MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 10237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014654	ATT	2	6	167262	167267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014654	TTTG	2	8	167275	167282	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014654	TAA	3	9	167285	167293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014654	AGG	2	6	167297	167302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_014654	TATT	2	8	168733	168740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014654	ATT	2	6	168777	168782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014654	AAGAT	2	10	168784	168793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014654	AAC	2	6	168801	168806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_014654	AGG	2	6	168833	168838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014654	GAT	2	6	170146	170151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014654	A	7	7	171306	171312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014654	AT	3	6	171425	171430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014654	GAAG	2	8	171451	171458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014654	GAC	2	6	171500	171505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_014654	TTC	2	6	171581	171586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_014654	TAT	2	6	171591	171596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014654	AGG	2	6	171607	171612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014654	A	6	6	171654	171659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_014654	AAATA	2	10	173619	173628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014654	CAC	2	6	173667	173672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_014654	TAAA	2	8	173722	173729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014654	CCTT	2	8	175173	175180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_014654	TAG	2	6	175189	175194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_014654	CTT	2	6	175242	175247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014654	ATA	3	9	175729	175737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014654	ATC	2	6	176700	176705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014654	A	7	7	176707	176713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014654	TA	3	6	176718	176723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014654	T	7	7	176763	176769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014654	TTAA	2	8	176775	176782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014654	A	6	6	176806	176811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014654	ATT	3	9	176846	176854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014654	ATA	2	6	176855	176860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014654	TA	4	8	176883	176890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014654	AGG	2	6	176896	176901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1037	NC_014654	A	6	6	177200	177205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014654	AAAG	2	8	177239	177246	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014654	TAT	2	6	177996	178001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_014654	T	6	6	178052	178057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014654	AATT	2	8	178071	178078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_014654	AAAAAT	2	12	178089	178100	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_014654	ATA	2	6	178101	178106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014654	A	7	7	178116	178122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014654	TATTT	2	10	178940	178949	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014654	ACA	2	6	178979	178984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_014654	TAT	2	6	179010	179015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014654	T	6	6	179035	179040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1051	NC_014654	TA	3	6	181614	181619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014654	CTT	2	6	182637	182642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014654	A	7	7	182669	182675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014654	TAA	2	6	182700	182705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_014654	T	6	6	182733	182738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_014654	TGAG	2	8	182818	182825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014654	T	6	6	182831	182836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014654	TAA	2	6	182908	182913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014654	GTCTG	2	10	182922	182931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_014654	TTA	2	6	182938	182943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_014654	T	6	6	182973	182978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014654	CAT	2	6	182999	183004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_014654	T	6	6	183008	183013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014654	AAG	2	6	183048	183053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014654	TTCT	2	8	183148	183155	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_014654	TAT	2	6	183172	183177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014654	TTC	2	6	183188	183193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_014654	AGT	2	6	183262	183267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014654	A	6	6	183272	183277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014654	GTT	2	6	183463	183468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_014654	ATC	2	6	183635	183640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_014654	TGC	2	6	183790	183795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1082	NC_014654	TTTAT	2	10	183959	183968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_014654	TAA	2	6	184211	184216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014654	ATT	2	6	184232	184237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014654	TAATA	2	10	184253	184262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014654	TAA	2	6	184264	184269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014654	TTA	2	6	184284	184289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_014654	ATA	4	12	184299	184310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014654	ATT	2	6	184317	184322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014654	TAC	2	6	184328	184333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1101	NC_014654	GATTA	2	10	184394	184403	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014654	TAA	2	6	184410	184415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014654	G	6	6	185439	185444	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014654	TA	3	6	187775	187780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014654	ATTA	2	8	187803	187810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014654	ATA	2	6	187816	187821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014654	AAG	2	6	187828	187833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014654	TAC	2	6	187837	187842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_014654	TAG	2	6	189793	189798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1112	NC_014654	ATATA	2	10	190874	190883	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014654	AT	3	6	190897	190902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014654	AT	3	6	190933	190938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014654	T	6	6	190948	190953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_014654	ATT	2	6	190957	190962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014654	TTTA	2	8	190974	190981	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_014654	AAAG	2	8	190983	190990	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014654	TAA	2	6	193602	193607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_014654	TGG	2	6	193619	193624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014654	AAAT	2	8	194446	194453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014654	A	6	6	194458	194463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014654	AGAA	2	8	195279	195286	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014654	AGG	2	6	195309	195314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014654	A	7	7	196552	196558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_014654	AT	3	6	198032	198037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_014654	ATT	2	6	201577	201582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014654	AAT	3	9	201590	201598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014654	GAG	2	6	201617	201622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014654	TAT	3	9	201635	201643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014654	GCT	2	6	201647	201652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_014654	TAC	2	6	201653	201658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014654	AATAT	2	10	201688	201697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014654	ATC	2	6	201721	201726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_014654	A	6	6	203003	203008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014654	AT	3	6	203023	203028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1138	NC_014654	T	6	6	204384	204389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_014654	A	6	6	231852	231857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1267	NC_014654	ATGGC	2	10	232296	232305	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1269	NC_014654	CAT	2	6	232382	232387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_014654	TAT	2	6	232403	232408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_014654	T	8	8	232462	232469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_014654	TATT	2	8	232488	232495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1273	NC_014654	GAA	2	6	232503	232508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_014654	A	7	7	232520	232526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1275	NC_014654	AT	3	6	232585	232590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1415	NC_014654	GTG	2	6	259051	259056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_014654	TA	3	6	259065	259070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_014654	ATG	2	6	259159	259164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1419	NC_014654	A	6	6	259211	259216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_014654	TTA	2	6	259219	259224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_014654	ATT	2	6	259255	259260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_014654	TCC	2	6	260418	260423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1424	NC_014654	TTA	2	6	260443	260448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1431	NC_014654	AAT	2	6	267569	267574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1436	NC_014654	CTT	2	6	267631	267636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1438	NC_014654	TAA	2	6	268909	268914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_014654	AAT	4	12	268915	268926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1440	NC_014654	TTC	2	6	268937	268942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_014654	T	6	6	269123	269128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1449	NC_014654	A	6	6	269233	269238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1450	NC_014654	TA	4	8	269249	269256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_014654	CAT	2	6	269266	269271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1452	NC_014654	ATA	2	6	269275	269280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_014654	TTA	2	6	269282	269287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_014654	GTTAT	2	10	269298	269307	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1456	NC_014654	TAA	2	6	269318	269323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1463	NC_014654	T	7	7	269841	269847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1465	NC_014654	A	7	7	269881	269887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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