MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 7383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014729	CAC	2	6	1318204	1318209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3502	NC_014729	CTG	2	6	1318233	1318238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_014729	ACA	2	6	1318256	1318261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_014729	CAG	2	6	1318313	1318318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_014729	CCA	2	6	1318320	1318325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_014729	TACCCG	2	12	1318343	1318354	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_014729	TCC	2	6	1318412	1318417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3508	NC_014729	GGA	3	9	1318428	1318436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014729	ACGGG	2	10	1318866	1318875	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3510	NC_014729	AG	3	6	1318876	1318881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014729	CAA	2	6	1321011	1321016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_014729	TCG	2	6	1321063	1321068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3513	NC_014729	CGG	2	6	1321069	1321074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_014729	GCC	2	6	1321078	1321083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_014729	TGCGA	2	10	1321164	1321173	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3516	NC_014729	CGT	2	6	1322380	1322385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_014729	TTCG	2	8	1322419	1322426	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_014729	CCAC	2	8	1323546	1323553	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3519	NC_014729	AC	3	6	1323720	1323725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3520	NC_014729	GAC	2	6	1323763	1323768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_014729	TCA	2	6	1323787	1323792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_014729	CT	3	6	1325036	1325041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_014729	AGG	2	6	1325074	1325079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_014729	CGA	2	6	1325546	1325551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_014729	ACG	2	6	1325596	1325601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_014729	GTC	2	6	1325604	1325609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_014729	CAG	2	6	1325639	1325644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_014729	AG	3	6	1325643	1325648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_014729	TCG	2	6	1325737	1325742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_014729	GAC	2	6	1325760	1325765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_014729	CAC	2	6	1325854	1325859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_014729	CGC	2	6	1325860	1325865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_014729	TCG	2	6	1325881	1325886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_014729	TCT	2	6	1325897	1325902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_014729	CGC	2	6	1325912	1325917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_014729	ATG	2	6	1325926	1325931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_014729	GTT	2	6	1325934	1325939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_014729	CGT	3	9	1325993	1326001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_014729	G	6	6	1326067	1326072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_014729	GTA	2	6	1326086	1326091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_014729	ACG	2	6	1326782	1326787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_014729	AT	3	6	1326790	1326795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_014729	AGT	2	6	1326823	1326828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_014729	ATC	2	6	1327680	1327685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3545	NC_014729	AGT	2	6	1327727	1327732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_014729	GGA	2	6	1330063	1330068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_014729	GAC	2	6	1330837	1330842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_014729	CCA	2	6	1331235	1331240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_014729	GTC	3	9	1331739	1331747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_014729	CGA	2	6	1331750	1331755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_014729	CGT	2	6	1331760	1331765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_014729	CCG	2	6	1334214	1334219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3553	NC_014729	ACGA	2	8	1334239	1334246	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_014729	GAC	2	6	1334556	1334561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_014729	TAGT	2	8	1339017	1339024	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_014729	TAA	2	6	1339106	1339111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014729	ATG	2	6	1339118	1339123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_014729	GTA	2	6	1339149	1339154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_014729	TTAT	2	8	1339192	1339199	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014729	ATA	2	6	1339228	1339233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_014729	ATGTG	2	10	1339252	1339261	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_014729	TGT	2	6	1339291	1339296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_014729	ACT	2	6	1340795	1340800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_014729	CAG	2	6	1340810	1340815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_014729	GTTC	2	8	1340822	1340829	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3566	NC_014729	ATCA	2	8	1340836	1340843	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3567	NC_014729	AACA	2	8	1341090	1341097	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3568	NC_014729	CGA	2	6	1341121	1341126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_014729	CA	3	6	1341132	1341137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_014729	AGG	2	6	1341190	1341195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_014729	CGG	2	6	1341204	1341209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_014729	T	6	6	1341251	1341256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014729	GT	3	6	1344622	1344627	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_014729	GAT	2	6	1344636	1344641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_014729	A	6	6	1344648	1344653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_014729	TC	3	6	1345685	1345690	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_014729	CCG	2	6	1347668	1347673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_014729	GGT	2	6	1348263	1348268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_014729	ACG	2	6	1348294	1348299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_014729	GTC	2	6	1348300	1348305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_014729	CAT	2	6	1348317	1348322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_014729	AACG	2	8	1348326	1348333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3583	NC_014729	CCG	2	6	1348405	1348410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_014729	ACCG	2	8	1348416	1348423	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3585	NC_014729	GACCG	2	10	1348425	1348434	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3586	NC_014729	GAC	2	6	1349672	1349677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_014729	TAC	2	6	1349749	1349754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_014729	GAG	2	6	1349759	1349764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014729	GTC	2	6	1350470	1350475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_014729	ACG	2	6	1351350	1351355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3591	NC_014729	TAC	2	6	1351417	1351422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_014729	T	6	6	1351444	1351449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014729	CCCT	2	8	1351452	1351459	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3594	NC_014729	TAC	2	6	1351473	1351478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_014729	ATT	2	6	1351495	1351500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_014729	ACTG	2	8	1351513	1351520	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3597	NC_014729	GA	4	8	1351538	1351545	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_014729	TCG	2	6	1351626	1351631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_014729	CAC	2	6	1351653	1351658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_014729	GAC	2	6	1351663	1351668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_014729	CGAA	2	8	1353173	1353180	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3602	NC_014729	CAGA	2	8	1353836	1353843	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3603	NC_014729	GT	3	6	1353901	1353906	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_014729	GGA	2	6	1353907	1353912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_014729	GGA	2	6	1354560	1354565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_014729	CA	3	6	1355121	1355126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3607	NC_014729	TTC	2	6	1355153	1355158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3608	NC_014729	CGA	2	6	1355522	1355527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_014729	TGC	2	6	1357181	1357186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_014729	GGCAG	2	10	1357298	1357307	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3611	NC_014729	CCG	2	6	1357785	1357790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_014729	CGC	2	6	1357800	1357805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3613	NC_014729	ACA	2	6	1357841	1357846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_014729	AAC	2	6	1359460	1359465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_014729	AAT	2	6	1359466	1359471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014729	CGA	2	6	1359499	1359504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_014729	GAG	2	6	1359543	1359548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_014729	TC	3	6	1359574	1359579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_014729	AAC	2	6	1359606	1359611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3620	NC_014729	CCG	2	6	1359817	1359822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_014729	GGT	2	6	1359875	1359880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_014729	GTCG	2	8	1361539	1361546	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3623	NC_014729	TCG	3	9	1361544	1361552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_014729	CGA	2	6	1361578	1361583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_014729	C	6	6	1361650	1361655	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3626	NC_014729	GCTACC	2	12	1361681	1361692	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3627	NC_014729	GCG	2	6	1362921	1362926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3628	NC_014729	GTC	2	6	1362935	1362940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3629	NC_014729	GAT	2	6	1362964	1362969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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