MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 plasmid pHBOR02

Total Repeats: 1273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014731	TTAT	2	8	140236	140243	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014731	AGT	2	6	140252	140257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014731	GAT	2	6	141377	141382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014731	GGC	2	6	141392	141397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_014731	GTT	2	6	141436	141441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014731	GTG	2	6	141480	141485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014731	CAA	2	6	141598	141603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014731	ATC	2	6	141608	141613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_014731	GAA	2	6	141639	141644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014731	CGC	2	6	141655	141660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_014731	GTCTC	3	15	141673	141687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
512	NC_014731	GTCTT	2	10	141688	141697	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
513	NC_014731	GTCTC	2	10	141698	141707	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
514	NC_014731	TAA	2	6	142538	142543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014731	CGTCG	2	10	142851	142860	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
516	NC_014731	TGGA	2	8	142930	142937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014731	GACGA	2	10	142970	142979	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
518	NC_014731	GTC	2	6	142985	142990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_014731	GTGA	2	8	143037	143044	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014731	ATT	2	6	144452	144457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014731	TAA	2	6	144475	144480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014731	GGC	2	6	144496	144501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_014731	TCG	2	6	146015	146020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_014731	CA	3	6	146069	146074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
525	NC_014731	ATC	2	6	146113	146118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014731	ACA	2	6	146199	146204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014731	CG	3	6	146245	146250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_014731	CG	3	6	146257	146262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_014731	AG	3	6	146381	146386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014731	AGG	2	6	146400	146405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014731	GAC	2	6	146406	146411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_014731	A	7	7	146864	146870	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014731	ACCT	2	8	146920	146927	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_014731	CCG	2	6	146939	146944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_014731	CCCG	2	8	147112	147119	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
536	NC_014731	GCT	2	6	147123	147128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_014731	CTGG	2	8	147153	147160	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
538	NC_014731	TC	4	8	147196	147203	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_014731	CTT	2	6	147587	147592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_014731	TC	3	6	147645	147650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_014731	TTC	2	6	147671	147676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_014731	ATT	2	6	147924	147929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014731	CAG	2	6	147956	147961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014731	AGG	2	6	147974	147979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014731	TGG	2	6	148029	148034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014731	TCAC	2	8	148045	148052	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_014731	ACA	2	6	148076	148081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_014731	TAG	2	6	148523	148528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014731	A	6	6	148622	148627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014731	ACA	2	6	148629	148634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_014731	AGT	2	6	148680	148685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014731	AG	3	6	148694	148699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014731	GTC	2	6	148763	148768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_014731	ACT	2	6	148798	148803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014731	TTC	2	6	148878	148883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_014731	TTCG	2	8	148890	148897	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
557	NC_014731	GAC	2	6	148933	148938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_014731	CCA	2	6	148955	148960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_014731	GA	3	6	148979	148984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014731	GAA	2	6	149006	149011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014731	GTC	2	6	149035	149040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_014731	AAT	2	6	149043	149048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014731	TCG	2	6	149149	149154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_014731	CAGC	2	8	149181	149188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
565	NC_014731	AT	3	6	149191	149196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014731	GA	3	6	149231	149236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014731	TGG	2	6	149247	149252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014731	AAT	2	6	149262	149267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014731	AACT	2	8	149986	149993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_014731	T	6	6	150112	150117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014731	TC	3	6	150147	150152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
572	NC_014731	CTG	3	9	150260	150268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014731	TCAG	2	8	150284	150291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
574	NC_014731	GCT	2	6	150334	150339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014731	GAC	2	6	150352	150357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_014731	AGA	2	6	150414	150419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014731	CGA	2	6	150428	150433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_014731	GT	3	6	150475	150480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014731	TC	3	6	151646	151651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
580	NC_014731	CAA	2	6	151714	151719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_014731	TTG	2	6	151753	151758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014731	ACA	2	6	152987	152992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_014731	CAC	2	6	153044	153049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_014731	GAG	2	6	153100	153105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014731	AG	3	6	153104	153109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014731	GA	3	6	153132	153137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014731	GAGAG	2	10	153140	153149	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014731	GA	3	6	153174	153179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014731	GAGAG	2	10	153182	153191	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014731	GAG	2	6	153221	153226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014731	A	6	6	153284	153289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014731	CGGT	2	8	155630	155637	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
593	NC_014731	AGA	2	6	155743	155748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014731	TCTG	2	8	156467	156474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
595	NC_014731	CGT	2	6	156485	156490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_014731	TAC	2	6	156523	156528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_014731	AT	3	6	157229	157234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014731	CGA	2	6	157299	157304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_014731	CA	3	6	157982	157987	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_014731	TCGG	2	8	159420	159427	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
601	NC_014731	TCA	2	6	159471	159476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_014731	GCA	2	6	160617	160622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_014731	ACG	2	6	163117	163122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_014731	ACG	2	6	163139	163144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_014731	ACG	2	6	163161	163166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_014731	ACG	2	6	163183	163188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_014731	ACG	2	6	163205	163210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_014731	ACG	2	6	163224	163229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_014731	GGA	2	6	164439	164444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014731	GCCA	2	8	164460	164467	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
611	NC_014731	CACGGT	2	12	165733	165744	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_014731	AGTT	2	8	165813	165820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014731	GTT	2	6	165829	165834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014731	AGTT	2	8	165837	165844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014731	AGTT	2	8	165861	165868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014731	AGTT	2	8	165885	165892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014731	AGTT	2	8	165909	165916	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014731	GTT	2	6	165925	165930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014731	AGTT	2	8	165957	165964	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014731	GCG	2	6	166012	166017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_014731	TGCTG	2	10	166125	166134	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
622	NC_014731	ATC	2	6	167820	167825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_014731	ACACCC	2	12	168387	168398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_014731	CGT	2	6	168407	168412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_014731	CGT	2	6	168489	168494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_014731	AC	3	6	168519	168524	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_014731	CGT	2	6	168539	168544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_014731	G	6	6	168557	168562	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014731	AGCT	2	8	168583	168590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
630	NC_014731	TAT	2	6	168646	168651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014731	GTT	2	6	168656	168661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014731	AGT	2	6	168665	168670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014731	GAA	2	6	168793	168798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014731	GTGGG	2	10	168809	168818	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014731	AGG	2	6	168826	168831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014731	ACG	2	6	168875	168880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_014731	GTGG	2	8	168891	168898	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014731	ACT	2	6	168922	168927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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