612035	5612040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_015510	ATC	2	6	5612245	5612250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14050	NC_015510	A	6	6	5612253	5612258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14051	NC_015510	GCG	2	6	5612999	5613004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14052	NC_015510	T	6	6	5613041	5613046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_015510	ATT	2	6	5613063	5613068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_015510	A	6	6	5613142	5613147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_015510	GAA	3	9	5617205	5617213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_015510	CGC	2	6	5618825	5618830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14057	NC_015510	TTG	2	6	5618937	5618942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14058	NC_015510	TACTC	2	10	5618949	5618958	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14059	NC_015510	TC	3	6	5618979	5618984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14060	NC_015510	ATC	2	6	5618985	5618990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14061	NC_015510	TTC	2	6	5619038	5619043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_015510	TTCC	2	8	5619118	5619125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14063	NC_015510	GTACT	2	10	5619126	5619135	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14064	NC_015510	CGA	2	6	5619202	5619207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14065	NC_015510	G	6	6	5619275	5619280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_015510	AGT	2	6	5619342	5619347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_015510	GTA	2	6	5619363	5619368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_015510	TGA	2	6	5619389	5619394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_015510	CTT	2	6	5619398	5619403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_015510	ATTTC	2	10	5619430	5619439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14071	NC_015510	GCC	2	6	5619531	5619536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14072	NC_015510	GTC	2	6	5619546	5619551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14073	NC_015510	AAT	2	6	5619552	5619557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_015510	TTG	2	6	5619565	5619570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14077	NC_015510	T	6	6	5619652	5619657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14078	NC_015510	AAT	2	6	5619676	5619681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14079	NC_015510	TTG	2	6	5619688	5619693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_015510	GCA	2	6	5619775	5619780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14083	NC_015510	CTG	2	6	5619851	5619856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14084	NC_015510	AT	4	8	5619889	5619896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14086	NC_015510	T	6	6	5619955	5619960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14087	NC_015510	TTTGA	2	10	5620062	5620071	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14093	NC_015510	TGTT	2	8	5620306	5620313	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_015510	AAT	2	6	5620317	5620322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14097	NC_015510	ATT	2	6	5620449	5620454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14098	NC_015510	G	7	7	5620524	5620530	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14099	NC_015510	T	7	7	5620538	5620544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_015510	CAA	2	6	5620552	5620557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14101	NC_015510	TGC	2	6	5620579	5620584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14103	NC_015510	TAT	2	6	5623571	5623576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_015510	AAT	2	6	5623603	5623608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14107	NC_015510	AAAAT	2	10	5628544	5628553	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_015510	TTC	2	6	5628582	5628587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14109	NC_015510	TG	3	6	5628631	5628636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_015510	TGAT	2	8	5628638	5628645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14115	NC_015510	CTCTC	2	10	5632860	5632869	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
14116	NC_015510	CTT	2	6	5632885	5632890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_015510	TTC	2	6	5632933	5632938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_015510	A	7	7	5632950	5632956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14119	NC_015510	GCT	2	6	5633011	5633016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14121	NC_015510	GTG	2	6	5635494	5635499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14122	NC_015510	GTT	2	6	5635593	5635598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_015510	TTTCC	2	10	5635611	5635620	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14124	NC_015510	A	8	8	5635714	5635721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14125	NC_015510	GAAT	2	8	5635768	5635775	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_015510	ACTAA	2	10	5636379	5636388	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
14127	NC_015510	GAA	2	6	5636389	5636394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14128	NC_015510	CGA	2	6	5636444	5636449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14130	NC_015510	T	6	6	5636530	5636535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_015510	ATC	2	6	5638231	5638236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14132	NC_015510	CTT	2	6	5638660	5638665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14133	NC_015510	GTA	2	6	5638705	5638710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14134	NC_015510	GAC	2	6	5638742	5638747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14135	NC_015510	CAA	2	6	5638760	5638765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14136	NC_015510	CAAAA	2	10	5638770	5638779	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14137	NC_015510	ATT	2	6	5639280	5639285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14139	NC_015510	T	7	7	5641447	5641453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14140	NC_015510	ATC	2	6	5641475	5641480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14141	NC_015510	TCA	2	6	5641484	5641489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14142	NC_015510	T	6	6	5641549	5641554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14143	NC_015510	ATTT	2	8	5641704	5641711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14144	NC_015510	T	6	6	5641813	5641818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14145	NC_015510	T	6	6	5641852	5641857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14151	NC_015510	GTA	2	6	5642534	5642539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14156	NC_015510	ACTT	2	8	5645732	5645739	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14157	NC_015510	TATT	2	8	5646363	5646370	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14163	NC_015510	T	6	6	5646573	5646578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14253	NC_015510	TCAA	2	8	5678105	5678112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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