MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 1273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014731	AG	3	6	7	12	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014731	CAG	2	6	14	19	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014731	GCC	2	6	64	69	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014731	TAGT	2	8	132	139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014731	TAAA	2	8	193	200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014731	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014731	CGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014731	CCG	2	6	1099	1104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014731	TC	3	6	1135	1140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014731	CCATC	2	10	1266	1275	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014731	GCA	2	6	1282	1287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014731	AGCA	3	12	1284	1295	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014731	GGC	2	6	1296	1301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014731	AGT	2	6	1309	1314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014731	CTTT	2	8	1374	1381	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014731	TTCG	2	8	1559	1566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014731	GTG	2	6	1593	1598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014731	GA	3	6	3643	3648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014731	AAC	2	6	5975	5980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014731	TCG	2	6	6213	6218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014731	GAC	2	6	6260	6265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014731	ATA	2	6	7947	7952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014731	CA	3	6	8020	8025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014731	ACC	2	6	8062	8067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_014731	CAGT	2	8	8306	8313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014731	AAG	2	6	8324	8329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014731	GAA	2	6	8634	8639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014731	TGAC	2	8	8646	8653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014731	AC	3	6	8652	8657	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014731	CGA	2	6	8692	8697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014731	CAA	2	6	8700	8705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014731	TGG	2	6	8751	8756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014731	TTCT	2	8	11083	11090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014731	AGAA	2	8	11257	11264	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014731	A	6	6	11565	11570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014731	GCC	2	6	11596	11601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014731	GC	3	6	11648	11653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014731	TGA	2	6	11663	11668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014731	TGG	2	6	11716	11721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014731	GT	3	6	11723	11728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014731	GAA	2	6	11758	11763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014731	CCG	2	6	11766	11771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014731	CGC	2	6	11772	11777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_014731	GAG	2	6	11857	11862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014731	GCC	2	6	11922	11927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014731	GTC	3	9	11982	11990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014731	ACGA	2	8	12057	12064	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014731	TCG	2	6	12112	12117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014731	GA	3	6	12132	12137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014731	AG	3	6	12194	12199	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014731	A	8	8	12219	12226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014731	GAA	2	6	12284	12289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014731	ACG	2	6	12339	12344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014731	CAG	2	6	12392	12397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014731	CCG	2	6	12522	12527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014731	GAA	2	6	14344	14349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014731	GTG	2	6	14388	14393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014731	GAA	2	6	14564	14569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014731	GA	3	6	14644	14649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014731	TTC	2	6	14661	14666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014731	GGCT	2	8	14718	14725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014731	GCC	2	6	14740	14745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014731	CGC	2	6	14817	14822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014731	GTT	2	6	14859	14864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014731	GAC	2	6	14867	14872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014731	CGG	2	6	14885	14890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014731	TC	3	6	14925	14930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_014731	CT	3	6	14974	14979	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014731	GTGG	2	8	15078	15085	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014731	GAG	2	6	15181	15186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014731	ACTA	2	8	15190	15197	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014731	ATAG	2	8	15253	15260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014731	GAT	2	6	15317	15322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014731	ACT	2	6	15333	15338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014731	GTG	2	6	15357	15362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014731	TCG	2	6	15380	15385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014731	GA	3	6	15407	15412	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014731	TGC	2	6	15482	15487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014731	ACG	2	6	15538	15543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014731	CGATC	2	10	15554	15563	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014731	GTC	2	6	15678	15683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014731	CTT	2	6	15804	15809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014731	TGT	2	6	15820	15825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014731	CAAC	2	8	16098	16105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014731	CCA	2	6	16221	16226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014731	CCG	2	6	16257	16262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014731	AGCG	2	8	16311	16318	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014731	TCGA	2	8	16669	16676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014731	AAT	2	6	16934	16939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014731	AACT	2	8	17661	17668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014731	GCC	2	6	17710	17715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014731	CAA	2	6	17726	17731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014731	ACT	2	6	18346	18351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014731	GAC	2	6	18389	18394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014731	GAA	2	6	18537	18542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014731	GGC	2	6	20147	20152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014731	CGC	2	6	20207	20212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014731	GAC	2	6	20223	20228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014731	CAG	2	6	20339	20344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014731	TCC	2	6	20347	20352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014731	CGA	2	6	20366	20371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014731	ACG	2	6	27707	27712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014731	ACAGC	2	10	27740	27749	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014731	AGC	2	6	27756	27761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014731	CGA	2	6	27767	27772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014731	CTG	2	6	27818	27823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014731	GTTT	2	8	27876	27883	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014731	T	6	6	27916	27921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014731	CTT	2	6	27923	27928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014731	AATC	2	8	28048	28055	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014731	GTA	2	6	29143	29148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014731	TC	3	6	29174	29179	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014731	T	6	6	29241	29246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014731	GTAG	2	8	29368	29375	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014731	AC	3	6	29438	29443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014731	ACG	2	6	29455	29460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014731	GCT	2	6	29461	29466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014731	CAACA	2	10	29484	29493	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014731	CTC	2	6	29508	29513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014731	AGC	3	9	29532	29540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014731	GA	3	6	29604	29609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014731	CTG	2	6	29618	29623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014731	AGG	2	6	29742	29747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014731	AAG	2	6	29820	29825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014731	CAG	2	6	29833	29838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014731	GCAG	2	8	29852	29859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014731	ACA	2	6	29868	29873	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014731	GAT	2	6	29898	29903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014731	GAC	2	6	29914	29919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014731	AGA	2	6	29938	29943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014731	CGA	2	6	30175	30180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014731	AG	3	6	30210	30215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014731	CAC	2	6	30225	30230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014731	AGC	2	6	30311	30316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014731	AGC	2	6	30335	30340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014731	GACG	2	8	30404	30411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014731	TA	3	6	31638	31643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014731	GAC	2	6	31665	31670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014731	GTC	2	6	31739	31744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014731	CAC	2	6	33015	33020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_014731	ACG	2	6	33066	33071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014731	GCG	2	6	33100	33105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014731	AGGA	2	8	33138	33145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014731	TAC	2	6	34420	34425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014731	AAT	2	6	35711	35716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014731	AGT	2	6	35853	35858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_014731	GGC	2	6	83740	83745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_014731	CGGA	2	8	86060	86067	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
292	NC_014731	ATC	2	6	86102	86107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_014731	CGG	2	6	88152	88157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
295	NC_014731	AT	3	6	88186	88191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_014731	GAAA	2	8	88487	88494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
300	NC_014731	TG	3	6	88505	88510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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313	NC_014731	CCA	2	6	93734	93739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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338	NC_014731	AAC	2	6	97091	97096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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415	NC_014731	GA	4	8	122579	122586	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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417	NC_014731	TCGAA	2	10	122730	122739	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
418	NC_014731	GA	4	8	122882	122889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
419	NC_014731	TATC	2	8	122911	122918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
420	NC_014731	GATA	2	8	122953	122960	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
421	NC_014731	TAT	2	6	123011	123016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_014731	TCT	2	6	123028	123033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_014731	AGA	2	6	123043	123048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_014731	AT	3	6	123057	123062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_014731	CCA	2	6	123102	123107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_014731	A	6	6	123163	123168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
427	NC_014731	TAGAT	2	10	123203	123212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
428	NC_014731	TCG	2	6	123287	123292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
429	NC_014731	TAG	2	6	123293	123298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
430	NC_014731	ATG	2	6	123329	123334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
431	NC_014731	GTC	2	6	123389	123394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
432	NC_014731	AG	3	6	123472	123477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
433	NC_014731	AGA	2	6	123497	123502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
434	NC_014731	TC	3	6	123528	123533	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
435	NC_014731	CAG	2	6	123571	123576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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438	NC_014731	TAG	2	6	123624	123629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
439	NC_014731	TAG	2	6	123641	123646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_014731	TCG	2	6	123885	123890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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443	NC_014731	GTG	2	6	124270	124275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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448	NC_014731	AAG	2	6	126236	126241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_014731	CCTA	2	8	126265	126272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
452	NC_014731	CCTT	2	8	126278	126285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
453	NC_014731	CA	3	6	126307	126312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
454	NC_014731	AT	3	6	126321	126326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_014731	CAA	2	6	126338	126343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
456	NC_014731	AGTCCA	2	12	126639	126650	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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458	NC_014731	GGT	2	6	126740	126745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_014731	CGA	2	6	126772	126777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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463	NC_014731	AGA	2	6	127075	127080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_014731	CGC	2	6	128026	128031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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470	NC_014731	CCA	2	6	128779	128784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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472	NC_014731	CTG	2	6	128865	128870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
473	NC_014731	ATT	2	6	128898	128903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_014731	GAC	2	6	128938	128943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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476	NC_014731	CTGT	2	8	129117	129124	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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