MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 10237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014654	TAAC	2	8	2157488	2157495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8502	NC_014654	TTATC	2	10	2157498	2157507	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8503	NC_014654	ATT	2	6	2157572	2157577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_014654	CCTC	3	12	2160063	2160074	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8505	NC_014654	GAT	2	6	2160084	2160089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_014654	AAAG	2	8	2160104	2160111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_014654	ATA	3	9	2160221	2160229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_014654	TAT	2	6	2160238	2160243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_014654	C	6	6	2161952	2161957	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8510	NC_014654	TTA	2	6	2161983	2161988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_014654	ATTT	2	8	2161989	2161996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8512	NC_014654	TAA	2	6	2162007	2162012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_014654	TAAT	2	8	2162048	2162055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_014654	CTC	2	6	2162862	2162867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8515	NC_014654	TCC	2	6	2163506	2163511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8516	NC_014654	ATT	2	6	2163528	2163533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_014654	ATT	2	6	2163552	2163557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_014654	TAA	2	6	2163624	2163629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_014654	AAT	2	6	2165557	2165562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_014654	CTA	2	6	2165571	2165576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_014654	TTAAA	2	10	2165641	2165650	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_014654	TAATA	2	10	2165680	2165689	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_014654	TCC	2	6	2167710	2167715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8524	NC_014654	A	6	6	2167740	2167745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_014654	ATA	2	6	2169214	2169219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_014654	ATA	2	6	2169225	2169230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_014654	TA	3	6	2169234	2169239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_014654	A	6	6	2169285	2169290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8529	NC_014654	A	8	8	2169293	2169300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_014654	A	6	6	2169682	2169687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_014654	TCC	2	6	2169689	2169694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_014654	ATATTG	2	12	2169699	2169710	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_014654	ATT	2	6	2169713	2169718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_014654	ACTT	2	8	2169722	2169729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8535	NC_014654	AT	3	6	2169746	2169751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_014654	ATGCA	2	10	2169784	2169793	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8537	NC_014654	T	6	6	2169797	2169802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_014654	TCTT	2	8	2169805	2169812	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8539	NC_014654	CCT	2	6	2170917	2170922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8540	NC_014654	T	7	7	2170973	2170979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_014654	TTA	2	6	2173193	2173198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_014654	TA	3	6	2173197	2173202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_014654	AT	3	6	2173541	2173546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8544	NC_014654	AAT	2	6	2173549	2173554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_014654	TAA	2	6	2173623	2173628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_014654	GCTTT	2	10	2173674	2173683	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8547	NC_014654	ATAA	2	8	2174058	2174065	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_014654	TCC	2	6	2175862	2175867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8549	NC_014654	CTC	2	6	2176187	2176192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8550	NC_014654	TC	3	6	2176191	2176196	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8551	NC_014654	ACT	2	6	2176210	2176215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_014654	T	6	6	2176561	2176566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_014654	TTTACT	2	12	2176570	2176581	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8554	NC_014654	AT	3	6	2177337	2177342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_014654	TA	3	6	2177354	2177359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_014654	T	6	6	2177367	2177372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_014654	A	7	7	2177409	2177415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8558	NC_014654	A	7	7	2177426	2177432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_014654	GCT	2	6	2177435	2177440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8561	NC_014654	TCC	2	6	2178594	2178599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8562	NC_014654	A	8	8	2179663	2179670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_014654	T	7	7	2179727	2179733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8564	NC_014654	A	6	6	2179736	2179741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_014654	TAT	2	6	2180409	2180414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8567	NC_014654	AT	3	6	2183341	2183346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_014654	AGC	2	6	2183383	2183388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8570	NC_014654	ATT	2	6	2183409	2183414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8571	NC_014654	TAA	2	6	2183427	2183432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_014654	TTA	2	6	2183445	2183450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_014654	TTTA	2	8	2183466	2183473	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_014654	TAT	2	6	2184792	2184797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_014654	AT	3	6	2184796	2184801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8576	NC_014654	TTA	2	6	2184909	2184914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8578	NC_014654	A	9	9	2184934	2184942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8584	NC_014654	ATT	2	6	2186639	2186644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8585	NC_014654	T	6	6	2186643	2186648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8589	NC_014654	ATT	2	6	2187809	2187814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8590	NC_014654	T	8	8	2187813	2187820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_014654	TAT	2	6	2187837	2187842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8593	NC_014654	AAT	2	6	2187871	2187876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_014654	T	7	7	2187888	2187894	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_014654	A	7	7	2187906	2187912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_014654	TTA	2	6	2187918	2187923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8599	NC_014654	T	6	6	2188122	2188127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_014654	TGG	2	6	2188152	2188157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8603	NC_014654	GGA	2	6	2188323	2188328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_014654	CGCTA	2	10	2188379	2188388	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8605	NC_014654	AAG	2	6	2188402	2188407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8609	NC_014654	TGG	2	6	2188470	2188475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8611	NC_014654	GA	4	8	2188667	2188674	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_014654	TGG	2	6	2188766	2188771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8613	NC_014654	ATA	2	6	2188952	2188957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8617	NC_014654	GGC	2	6	2189156	2189161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8620	NC_014654	A	6	6	2189245	2189250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_014654	GGA	2	6	2189307	2189312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_014654	ACC	2	6	2189361	2189366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8623	NC_014654	AAAT	2	8	2189398	2189405	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_014654	TAC	2	6	2189450	2189455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8627	NC_014654	TGG	2	6	2189601	2189606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8628	NC_014654	AAC	2	6	2189607	2189612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8629	NC_014654	GT	3	6	2189626	2189631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8632	NC_014654	ACG	2	6	2189710	2189715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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