MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 7383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014729	ACA	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014729	CCG	2	6	1992	1997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014729	GTC	2	6	4000	4005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014729	CTTT	2	8	4579	4586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014729	GACG	2	8	4588	4595	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014729	GTC	2	6	4611	4616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014729	GCGA	2	8	6033	6040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014729	TC	3	6	6905	6910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014729	CGC	2	6	6951	6956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_014729	CGCGC	2	10	7526	7535	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014729	G	6	6	7573	7578	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014729	GTC	2	6	7587	7592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014729	TGG	2	6	7635	7640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014729	GCC	2	6	7700	7705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014729	AGCGA	2	10	9047	9056	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014729	CGA	2	6	9095	9100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014729	GCC	2	6	10440	10445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_014729	CA	3	6	10630	10635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014729	CT	3	6	10662	10667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014729	GT	3	6	10683	10688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014729	CTGT	2	8	10728	10735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014729	CG	3	6	10746	10751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014729	CGA	2	6	10776	10781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014729	CGA	2	6	10788	10793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014729	CAAT	2	8	10796	10803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014729	TC	3	6	10815	10820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014729	TCC	2	6	10828	10833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_014729	GAC	2	6	11790	11795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_014729	CTT	2	6	11806	11811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014729	CTGA	2	8	12610	12617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014729	CT	3	6	12627	12632	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014729	CG	3	6	12729	12734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014729	ATT	2	6	12790	12795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014729	AG	3	6	12801	12806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014729	ATAC	2	8	12917	12924	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014729	GT	3	6	12935	12940	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014729	CCA	2	6	14599	14604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_014729	GCA	2	6	15018	15023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014729	TCG	2	6	16493	16498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014729	GTC	2	6	16537	16542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014729	GGCA	2	8	17290	17297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014729	CGA	2	6	17302	17307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014729	CGG	2	6	17312	17317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014729	CGC	2	6	17328	17333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014729	ACG	2	6	17335	17340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014729	GTC	2	6	17365	17370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014729	TCC	2	6	17384	17389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_014729	TCG	2	6	18040	18045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014729	AG	3	6	18061	18066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014729	GA	3	6	18078	18083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014729	TGT	2	6	19053	19058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014729	GGTG	2	8	19524	19531	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014729	CAGG	2	8	19605	19612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014729	GTC	2	6	19615	19620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014729	G	6	6	19624	19629	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014729	GCG	2	6	19717	19722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014729	CGC	2	6	19758	19763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_014729	GAC	2	6	19770	19775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014729	A	6	6	19833	19838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014729	GGA	2	6	20338	20343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014729	TC	3	6	20349	20354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014729	TC	3	6	20597	20602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014729	TTTC	2	8	20848	20855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014729	TAC	2	6	21172	21177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014729	CTT	2	6	21179	21184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014729	AAC	2	6	21185	21190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014729	ATT	2	6	21261	21266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014729	TCG	2	6	21326	21331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014729	GGACA	2	10	21567	21576	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014729	TCAC	2	8	21598	21605	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014729	TCC	3	9	21618	21626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014729	GGA	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014729	TGG	2	6	21729	21734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014729	GTT	2	6	21794	21799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014729	CAG	2	6	21816	21821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014729	CAG	2	6	21826	21831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014729	AC	3	6	21874	21879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014729	TAGG	2	8	21928	21935	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014729	GCC	2	6	21943	21948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014729	CCGA	2	8	21979	21986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014729	CGG	2	6	22003	22008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014729	AG	4	8	22130	22137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014729	CCG	2	6	22206	22211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014729	CGG	2	6	22216	22221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014729	AAC	2	6	22299	22304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014729	ATG	2	6	22402	22407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014729	GCT	2	6	22465	22470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014729	GAG	2	6	22475	22480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014729	TGG	2	6	22501	22506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014729	GCG	2	6	22541	22546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014729	GGT	2	6	22557	22562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014729	AGT	2	6	24851	24856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014729	GTCG	2	8	24860	24867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014729	CAT	2	6	24880	24885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014729	GTA	2	6	24908	24913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014729	AGA	2	6	24938	24943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014729	ACA	2	6	24955	24960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014729	ATT	2	6	24970	24975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014729	TAC	2	6	25044	25049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014729	ATC	2	6	25089	25094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014729	CAGT	2	8	25127	25134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014729	AT	3	6	25197	25202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014729	ATCC	2	8	25213	25220	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014729	CGTC	2	8	25310	25317	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_014729	CTTC	2	8	25319	25326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014729	GTC	2	6	25344	25349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014729	GTTCG	2	10	25422	25431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014729	TCC	3	9	26224	26232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014729	GGA	2	6	26243	26248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014729	CGA	2	6	27695	27700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014729	ACT	2	6	27735	27740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014729	CCG	2	6	27742	27747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014729	GAT	2	6	27768	27773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014729	CAT	2	6	27891	27896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014729	AAG	2	6	27897	27902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014729	AGTTC	2	10	27905	27914	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014729	CAG	2	6	27927	27932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014729	GTC	2	6	27946	27951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014729	GA	3	6	27955	27960	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014729	AAT	2	6	28935	28940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014729	CGC	2	6	28959	28964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014729	GGCG	2	8	28966	28973	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014729	TGC	2	6	28976	28981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014729	AG	3	6	29028	29033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014729	CGCC	2	8	29113	29120	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_014729	CGA	2	6	31314	31319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014729	GCG	2	6	31393	31398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014729	TGA	2	6	31405	31410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014729	TTAG	2	8	32827	32834	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014729	TTC	2	6	32891	32896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014729	CCG	2	6	32897	32902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_014729	GTC	2	6	32938	32943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014729	GCC	2	6	33061	33066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014729	GTC	2	6	33072	33077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014729	TCCG	2	8	33133	33140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_014729	TCC	2	6	34064	34069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014729	GCC	2	6	34102	34107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014729	CGG	2	6	34180	34185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014729	GTCGG	2	10	34200	34209	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014729	CCAA	2	8	36235	36242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014729	CTG	2	6	36666	36671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014729	CGT	2	6	36705	36710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014729	CACTTT	2	12	36749	36760	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_014729	GAC	2	6	36818	36823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_014729	AG	3	6	37976	37981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_014729	GT	3	6	174023	174028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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