MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Hippea maritima DSM 10411 chromosome

Total Repeats: 3064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015318	TAATA	2	10	13	22	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015318	AGAA	2	8	1408	1415	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015318	A	7	7	1417	1423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015318	TTA	3	9	1448	1456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015318	A	6	6	1463	1468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015318	A	6	6	1475	1480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015318	AGG	2	6	1482	1487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015318	TAA	2	6	29980	29985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015318	TTA	2	6	30019	30024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015318	A	8	8	41099	41106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015318	AAG	2	6	41118	41123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015318	AT	3	6	41148	41153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015318	AGG	2	6	45985	45990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015318	AGG	2	6	46544	46549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015318	CTC	2	6	46559	46564	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_015318	AAGC	2	8	51016	51023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_015318	CAAC	2	8	51028	51035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_015318	GCCA	2	8	51038	51045	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_015318	CCT	2	6	51065	51070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_015318	A	6	6	51072	51077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015318	T	6	6	51123	51128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015318	TA	4	8	51151	51158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015318	A	6	6	51173	51178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015318	AAT	2	6	51184	51189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015318	ATTTA	2	10	51219	51228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015318	TA	3	6	51264	51269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015318	GTT	2	6	57439	57444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015318	TATTT	2	10	57487	57496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015318	CT	3	6	57948	57953	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_015318	TAA	2	6	58813	58818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015318	TCT	2	6	63002	63007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_015318	CCCG	2	8	63027	63034	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_015318	CAG	2	6	63072	63077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_015318	CGC	2	6	63088	63093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015318	TACC	2	8	63095	63102	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015318	CGGGT	2	10	63111	63120	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015318	GCTT	2	8	64084	64091	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_015318	TTTA	2	8	64109	64116	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015318	CATT	2	8	64138	64145	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015318	AGC	2	6	64168	64173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015318	CTT	2	6	64195	64200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_015318	AGC	2	6	64208	64213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015318	TTAA	2	8	64215	64222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015318	AAT	2	6	64257	64262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015318	TAT	2	6	64276	64281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015318	ACC	2	6	64289	64294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_015318	ACT	2	6	64330	64335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015318	TGTC	2	8	64381	64388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_015318	A	6	6	64432	64437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015318	TTA	2	6	64486	64491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015318	A	6	6	64505	64510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015318	CCG	2	6	64517	64522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_015318	CTA	2	6	64545	64550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015318	CAC	2	6	64557	64562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_015318	AAT	2	6	64590	64595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015318	AGG	2	6	64625	64630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015318	TGT	2	6	64635	64640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015318	CA	3	6	64645	64650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015318	CAGA	2	8	64674	64681	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_015318	AGA	2	6	64705	64710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015318	AGG	2	6	64733	64738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015318	AAG	2	6	64758	64763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015318	TA	3	6	64795	64800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015318	AG	3	6	64855	64860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015318	AAT	2	6	64962	64967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015318	AGGTC	2	10	65020	65029	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_015318	AGC	2	6	65073	65078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015318	ACT	2	6	65144	65149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015318	TGG	2	6	65151	65156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015318	TTGT	2	8	65269	65276	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015318	GAA	2	6	65343	65348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015318	TCT	2	6	65409	65414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015318	TCT	2	6	65426	65431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015318	ACA	2	6	65450	65455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_015318	CAA	3	9	65465	65473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015318	AGA	2	6	65476	65481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015318	GATATC	2	12	65611	65622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_015318	TAC	2	6	65626	65631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015318	CTTG	2	8	65658	65665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_015318	CTC	2	6	67480	67485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_015318	TAG	2	6	67543	67548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015318	CAATC	2	10	67596	67605	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
83	NC_015318	AAG	2	6	67626	67631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015318	TAT	2	6	67646	67651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015318	TTA	2	6	67672	67677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015318	AGG	2	6	67684	67689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015318	ATG	2	6	67699	67704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015318	CAT	2	6	67751	67756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015318	AGA	2	6	67789	67794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015318	A	6	6	67794	67799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015318	GGAA	2	8	67845	67852	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015318	TA	3	6	67931	67936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015318	TAG	2	6	67939	67944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015318	GGT	2	6	67946	67951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015318	TG	3	6	67957	67962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015318	TA	3	6	68003	68008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015318	ATA	2	6	68014	68019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015318	TTC	2	6	68038	68043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_015318	ACA	2	6	68374	68379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015318	TA	3	6	68405	68410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015318	AT	3	6	68455	68460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015318	ATG	2	6	68484	68489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015318	A	6	6	68510	68515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015318	CAAATC	2	12	68525	68536	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_015318	TTCTT	2	10	68658	68667	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_015318	CAT	2	6	68691	68696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015318	GTT	2	6	68703	68708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015318	A	6	6	68714	68719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015318	CTT	2	6	68765	68770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015318	CTT	2	6	69267	69272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015318	T	6	6	69280	69285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015318	CTT	2	6	69544	69549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015318	T	6	6	69559	69564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015318	GGT	2	6	69667	69672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015318	AAC	2	6	69699	69704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_015318	GCC	2	6	69706	69711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_015318	TCT	2	6	69734	69739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_015318	TA	3	6	69745	69750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015318	A	6	6	69750	69755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015318	A	6	6	69846	69851	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015318	CAACT	2	10	75108	75117	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_015318	CTTTT	2	10	75129	75138	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_015318	T	7	7	75135	75141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015318	GTA	2	6	81410	81415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015318	TTTA	2	8	83613	83620	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015318	CATC	2	8	83634	83641	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_015318	AAT	2	6	83645	83650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015318	TTTTA	3	15	83687	83701	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015318	GGT	2	6	83707	83712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015318	T	7	7	84319	84325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015318	TTA	2	6	84341	84346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015318	T	6	6	84352	84357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015318	GGA	2	6	84360	84365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015318	CCT	2	6	91022	91027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_015318	TA	4	8	91048	91055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015318	A	6	6	91064	91069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015318	GTT	2	6	91092	91097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015318	AGG	2	6	94841	94846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015318	T	6	6	97155	97160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015318	AGG	2	6	97161	97166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015318	T	7	7	98206	98212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015318	T	6	6	104543	104548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015318	TAA	2	6	104563	104568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015318	TTA	2	6	104570	104575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015318	TTAT	2	8	107509	107516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015318	ATT	2	6	108526	108531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015318	T	6	6	108627	108632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015318	GGA	2	6	108652	108657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_015318	T	6	6	111872	111877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_015318	T	6	6	114096	114101	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_015318	TCT	2	6	188679	188684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
293	NC_015318	CCT	2	6	190568	190573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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430	NC_015318	CCA	2	6	258417	258422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
431	NC_015318	CCA	2	6	258495	258500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
432	NC_015318	A	6	6	258503	258508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_015318	AAAT	2	8	258575	258582	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
434	NC_015318	CTA	2	6	258632	258637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_015318	GGA	2	6	258824	258829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
437	NC_015318	GCG	2	6	258858	258863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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439	NC_015318	ACC	2	6	259108	259113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
440	NC_015318	AT	3	6	259531	259536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_015318	CGG	2	6	259561	259566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_015318	CCA	2	6	259595	259600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
443	NC_015318	AGG	2	6	259738	259743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015318	AGG	2	6	259763	259768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
445	NC_015318	AGC	2	6	259779	259784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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447	NC_015318	AGC	2	6	259866	259871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
448	NC_015318	AG	3	6	259984	259989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
449	NC_015318	CT	3	6	259997	260002	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
450	NC_015318	GTCC	2	8	260122	260129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
451	NC_015318	G	6	6	260133	260138	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
452	NC_015318	GTAG	2	8	260188	260195	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015318	CTG	2	6	260271	260276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
454	NC_015318	AGC	2	6	260461	260466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
455	NC_015318	GAG	2	6	260582	260587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
456	NC_015318	CGG	2	6	260629	260634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
457	NC_015318	GGTTA	2	10	260821	260830	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
458	NC_015318	ACC	2	6	260899	260904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
459	NC_015318	CAC	2	6	260928	260933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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461	NC_015318	TGG	2	6	260959	260964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
462	NC_015318	CCT	2	6	260986	260991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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464	NC_015318	CGT	2	6	261040	261045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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466	NC_015318	GGT	2	6	261122	261127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
467	NC_015318	CGG	2	6	261209	261214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
468	NC_015318	TCA	2	6	261237	261242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
469	NC_015318	CGT	2	6	261317	261322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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472	NC_015318	ATGA	2	8	261575	261582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
473	NC_015318	GAA	2	6	261674	261679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
474	NC_015318	AGG	2	6	261798	261803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
475	NC_015318	G	6	6	262072	262077	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
476	NC_015318	CTTA	2	8	262090	262097	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_015318	AATA	2	8	264109	264116	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_015318	TA	4	8	264115	264122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_015318	GTG	2	6	264144	264149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_015318	TA	3	6	265443	265448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_015318	TAAA	2	8	265456	265463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_015318	ACTTT	2	10	265476	265485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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500	NC_015318	GAG	2	6	294119	294124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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