MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 7383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014729	AGC	2	6	187492	187497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_014729	ATG	2	6	187509	187514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014729	TCG	2	6	188656	188661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_014729	TGT	3	9	188664	188672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014729	GCC	2	6	188677	188682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_014729	CGTCGG	2	12	188711	188722	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_014729	GTC	2	6	188738	188743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014729	TCC	2	6	189805	189810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
509	NC_014729	TCG	2	6	189827	189832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_014729	CCGAAT	2	12	189919	189930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014729	CCGAA	2	10	189948	189957	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
512	NC_014729	GTT	2	6	190048	190053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014729	CAC	2	6	190072	190077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_014729	TAA	2	6	190103	190108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014729	ATC	2	6	190111	190116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014729	CTTCT	2	10	190127	190136	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
517	NC_014729	GT	3	6	190144	190149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014729	TTC	2	6	190170	190175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_014729	CGG	2	6	190328	190333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_014729	ACC	2	6	190373	190378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_014729	GTT	2	6	190427	190432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014729	TTC	2	6	190444	190449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_014729	CTA	2	6	190451	190456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_014729	C	7	7	190516	190522	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
525	NC_014729	CACC	2	8	190569	190576	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
526	NC_014729	ACC	2	6	190606	190611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_014729	CCT	2	6	190693	190698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_014729	ATT	2	6	190723	190728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014729	ATA	2	6	190752	190757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014729	ACAATA	9	54	190758	190811	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
531	NC_014729	CGCT	2	8	190842	190849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
532	NC_014729	T	6	6	190887	190892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014729	CAT	2	6	190920	190925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_014729	G	6	6	191024	191029	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014729	GTTCGA	2	12	192774	192785	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
536	NC_014729	ACTG	2	8	192788	192795	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_014729	GTTCGA	2	12	192798	192809	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
538	NC_014729	ACTG	2	8	192812	192819	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
539	NC_014729	GTTCGA	2	12	192822	192833	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
540	NC_014729	ACTG	2	8	192836	192843	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
541	NC_014729	TG	3	6	192845	192850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014729	ACTG	2	8	192860	192867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_014729	GTC	2	6	193706	193711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_014729	TTC	2	6	193761	193766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_014729	TCGAC	2	10	195450	195459	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
546	NC_014729	GAC	2	6	197847	197852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_014729	CA	3	6	197854	197859	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_014729	TAC	2	6	197863	197868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_014729	TCGT	2	8	197951	197958	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_014729	GGC	2	6	198016	198021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_014729	ATT	2	6	200502	200507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014729	TAT	2	6	200520	200525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014729	A	6	6	200534	200539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014729	GAG	2	6	201279	201284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014729	CGA	2	6	201887	201892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_014729	GGT	2	6	201899	201904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014729	CGAAC	2	10	201946	201955	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
558	NC_014729	TGG	2	6	202064	202069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014729	ACT	2	6	202071	202076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_014729	CGT	2	6	202245	202250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_014729	G	6	6	202359	202364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014729	GCG	2	6	205428	205433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_014729	CGT	2	6	205467	205472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_014729	CGG	2	6	205777	205782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_014729	CAA	2	6	205809	205814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014729	CGG	2	6	206076	206081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014729	AT	3	6	208676	208681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014729	ACT	2	6	208738	208743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_014729	ATT	2	6	208761	208766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014729	TAC	2	6	208767	208772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_014729	GAAA	2	8	209464	209471	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014729	CTT	2	6	210213	210218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014729	ACG	2	6	210253	210258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_014729	ATT	2	6	211285	211290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014729	CCG	2	6	211297	211302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_014729	TG	3	6	213565	213570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014729	TA	3	6	213572	213577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014729	TCT	2	6	213578	213583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_014729	AGA	2	6	213618	213623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014729	CGA	2	6	213648	213653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_014729	A	6	6	214174	214179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014729	GATTC	2	10	214189	214198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
583	NC_014729	AG	3	6	215604	215609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014729	ATT	2	6	215617	215622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014729	CGA	2	6	217477	217482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_014729	TCG	2	6	217502	217507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_014729	GGTA	2	8	218099	218106	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014729	AGCG	2	8	218497	218504	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
589	NC_014729	CCGA	2	8	218505	218512	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
590	NC_014729	AGGG	2	8	218528	218535	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014729	T	6	6	218603	218608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014729	TCA	2	6	224549	224554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_014729	CGTC	2	8	224564	224571	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
594	NC_014729	TGC	2	6	224574	224579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_014729	GCGA	2	8	224604	224611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
596	NC_014729	CGC	2	6	224614	224619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_014729	CTGA	2	8	224622	224629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
598	NC_014729	TG	3	6	224635	224640	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014729	TCAAT	2	10	224649	224658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
600	NC_014729	A	6	6	227068	227073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014729	ACCGTA	2	12	227104	227115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_014729	GAA	2	6	227131	227136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014729	GTA	2	6	227144	227149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014729	CGG	2	6	230130	230135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_014729	CGT	2	6	230174	230179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_014729	GTC	2	6	231498	231503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_014729	AGGG	2	8	231536	231543	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014729	AAC	2	6	232767	232772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_014729	TCC	2	6	232808	232813	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_014729	CG	3	6	234035	234040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
611	NC_014729	ATGGG	2	10	234058	234067	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
612	NC_014729	GTA	2	6	234476	234481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014729	G	6	6	234511	234516	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014729	CAT	2	6	234607	234612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_014729	C	6	6	234705	234710	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
616	NC_014729	GGCG	2	8	235694	235701	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
617	NC_014729	ACG	2	6	236124	236129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_014729	CA	3	6	238513	238518	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
619	NC_014729	TTC	2	6	239990	239995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_014729	TC	3	6	240042	240047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_014729	CGC	2	6	240067	240072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
622	NC_014729	CCG	2	6	240093	240098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_014729	CGC	2	6	240147	240152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_014729	CG	3	6	240167	240172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_014729	CA	3	6	240182	240187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_014729	CGA	2	6	241071	241076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_014729	GCC	2	6	241115	241120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_014729	AGG	2	6	241142	241147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014729	GTC	2	6	241217	241222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_014729	GAA	2	6	241298	241303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014729	GAC	3	9	241323	241331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_014729	CGA	2	6	241966	241971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_014729	CTG	3	9	242077	242085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_014729	CGC	2	6	243068	243073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
635	NC_014729	CGC	2	6	243676	243681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_014729	CCGAAC	2	12	243699	243710	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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771	NC_014729	ACC	2	6	302076	302081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
772	NC_014729	CCGAC	2	10	302086	302095	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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