MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halogeometricum borinquense DSM 11551 chromosome

Total Repeats: 7383

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014729	CGT	2	6	2319272	2319277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6002	NC_014729	GACG	2	8	2319283	2319290	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6003	NC_014729	ATAC	2	8	2319327	2319334	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6004	NC_014729	AC	3	6	2321762	2321767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_014729	ACG	2	6	2322574	2322579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_014729	CGT	2	6	2322605	2322610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_014729	AGT	2	6	2322612	2322617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_014729	CG	3	6	2322677	2322682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_014729	TA	3	6	2322700	2322705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_014729	C	6	6	2322748	2322753	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6011	NC_014729	TCG	2	6	2322778	2322783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_014729	TGAG	2	8	2322794	2322801	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_014729	GA	3	6	2322834	2322839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_014729	TC	3	6	2323852	2323857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6015	NC_014729	CGC	2	6	2323863	2323868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6016	NC_014729	GACG	2	8	2323873	2323880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6017	NC_014729	TTC	2	6	2323885	2323890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6018	NC_014729	AAC	2	6	2324670	2324675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_014729	GA	3	6	2326363	2326368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_014729	ATT	2	6	2326453	2326458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014729	TGT	2	6	2326469	2326474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_014729	CA	4	8	2326547	2326554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6023	NC_014729	ACG	2	6	2326569	2326574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_014729	CGA	2	6	2327115	2327120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_014729	GGT	2	6	2327132	2327137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014729	GCT	2	6	2327160	2327165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_014729	ACG	2	6	2327237	2327242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6028	NC_014729	TCT	2	6	2327282	2327287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_014729	CGC	2	6	2327300	2327305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_014729	TGG	2	6	2327330	2327335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014729	GAG	2	6	2327336	2327341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_014729	CGT	3	9	2331133	2331141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_014729	CCCG	2	8	2331631	2331638	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6034	NC_014729	TCG	2	6	2334843	2334848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_014729	AAT	2	6	2334874	2334879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014729	GA	3	6	2336104	2336109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_014729	ACC	2	6	2336122	2336127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6038	NC_014729	AGCG	2	8	2336166	2336173	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6039	NC_014729	AT	3	6	2337800	2337805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_014729	GAA	2	6	2339746	2339751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014729	GTC	2	6	2339760	2339765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6042	NC_014729	CGA	2	6	2340581	2340586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_014729	GCAC	2	8	2340617	2340624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_014729	GTCC	2	8	2341117	2341124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6045	NC_014729	TG	4	8	2341143	2341150	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014729	TAT	2	6	2341151	2341156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_014729	ATT	2	6	2341165	2341170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_014729	CGAG	2	8	2341496	2341503	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6049	NC_014729	GGT	2	6	2341512	2341517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_014729	CCG	3	9	2341542	2341550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6051	NC_014729	T	6	6	2341567	2341572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_014729	GCG	2	6	2342401	2342406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014729	AG	3	6	2343178	2343183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_014729	GCG	2	6	2343213	2343218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_014729	CGG	2	6	2343246	2343251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_014729	AAC	2	6	2343755	2343760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_014729	CG	3	6	2343779	2343784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6058	NC_014729	CCGTGT	2	12	2343829	2343840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_014729	CT	3	6	2343862	2343867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_014729	CGT	2	6	2343870	2343875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_014729	GTC	2	6	2343883	2343888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_014729	ACG	2	6	2343892	2343897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_014729	CCG	2	6	2343927	2343932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_014729	GGGC	2	8	2345724	2345731	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6065	NC_014729	CA	3	6	2347030	2347035	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6066	NC_014729	ATA	2	6	2347047	2347052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_014729	ATTACG	2	12	2347090	2347101	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6068	NC_014729	CGA	2	6	2347102	2347107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6069	NC_014729	GTG	2	6	2347197	2347202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_014729	CGG	2	6	2347223	2347228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_014729	TCG	2	6	2349258	2349263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_014729	GAG	2	6	2349285	2349290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6073	NC_014729	CAC	2	6	2350108	2350113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_014729	TCG	3	9	2350131	2350139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6075	NC_014729	TCG	2	6	2350200	2350205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_014729	CTT	2	6	2350216	2350221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6077	NC_014729	GAAA	2	8	2352514	2352521	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_014729	GAC	2	6	2353860	2353865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_014729	AGC	2	6	2353927	2353932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_014729	ACG	2	6	2353939	2353944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_014729	CGC	2	6	2355249	2355254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6082	NC_014729	GTC	2	6	2355255	2355260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6083	NC_014729	GTGG	2	8	2356437	2356444	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014729	CGC	2	6	2356506	2356511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_014729	TCG	2	6	2356526	2356531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_014729	CA	3	6	2357951	2357956	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6087	NC_014729	TA	3	6	2362780	2362785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_014729	TA	3	6	2366496	2366501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_014729	CCT	2	6	2368635	2368640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_014729	GAGAC	2	10	2368714	2368723	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6091	NC_014729	AGCG	2	8	2368743	2368750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6092	NC_014729	GA	3	6	2368793	2368798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014729	TC	3	6	2368804	2368809	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_014729	TCA	2	6	2368811	2368816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_014729	CGGT	2	8	2368904	2368911	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6096	NC_014729	CCG	2	6	2368947	2368952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6097	NC_014729	AAC	2	6	2369021	2369026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_014729	TTC	2	6	2369064	2369069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_014729	CTT	2	6	2369147	2369152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6100	NC_014729	CA	3	6	2369179	2369184	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6101	NC_014729	ACG	2	6	2369242	2369247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_014729	ACG	2	6	2369254	2369259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_014729	GGT	2	6	2369287	2369292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_014729	CTCCA	2	10	2369385	2369394	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6105	NC_014729	GAC	2	6	2369401	2369406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_014729	GTCG	2	8	2369419	2369426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6107	NC_014729	TTC	2	6	2369438	2369443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_014729	GTC	3	9	2369644	2369652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_014729	AG	3	6	2369678	2369683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_014729	TC	3	6	2369690	2369695	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_014729	CA	4	8	2369720	2369727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6112	NC_014729	CCCA	2	8	2369742	2369749	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6113	NC_014729	CGAG	2	8	2369760	2369767	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6114	NC_014729	GGA	2	6	2369830	2369835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_014729	GCG	2	6	2369847	2369852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6116	NC_014729	GGA	2	6	2369860	2369865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6117	NC_014729	TAC	2	6	2369870	2369875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_014729	GACA	2	8	2369899	2369906	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6119	NC_014729	CGGA	2	8	2369927	2369934	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6120	NC_014729	CTTC	2	8	2371396	2371403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_014729	CTT	2	6	2371423	2371428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_014729	GA	3	6	2371466	2371471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_014729	GTC	2	6	2371501	2371506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_014729	GTT	2	6	2375253	2375258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_014729	TCA	2	6	2375261	2375266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_014729	CA	3	6	2375265	2375270	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6127	NC_014729	ATT	2	6	2375369	2375374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_014729	GCC	2	6	2375375	2375380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_014729	CGC	2	6	2375684	2375689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6131	NC_014729	TG	4	8	2376406	2376413	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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