MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 7383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014729	TC	3	6	1130838	1130843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3002	NC_014729	GCC	2	6	1132762	1132767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3003	NC_014729	GAG	2	6	1132796	1132801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014729	CAAG	2	8	1132814	1132821	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3005	NC_014729	GTC	2	6	1132825	1132830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_014729	GAAC	2	8	1132846	1132853	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3007	NC_014729	ACG	2	6	1132876	1132881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_014729	A	6	6	1132890	1132895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_014729	GTA	2	6	1134998	1135003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014729	CTGC	2	8	1135040	1135047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_014729	TCG	2	6	1135049	1135054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_014729	CGC	2	6	1135123	1135128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3013	NC_014729	CCG	2	6	1135170	1135175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_014729	TTTC	2	8	1135743	1135750	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_014729	GCGT	2	8	1135761	1135768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3016	NC_014729	CCG	2	6	1135794	1135799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_014729	GAGG	2	8	1136906	1136913	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_014729	ATGC	2	8	1136945	1136952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3019	NC_014729	ACTG	2	8	1136991	1136998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3020	NC_014729	GGT	2	6	1137326	1137331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_014729	TCG	2	6	1139170	1139175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_014729	GAC	2	6	1139964	1139969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_014729	TGG	2	6	1139982	1139987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014729	CGGG	2	8	1139995	1140002	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3025	NC_014729	CGT	2	6	1141458	1141463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_014729	TA	3	6	1141469	1141474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014729	GAT	2	6	1141475	1141480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_014729	GCC	2	6	1141508	1141513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3029	NC_014729	AGG	2	6	1141520	1141525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014729	ACC	2	6	1141528	1141533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_014729	GAA	2	6	1141553	1141558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_014729	CGA	2	6	1141941	1141946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_014729	AC	3	6	1141952	1141957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3034	NC_014729	CAA	2	6	1141987	1141992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014729	GAT	2	6	1142000	1142005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014729	TC	3	6	1144872	1144877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3037	NC_014729	GA	4	8	1144881	1144888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014729	TG	3	6	1145453	1145458	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_014729	TG	3	6	1145519	1145524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014729	GAC	2	6	1147217	1147222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_014729	AGG	2	6	1147236	1147241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_014729	AC	3	6	1147721	1147726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3043	NC_014729	A	6	6	1147738	1147743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014729	GCA	2	6	1147752	1147757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_014729	GCC	2	6	1150542	1150547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3046	NC_014729	CGT	2	6	1150560	1150565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_014729	ACG	2	6	1150638	1150643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_014729	CGTT	2	8	1151236	1151243	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_014729	GTTCG	2	10	1151260	1151269	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3050	NC_014729	CGC	2	6	1153298	1153303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3051	NC_014729	CGT	2	6	1154293	1154298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_014729	G	6	6	1154301	1154306	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_014729	CG	3	6	1154307	1154312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3054	NC_014729	ATCA	2	8	1154339	1154346	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_014729	CTG	2	6	1154348	1154353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_014729	CGC	2	6	1154371	1154376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_014729	ACGGC	2	10	1154422	1154431	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3058	NC_014729	CGT	2	6	1155359	1155364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_014729	CGT	2	6	1155399	1155404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_014729	CCT	2	6	1158992	1158997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_014729	TTCGA	2	10	1159135	1159144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3062	NC_014729	GGC	2	6	1159201	1159206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_014729	GCG	2	6	1159232	1159237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_014729	GTC	2	6	1159242	1159247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_014729	TGG	2	6	1159251	1159256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_014729	ATT	2	6	1159268	1159273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014729	GCG	2	6	1161534	1161539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_014729	GTG	2	6	1161560	1161565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014729	AC	3	6	1161613	1161618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_014729	AC	3	6	1161736	1161741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_014729	GT	3	6	1161839	1161844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_014729	CCG	2	6	1161860	1161865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3073	NC_014729	GA	3	6	1161882	1161887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_014729	GTCG	2	8	1162285	1162292	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3075	NC_014729	CG	3	6	1163401	1163406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3076	NC_014729	TC	4	8	1164836	1164843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3077	NC_014729	GGT	2	6	1164844	1164849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_014729	TTTCAC	2	12	1164894	1164905	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_014729	CGA	2	6	1164934	1164939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_014729	CGAC	2	8	1164962	1164969	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_014729	GGC	2	6	1164981	1164986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_014729	CGT	2	6	1165654	1165659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3083	NC_014729	GCG	2	6	1165964	1165969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_014729	CCCG	2	8	1165984	1165991	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3085	NC_014729	TGG	2	6	1166807	1166812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_014729	GCCT	2	8	1166834	1166841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3087	NC_014729	CCT	2	6	1166862	1166867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3088	NC_014729	CGT	2	6	1167325	1167330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_014729	AG	3	6	1167347	1167352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_014729	CGA	2	6	1168065	1168070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3091	NC_014729	AGTC	2	8	1168095	1168102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3092	NC_014729	ACGA	2	8	1168105	1168112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3093	NC_014729	CGG	2	6	1168180	1168185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_014729	TTTC	2	8	1169585	1169592	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3095	NC_014729	GCG	3	9	1169607	1169615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3096	NC_014729	ACG	2	6	1169674	1169679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3097	NC_014729	GACAC	2	10	1169680	1169689	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3098	NC_014729	AC	4	8	1169686	1169693	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3099	NC_014729	TCTT	2	8	1174684	1174691	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3100	NC_014729	CCA	2	6	1174720	1174725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3101	NC_014729	AGT	2	6	1174797	1174802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014729	T	6	6	1176297	1176302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_014729	TCA	2	6	1176305	1176310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3104	NC_014729	GA	3	6	1176346	1176351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014729	AGA	2	6	1176407	1176412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_014729	CTT	2	6	1176424	1176429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_014729	GAC	2	6	1176452	1176457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3108	NC_014729	ACG	2	6	1176711	1176716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3109	NC_014729	GCG	2	6	1177446	1177451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_014729	GGA	2	6	1177498	1177503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_014729	ACT	2	6	1177525	1177530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_014729	G	6	6	1177542	1177547	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_014729	GTC	2	6	1177575	1177580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_014729	TGG	2	6	1177628	1177633	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014729	GGGGA	2	10	1177634	1177643	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_014729	G	7	7	1177656	1177662	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014729	CCG	2	6	1177686	1177691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_014729	GCG	2	6	1177698	1177703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_014729	GAC	2	6	1177768	1177773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_014729	CTA	2	6	1177789	1177794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_014729	TC	3	6	1178294	1178299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_014729	TA	3	6	1179528	1179533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_014729	CT	3	6	1179539	1179544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_014729	ACG	2	6	1179567	1179572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_014729	CGC	2	6	1179582	1179587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3126	NC_014729	GTCG	2	8	1179589	1179596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3127	NC_014729	GTC	2	6	1179603	1179608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_014729	CGG	2	6	1179611	1179616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_014729	CCAT	2	8	1180914	1180921	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3130	NC_014729	CAA	2	6	1180931	1180936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3131	NC_014729	CTC	2	6	1181019	1181024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3132	NC_014729	CTTC	2	8	1181085	1181092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_014729	GGC	2	6	1181133	1181138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3140	NC_014729	AGCGA	2	10	1181648	1181657	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3163	NC_014729	AGTC	2	8	1183384	1183391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3255	NC_014729	TACAC	2	10	1235693	1235702	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3262	NC_014729	AAATC	2	10	1240807	1240816	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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