MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR03

Total Repeats: 646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014736	TCG	2	6	157658	157663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_014736	ACC	2	6	157667	157672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_014736	CTAG	2	8	157882	157889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
504	NC_014736	TGG	2	6	157968	157973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014736	GTG	2	6	158073	158078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014736	GCT	2	6	158144	158149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_014736	TCC	2	6	158177	158182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_014736	AC	3	6	158193	158198	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_014736	TCC	2	6	158235	158240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_014736	GT	3	6	158244	158249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014736	ATG	2	6	158268	158273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014736	AGT	2	6	158286	158291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014736	TGG	2	6	158307	158312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014736	GTCG	2	8	158335	158342	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
515	NC_014736	TAC	2	6	159695	159700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014736	TCA	2	6	159713	159718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_014736	GAC	2	6	161142	161147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_014736	TCG	2	6	161260	161265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_014736	TCTTG	2	10	161273	161282	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_014736	TCA	2	6	161286	161291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_014736	AGGA	2	8	161310	161317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014736	AAC	2	6	161339	161344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_014736	T	6	6	161957	161962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014736	ATT	2	6	163957	163962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014736	ACCG	2	8	164023	164030	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
526	NC_014736	AAC	2	6	165866	165871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014736	TCAT	2	8	165882	165889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_014736	TAC	2	6	165904	165909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_014736	ACT	2	6	166016	166021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_014736	ACAAG	2	10	168077	168086	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
531	NC_014736	TCA	2	6	170654	170659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_014736	GAAT	2	8	170735	170742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014736	CA	3	6	170749	170754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_014736	CCG	2	6	170755	170760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_014736	GAA	2	6	171026	171031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014736	GTT	2	6	171181	171186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014736	GTT	2	6	171317	171322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014736	AGT	2	6	171353	171358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014736	CTTGT	2	10	172255	172264	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
540	NC_014736	TGCA	2	8	172265	172272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_014736	CTGT	2	8	172277	172284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_014736	AAG	2	6	172361	172366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014736	GCTCG	2	10	172382	172391	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
544	NC_014736	CAG	2	6	172461	172466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_014736	CTT	2	6	173029	173034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_014736	TTC	2	6	173071	173076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_014736	CCG	2	6	173101	173106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_014736	AGT	2	6	173301	173306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014736	ACG	2	6	174335	174340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_014736	GCG	2	6	174351	174356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_014736	TGC	2	6	174392	174397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_014736	CG	3	6	175619	175624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
553	NC_014736	GTC	2	6	175626	175631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_014736	TGC	2	6	175634	175639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014736	CT	3	6	175666	175671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
556	NC_014736	CGT	2	6	175717	175722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_014736	CGA	2	6	175819	175824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_014736	T	6	6	177008	177013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014736	CCG	2	6	177047	177052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_014736	GTC	2	6	177157	177162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_014736	TC	3	6	177165	177170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_014736	TCG	2	6	178715	178720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_014736	ATGAGT	2	12	178728	178739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014736	TCC	2	6	179096	179101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_014736	ACG	2	6	179200	179205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014736	TAC	2	6	180662	180667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014736	TG	3	6	180708	180713	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014736	ATCT	2	8	180715	180722	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_014736	T	6	6	180725	180730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014736	GAGT	2	8	180736	180743	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014736	GAT	2	6	180967	180972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014736	CTA	2	6	181020	181025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014736	ACG	2	6	182443	182448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_014736	CAG	2	6	182854	182859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014736	CTG	2	6	182887	182892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_014736	AAT	2	6	182893	182898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014736	GGT	2	6	183001	183006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014736	TGT	2	6	183037	183042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014736	CTGC	2	8	183171	183178	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
580	NC_014736	TA	3	6	184419	184424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014736	C	6	6	184573	184578	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
582	NC_014736	CAG	2	6	185624	185629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_014736	ATTG	2	8	185691	185698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014736	GAC	2	6	185747	185752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_014736	GTAAT	2	10	185792	185801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014736	TCA	2	6	185817	185822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_014736	T	6	6	185829	185834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014736	TA	3	6	187296	187301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014736	TTA	2	6	187391	187396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014736	ATTG	2	8	187410	187417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014736	CG	3	6	188310	188315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_014736	AAT	2	6	188353	188358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014736	TG	3	6	188534	188539	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014736	TGTAC	2	10	188547	188556	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
595	NC_014736	GCC	2	6	188612	188617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_014736	TAG	2	6	188667	188672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014736	TGCC	2	8	188752	188759	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_014736	TCG	2	6	188774	188779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_014736	A	6	6	188808	188813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014736	AGAC	2	8	190449	190456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_014736	AGT	2	6	190554	190559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014736	CTG	2	6	190594	190599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_014736	TGGC	2	8	190644	190651	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
604	NC_014736	AT	3	6	190720	190725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014736	TTC	2	6	190755	190760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_014736	ACCG	2	8	190762	190769	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
607	NC_014736	TCCC	2	8	191718	191725	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
608	NC_014736	ACT	2	6	191744	191749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_014736	GTT	2	6	191762	191767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014736	CAC	2	6	196111	196116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_014736	TA	3	6	197542	197547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014736	TCC	2	6	198799	198804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_014736	ACG	2	6	198848	198853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_014736	CTT	2	6	198883	198888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_014736	AC	3	6	198892	198897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
616	NC_014736	TAG	2	6	201860	201865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014736	TCTT	2	8	201998	202005	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
618	NC_014736	TTA	2	6	203120	203125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014736	TCC	2	6	203195	203200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_014736	GT	3	6	203247	203252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014736	CAG	2	6	203700	203705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014736	TAG	2	6	203726	203731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014736	TCT	2	6	203763	203768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_014736	TGT	2	6	203777	203782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014736	AGCGCT	2	12	203783	203794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_014736	GATT	2	8	203841	203848	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014736	AAC	2	6	203991	203996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_014736	GTC	2	6	204041	204046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_014736	CGTA	2	8	204081	204088	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_014736	TCAAT	2	10	204140	204149	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
631	NC_014736	AGTT	2	8	204198	204205	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014736	ACGG	2	8	204233	204240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
633	NC_014736	TCT	2	6	204261	204266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_014736	TA	3	6	204398	204403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014736	AT	3	6	204421	204426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014736	TTG	2	6	204436	204441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014736	AGATAT	2	12	204466	204477	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014736	TGGT	2	8	204492	204499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014736	TACGG	2	10	204554	204563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
640	NC_014736	AT	3	6	204595	204600	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_014736	GTT	2	6	204755	204760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
642	NC_014736	CGA	2	6	208145	208150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_014736	ATA	2	6	208507	208512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
644	NC_014736	GTG	2	6	208570	208575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
645	NC_014736	CCT	2	6	208582	208587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
646	NC_014736	GTT	2	6	208595	208600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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