MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR01

Total Repeats: 1139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014735	ATG	2	6	320774	320779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014735	ATG	2	6	320863	320868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014735	CGA	2	6	320896	320901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_014735	TTTTG	2	10	320927	320936	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014735	ACTG	2	8	321821	321828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_014735	CGA	2	6	321853	321858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_014735	ATC	2	6	321863	321868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_014735	GTG	3	9	321873	321881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014735	TCA	2	6	321919	321924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_014735	G	6	6	321975	321980	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014735	TTATA	2	10	322079	322088	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014735	CTC	2	6	322094	322099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1013	NC_014735	TCT	2	6	322107	322112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014735	TGGTGA	2	12	322125	322136	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014735	ATTA	2	8	322214	322221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014735	ACAA	2	8	322263	322270	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_014735	ATT	2	6	322305	322310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014735	TCT	2	6	322316	322321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014735	ACG	2	6	322371	322376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014735	CTG	2	6	322392	322397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_014735	AT	3	6	322482	322487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014735	AT	3	6	323314	323319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014735	CAA	2	6	323337	323342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_014735	TAA	2	6	323359	323364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014735	GCT	2	6	323384	323389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_014735	ACA	2	6	330799	330804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014735	GCAA	2	8	331250	331257	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_014735	CA	3	6	331279	331284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1029	NC_014735	ACC	2	6	331285	331290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_014735	AGT	2	6	332144	332149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014735	AGG	2	6	332194	332199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014735	GAA	2	6	332202	332207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014735	ACG	2	6	333971	333976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_014735	TG	3	6	334127	334132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014735	CGA	2	6	336041	336046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_014735	CCG	2	6	337137	337142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_014735	GCTC	2	8	337149	337156	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_014735	CAT	2	6	338715	338720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_014735	TAC	2	6	338756	338761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014735	AG	3	6	338764	338769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014735	ATAA	2	8	338781	338788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014735	ATA	2	6	338792	338797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014735	ATA	2	6	338801	338806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014735	ATCT	2	8	338902	338909	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_014735	GTC	2	6	342327	342332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_014735	GCA	2	6	342394	342399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_014735	A	6	6	342512	342517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014735	CGAA	2	8	342554	342561	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1049	NC_014735	CTA	2	6	343135	343140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014735	AT	3	6	343147	343152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_014735	AG	3	6	343182	343187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014735	CAGT	2	8	343261	343268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_014735	AG	3	6	344157	344162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014735	CAA	2	6	344191	344196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_014735	GTG	2	6	344246	344251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014735	GCC	2	6	344258	344263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_014735	GCG	2	6	344276	344281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014735	CG	3	6	344280	344285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_014735	GTG	2	6	344305	344310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014735	CCA	2	6	344313	344318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_014735	GTG	2	6	344323	344328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014735	ACA	2	6	344331	344336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_014735	TAG	2	6	344341	344346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014735	ACA	2	6	344351	344356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_014735	CAG	2	6	344388	344393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014735	AAC	2	6	344394	344399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_014735	AACG	2	8	344438	344445	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_014735	CCG	2	6	347144	347149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_014735	GAC	2	6	347152	347157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_014735	CCA	3	9	347160	347168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_014735	ACC	2	6	347182	347187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_014735	GCAA	2	8	348081	348088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1073	NC_014735	AACG	2	8	348121	348128	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_014735	CCA	2	6	349345	349350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1075	NC_014735	AT	3	6	349397	349402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014735	AATA	2	8	349413	349420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014735	GGT	2	6	349449	349454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_014735	CGGAG	2	10	349483	349492	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1079	NC_014735	ATC	2	6	353744	353749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_014735	CGG	2	6	353761	353766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_014735	GAC	2	6	353775	353780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014735	AGA	2	6	353813	353818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_014735	TAA	2	6	353819	353824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014735	GCT	2	6	354755	354760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_014735	TGG	2	6	354900	354905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014735	TTG	2	6	354987	354992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014735	CAA	2	6	355036	355041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_014735	CAA	2	6	355044	355049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_014735	AGG	2	6	355084	355089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014735	GGA	2	6	355104	355109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014735	GA	3	6	355142	355147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014735	CTT	2	6	355183	355188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_014735	CCT	2	6	355658	355663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_014735	GAAC	2	8	355718	355725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_014735	GA	3	6	355901	355906	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014735	TCGCG	2	10	356039	356048	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1097	NC_014735	TA	3	6	356191	356196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014735	AT	3	6	356201	356206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014735	TAG	3	9	356225	356233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014735	AC	3	6	356298	356303	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_014735	AGA	2	6	356375	356380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014735	GCA	2	6	356383	356388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_014735	CA	3	6	356420	356425	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1104	NC_014735	TCC	2	6	356436	356441	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_014735	GGT	2	6	356489	356494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014735	GAAA	2	8	356613	356620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014735	ATAG	2	8	356630	356637	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014735	CTG	2	6	356719	356724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_014735	G	6	6	356745	356750	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014735	AT	3	6	356760	356765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014735	TGGC	2	8	356783	356790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_014735	AATGA	2	10	356851	356860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014735	CGG	2	6	356953	356958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014735	TC	3	6	356983	356988	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_014735	ATC	2	6	356997	357002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_014735	CA	3	6	357032	357037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_014735	GGC	2	6	357060	357065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_014735	TTTA	2	8	357157	357164	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014735	GTA	2	6	357171	357176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014735	TTCT	2	8	357216	357223	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_014735	GA	3	6	357294	357299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014735	GA	3	6	357337	357342	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014735	AGG	2	6	357372	357377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014735	TC	3	6	357860	357865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_014735	CT	3	6	357885	357890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_014735	GAA	2	6	359257	359262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014735	TCG	2	6	359328	359333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_014735	ACCA	2	8	359379	359386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_014735	TTC	2	6	359413	359418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_014735	ACA	2	6	359479	359484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_014735	ATG	2	6	359507	359512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014735	GT	3	6	359525	359530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014735	GACC	2	8	359549	359556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_014735	ATC	2	6	359576	359581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_014735	GTA	2	6	360577	360582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014735	TGG	2	6	360611	360616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_014735	CAA	2	6	360617	360622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1138	NC_014735	ATC	2	6	360630	360635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_014735	GAT	2	6	362148	362153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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