MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 10237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_014654	GCT	2	6	2284518	2284523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_014654	AGC	2	6	2284555	2284560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9003	NC_014654	GCT	2	6	2284569	2284574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_014654	AAT	2	6	2284577	2284582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_014654	TGA	2	6	2284595	2284600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_014654	A	6	6	2286708	2286713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_014654	ATTA	2	8	2286725	2286732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_014654	A	6	6	2286739	2286744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_014654	A	7	7	2286767	2286773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_014654	ACC	2	6	2287077	2287082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9011	NC_014654	TC	3	6	2287634	2287639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9012	NC_014654	TCC	2	6	2288306	2288311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9013	NC_014654	AT	3	6	2293436	2293441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_014654	TAAAA	2	10	2293447	2293456	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_014654	TAT	2	6	2293510	2293515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_014654	TTA	2	6	2293540	2293545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_014654	TGT	2	6	2293552	2293557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_014654	TGAAC	2	10	2293560	2293569	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9019	NC_014654	ATT	2	6	2293585	2293590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9020	NC_014654	TA	3	6	2293592	2293597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_014654	T	7	7	2293598	2293604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_014654	GCT	2	6	2293707	2293712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_014654	A	6	6	2293717	2293722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_014654	AT	3	6	2293730	2293735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9025	NC_014654	A	7	7	2293785	2293791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_014654	ATT	2	6	2293794	2293799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_014654	TCA	2	6	2293807	2293812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9029	NC_014654	ATTA	2	8	2293828	2293835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_014654	AGA	2	6	2293851	2293856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_014654	A	6	6	2294451	2294456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_014654	CTG	2	6	2294461	2294466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9033	NC_014654	TCC	2	6	2296663	2296668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9034	NC_014654	ATT	2	6	2296688	2296693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_014654	T	6	6	2296731	2296736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_014654	T	7	7	2297972	2297978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_014654	ATT	2	6	2297985	2297990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_014654	TTA	2	6	2300638	2300643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_014654	TAA	2	6	2300654	2300659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_014654	A	7	7	2300701	2300707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_014654	TCCC	2	8	2301353	2301360	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9042	NC_014654	T	6	6	2301378	2301383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_014654	AAT	2	6	2301406	2301411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_014654	TAT	2	6	2301430	2301435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_014654	ATT	2	6	2301442	2301447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_014654	T	6	6	2301469	2301474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_014654	TAT	2	6	2301516	2301521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_014654	CCT	2	6	2303765	2303770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9049	NC_014654	GCT	2	6	2303772	2303777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_014654	TAA	3	9	2303808	2303816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_014654	CAAAA	2	10	2303829	2303838	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9052	NC_014654	A	6	6	2303835	2303840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_014654	A	6	6	2303842	2303847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_014654	CCA	2	6	2303850	2303855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9055	NC_014654	ATT	2	6	2303898	2303903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_014654	ATTT	2	8	2303964	2303971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_014654	ACC	2	6	2304077	2304082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9058	NC_014654	ACC	2	6	2304106	2304111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9059	NC_014654	TC	3	6	2304133	2304138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9060	NC_014654	TAT	2	6	2304141	2304146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9062	NC_014654	TTC	2	6	2304187	2304192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9063	NC_014654	T	7	7	2304238	2304244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_014654	AACT	2	8	2304315	2304322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9065	NC_014654	CTG	2	6	2304384	2304389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9067	NC_014654	ACA	2	6	2304449	2304454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9069	NC_014654	T	7	7	2304566	2304572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_014654	CAGG	2	8	2304597	2304604	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9071	NC_014654	ACC	2	6	2304616	2304621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9072	NC_014654	TGT	2	6	2304658	2304663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9087	NC_014654	AAC	2	6	2304985	2304990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9088	NC_014654	T	8	8	2305062	2305069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_014654	GCT	2	6	2305072	2305077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9093	NC_014654	TTTTA	2	10	2306451	2306460	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_014654	AT	5	10	2306463	2306472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_014654	TAAA	2	8	2306474	2306481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9098	NC_014654	AAT	2	6	2306516	2306521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_014654	TA	3	6	2306544	2306549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_014654	ATA	3	9	2306547	2306555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_014654	A	6	6	2307112	2307117	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_014654	T	6	6	2307125	2307130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_014654	ATTT	2	8	2307142	2307149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_014654	CCT	2	6	2308483	2308488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9106	NC_014654	CAC	2	6	2308527	2308532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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9108	NC_014654	TAAAAA	2	12	2308555	2308566	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_014654	A	7	7	2308615	2308621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_014654	AAT	2	6	2308667	2308672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_014654	T	6	6	2308840	2308845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_014654	T	6	6	2308851	2308856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_014654	A	7	7	2308857	2308863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_014654	ATTTA	2	10	2308866	2308875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_014654	TAT	2	6	2308887	2308892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9117	NC_014654	AAT	2	6	2310704	2310709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9119	NC_014654	TAA	3	9	2322504	2322512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_014654	TTAA	2	8	2322515	2322522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_014654	CTTC	2	8	2322532	2322539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9122	NC_014654	A	6	6	2322550	2322555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_014654	GAA	2	6	2322585	2322590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_014654	TAT	2	6	2322608	2322613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9125	NC_014654	TC	3	6	2322644	2322649	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9126	NC_014654	CAA	2	6	2322691	2322696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9128	NC_014654	TTA	2	6	2322729	2322734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_014654	ATT	2	6	2322776	2322781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_014654	AT	3	6	2322782	2322787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_014654	TCC	2	6	2323803	2323808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9132	NC_014654	T	6	6	2323839	2323844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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