MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 7383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014729	TCCCG	2	10	1468456	1468465	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4002	NC_014729	TCC	2	6	1468470	1468475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_014729	CCG	2	6	1468490	1468495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_014729	CTGT	2	8	1468510	1468517	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_014729	CGT	2	6	1468534	1468539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_014729	TC	3	6	1468867	1468872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4007	NC_014729	CGC	2	6	1468873	1468878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_014729	GC	3	6	1468980	1468985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_014729	CCG	2	6	1469040	1469045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_014729	GAAC	2	8	1469079	1469086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_014729	GAGC	2	8	1469152	1469159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_014729	TTC	2	6	1469333	1469338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_014729	CAG	2	6	1469340	1469345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_014729	AGA	2	6	1469440	1469445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014729	TGG	2	6	1469484	1469489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014729	CTA	2	6	1474483	1474488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_014729	GC	3	6	1474617	1474622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_014729	GGA	2	6	1474638	1474643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014729	CG	3	6	1474831	1474836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_014729	CAC	2	6	1474848	1474853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_014729	T	7	7	1474873	1474879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_014729	CAA	2	6	1476615	1476620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_014729	AAT	2	6	1476708	1476713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014729	TCG	2	6	1477826	1477831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_014729	GTT	2	6	1477833	1477838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_014729	TCGC	2	8	1477864	1477871	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4027	NC_014729	GCC	2	6	1477892	1477897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_014729	GACC	2	8	1477898	1477905	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_014729	TCG	2	6	1477942	1477947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_014729	TCG	3	9	1477951	1477959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_014729	CGC	2	6	1477972	1477977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_014729	TAC	2	6	1478040	1478045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_014729	TGA	2	6	1478647	1478652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_014729	TCAC	2	8	1482252	1482259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_014729	AGA	2	6	1482261	1482266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_014729	CGC	2	6	1483782	1483787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_014729	G	6	6	1486833	1486838	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_014729	CGT	2	6	1486874	1486879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_014729	TAC	2	6	1487431	1487436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_014729	A	7	7	1489337	1489343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_014729	ACC	2	6	1489467	1489472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_014729	GTC	2	6	1490631	1490636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_014729	GGA	2	6	1490658	1490663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_014729	TCG	2	6	1490801	1490806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_014729	GGA	2	6	1490868	1490873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_014729	ACA	2	6	1491770	1491775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_014729	GTG	2	6	1491803	1491808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_014729	TTA	2	6	1493033	1493038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_014729	A	6	6	1494211	1494216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_014729	CTT	2	6	1494247	1494252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_014729	TA	3	6	1494264	1494269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_014729	AAT	2	6	1498258	1498263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_014729	CT	3	6	1498904	1498909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_014729	AT	3	6	1498921	1498926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_014729	AGT	2	6	1499498	1499503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014729	TGA	2	6	1499563	1499568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_014729	TTC	2	6	1499652	1499657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_014729	ATA	2	6	1499698	1499703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_014729	ACCC	2	8	1503564	1503571	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4060	NC_014729	GCC	2	6	1503612	1503617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_014729	ACC	2	6	1503635	1503640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4062	NC_014729	GA	3	6	1504229	1504234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_014729	AAT	2	6	1504276	1504281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014729	AAT	2	6	1504297	1504302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_014729	G	6	6	1504309	1504314	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_014729	CGAAC	2	10	1504330	1504339	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4067	NC_014729	CGT	2	6	1504377	1504382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_014729	TC	3	6	1504402	1504407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_014729	ACA	2	6	1504532	1504537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_014729	CCG	2	6	1504538	1504543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_014729	ATA	2	6	1504566	1504571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014729	AAT	2	6	1507044	1507049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_014729	GT	4	8	1507201	1507208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_014729	CCG	2	6	1507216	1507221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_014729	CACGA	2	10	1508335	1508344	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4076	NC_014729	CTTT	2	8	1508353	1508360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4077	NC_014729	ACG	2	6	1508369	1508374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_014729	TCG	2	6	1508681	1508686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_014729	GTC	2	6	1509971	1509976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_014729	CGG	2	6	1510012	1510017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_014729	CGTC	2	8	1510031	1510038	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4082	NC_014729	CCG	3	9	1512063	1512071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_014729	GGA	2	6	1513956	1513961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_014729	GGA	2	6	1513982	1513987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_014729	AAC	2	6	1513993	1513998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_014729	TTC	2	6	1514124	1514129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_014729	GTC	3	9	1514130	1514138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4088	NC_014729	GAC	2	6	1514155	1514160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_014729	GCAC	2	8	1514213	1514220	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_014729	GT	3	6	1514244	1514249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_014729	CCG	2	6	1514255	1514260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_014729	TCCC	2	8	1514267	1514274	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4093	NC_014729	AG	3	6	1514283	1514288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014729	GGT	2	6	1515819	1515824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014729	GAC	2	6	1515857	1515862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4096	NC_014729	GTC	2	6	1515868	1515873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_014729	AGGGCG	2	12	1515897	1515908	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
4098	NC_014729	CGG	2	6	1515949	1515954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_014729	TCGTC	2	10	1515984	1515993	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4100	NC_014729	GTCT	2	8	1516013	1516020	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_014729	TGA	2	6	1516022	1516027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014729	AGT	2	6	1516100	1516105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_014729	TTTA	2	8	1516112	1516119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_014729	GTGTT	2	10	1516156	1516165	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014729	T	6	6	1516164	1516169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_014729	GTG	2	6	1516170	1516175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014729	TTC	2	6	1516182	1516187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_014729	TCA	2	6	1516225	1516230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_014729	AAAT	2	8	1516235	1516242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014729	CT	3	6	1516279	1516284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_014729	CACC	2	8	1516333	1516340	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4112	NC_014729	GTT	2	6	1517210	1517215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014729	AAG	2	6	1517235	1517240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014729	CGG	2	6	1519088	1519093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_014729	CCGA	2	8	1519156	1519163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4116	NC_014729	CT	5	10	1522380	1522389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4117	NC_014729	A	6	6	1522398	1522403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014729	CGT	2	6	1522441	1522446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_014729	GT	3	6	1522445	1522450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014729	T	6	6	1523685	1523690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_014729	AT	3	6	1523704	1523709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014729	CAG	2	6	1523740	1523745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_014729	CGT	2	6	1523869	1523874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_014729	ATC	2	6	1523901	1523906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_014729	TG	3	6	1524486	1524491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_014729	TCT	2	6	1524495	1524500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_014729	GGAG	2	8	1524585	1524592	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_014729	TCAG	2	8	1525591	1525598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4129	NC_014729	TC	3	6	1525612	1525617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4130	NC_014729	GGT	2	6	1525626	1525631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_014729	TC	3	6	1528257	1528262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4132	NC_014729	TGAC	2	8	1528340	1528347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4133	NC_014729	CAA	2	6	1528475	1528480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4134	NC_014729	TGC	2	6	1530064	1530069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_014729	ATA	2	6	1530089	1530094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_014729	TA	3	6	1530167	1530172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_014729	TGG	2	6	1530174	1530179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_014729	CA	3	6	1530194	1530199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4139	NC_014729	ATA	2	6	1530326	1530331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_014729	TC	3	6	1530430	1530435	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4141	NC_014729	GAC	2	6	1530439	1530444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4145	NC_014729	GAC	2	6	1530647	1530652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4147	NC_014729	CGGA	2	8	1530696	1530703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4148	NC_014729	GTG	2	6	1530708	1530713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4149	NC_014729	CTTC	2	8	1530791	1530798	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4150	NC_014729	CTA	2	6	1530820	1530825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4153	NC_014729	GCT	2	6	1530953	1530958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4155	NC_014729	GTG	2	6	1531188	1531193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4164	NC_014729	TGC	2	6	1531469	1531474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4172	NC_014729	CGC	2	6	1535624	1535629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4193	NC_014729	GTCC	2	8	1541400	1541407	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4204	NC_014729	GACC	2	8	1546593	1546600	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4248	NC_014729	TC	3	6	1569761	1569766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4249	NC_014729	TCA	2	6	1569768	1569773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4251	NC_014729	TGCC	2	8	1569901	1569908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4252	NC_014729	AAC	2	6	1569978	1569983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_014729	TTC	2	6	1570021	1570026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4255	NC_014729	CTT	2	6	1570104	1570109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4256	NC_014729	CA	3	6	1570136	1570141	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4257	NC_014729	ACG	2	6	1570199	1570204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4258	NC_014729	ACG	2	6	1570211	1570216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4259	NC_014729	GGT	2	6	1570244	1570249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_014729	ACTG	2	8	1570335	1570342	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4261	NC_014729	CTCCA	2	10	1570343	1570352	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
4262	NC_014729	GTCG	2	8	1570377	1570384	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4263	NC_014729	TGACGT	2	12	1570629	1570640	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4264	NC_014729	CGTTGT	2	12	1570650	1570661	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4265	NC_014729	CGT	2	6	1570803	1570808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_014729	CTC	2	6	1570831	1570836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4267	NC_014729	GTC	2	6	1570891	1570896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4268	NC_014729	GTA	2	6	1570903	1570908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4283	NC_014729	GA	3	6	1572052	1572057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4386	NC_014729	CGTA	2	8	1624923	1624930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4387	NC_014729	CGGA	2	8	1626078	1626085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4392	NC_014729	A	6	6	1627602	1627607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4393	NC_014729	GAG	2	6	1630872	1630877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_014729	ATG	2	6	1630901	1630906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4500	NC_014729	GTCG	2	8	1688505	1688512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

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