MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 10237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_014654	TA	3	6	876063	876068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_014654	ATA	2	6	876074	876079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_014654	AGG	2	6	878092	878097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_014654	AAT	2	6	878671	878676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_014654	AAT	2	6	878679	878684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_014654	TTA	2	6	878748	878753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_014654	ATA	2	6	880422	880427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_014654	T	6	6	880455	880460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_014654	TATT	2	8	880481	880488	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_014654	ATT	2	6	883001	883006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_014654	ATT	2	6	883024	883029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_014654	T	8	8	883054	883061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_014654	AT	3	6	883070	883075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_014654	TAA	2	6	883099	883104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_014654	TAA	2	6	883113	883118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_014654	ATT	2	6	883163	883168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_014654	T	8	8	885163	885170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_014654	TAA	2	6	885208	885213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_014654	T	6	6	885215	885220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_014654	AAAG	3	12	885236	885247	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_014654	T	6	6	887189	887194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_014654	AT	4	8	887204	887211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_014654	ATT	2	6	887263	887268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_014654	TTA	2	6	887277	887282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_014654	GAG	2	6	887359	887364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_014654	CAC	2	6	889960	889965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4027	NC_014654	TCA	3	9	890003	890011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_014654	AAT	2	6	890092	890097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_014654	ATT	2	6	890101	890106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_014654	ACA	2	6	890159	890164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_014654	A	6	6	890188	890193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_014654	TTA	2	6	890234	890239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_014654	AT	3	6	890273	890278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_014654	GGT	2	6	890282	890287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_014654	TCA	2	6	890441	890446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_014654	CAT	2	6	890449	890454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_014654	CAG	2	6	890484	890489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_014654	TTTC	2	8	890498	890505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4039	NC_014654	ATT	2	6	890572	890577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_014654	T	6	6	890576	890581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_014654	T	6	6	890585	890590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_014654	AAT	2	6	890608	890613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_014654	T	6	6	890613	890618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_014654	ATT	2	6	890636	890641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_014654	TCC	2	6	890657	890662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_014654	TACT	2	8	890685	890692	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_014654	T	7	7	890699	890705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_014654	ATA	2	6	890760	890765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_014654	CTT	2	6	890853	890858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_014654	AGG	2	6	890866	890871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_014654	CCA	2	6	890885	890890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_014654	TCTA	2	8	890896	890903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4053	NC_014654	ACTACC	2	12	890914	890925	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4054	NC_014654	AT	3	6	890927	890932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_014654	TGT	2	6	890974	890979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_014654	CAG	2	6	891045	891050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4059	NC_014654	AGC	2	6	891104	891109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_014654	CCT	2	6	891142	891147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_014654	CTCC	2	8	893110	893117	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4062	NC_014654	TCAAAA	2	12	893124	893135	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4063	NC_014654	A	6	6	893141	893146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_014654	TAT	2	6	893162	893167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_014654	TTAA	2	8	893197	893204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4067	NC_014654	TAA	2	6	893267	893272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_014654	AT	4	8	893292	893299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_014654	ATT	2	6	893316	893321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_014654	AGG	2	6	893356	893361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_014654	T	7	7	895209	895215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_014654	ATA	2	6	895253	895258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4074	NC_014654	GGA	2	6	898246	898251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4077	NC_014654	A	7	7	903303	903309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_014654	TA	3	6	903310	903315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_014654	AT	4	8	903316	903323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_014654	A	6	6	903340	903345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_014654	A	6	6	903377	903382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_014654	GGT	2	6	903389	903394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_014654	TAATA	2	10	904593	904602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_014654	TGG	2	6	904613	904618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_014654	A	6	6	904642	904647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4088	NC_014654	TAA	2	6	908503	908508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_014654	ATGG	2	8	908512	908519	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_014654	T	6	6	909667	909672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_014654	T	6	6	909685	909690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_014654	CAA	2	6	909720	909725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_014654	ATAAA	2	10	909737	909746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_014654	AAG	2	6	909850	909855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_014654	ATT	2	6	911134	911139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_014654	TA	3	6	911149	911154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_014654	A	6	6	911154	911159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_014654	TAT	2	6	911160	911165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_014654	ATA	2	6	911166	911171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_014654	AAAT	2	8	911195	911202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_014654	GAT	2	6	912032	912037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_014654	TTCTT	2	10	913193	913202	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4103	NC_014654	A	8	8	913227	913234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_014654	AGGA	2	8	913245	913252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_014654	AAT	2	6	913290	913295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_014654	ATTA	2	8	913310	913317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_014654	AGG	2	6	913330	913335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_014654	TAA	2	6	913336	913341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_014654	ATA	2	6	915879	915884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_014654	AGG	2	6	915916	915921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_014654	TAA	2	6	916440	916445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_014654	TA	3	6	916446	916451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_014654	T	6	6	916508	916513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_014654	AT	4	8	916517	916524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_014654	AGA	2	6	916528	916533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_014654	TATT	2	8	916576	916583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_014654	TGT	2	6	916598	916603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_014654	A	6	6	916606	916611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_014654	ATA	2	6	916615	916620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_014654	CAG	2	6	916622	916627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_014654	TATT	2	8	916631	916638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_014654	AGG	2	6	916645	916650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_014654	AAT	2	6	916651	916656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_014654	A	6	6	920212	920217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_014654	ATA	2	6	920234	920239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_014654	AATTA	3	15	920258	920272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_014654	AT	3	6	920279	920284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_014654	TTA	2	6	920305	920310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_014654	TTG	2	6	920335	920340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_014654	GAAA	2	8	920384	920391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_014654	ATT	2	6	920394	920399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_014654	GAT	2	6	920409	920414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_014654	TAA	2	6	921669	921674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_014654	TAA	2	6	921687	921692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_014654	A	6	6	921737	921742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_014654	AAT	2	6	921753	921758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4138	NC_014654	TATT	2	8	921781	921788	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4404	NC_014654	A	7	7	1014857	1014863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4405	NC_014654	A	7	7	1014891	1014897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4409	NC_014654	AGT	2	6	1014973	1014978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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