MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halanaerobium hydrogeniformans chromosome

Total Repeats: 10237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014654	T	6	6	51	56	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014654	AGG	2	6	65	70	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014654	TTA	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014654	TAGA	2	8	1539	1546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014654	TAA	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014654	TAT	2	6	1603	1608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014654	ACT	2	6	1624	1629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014654	CTA	3	9	1668	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014654	TAC	2	6	1678	1683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014654	TAA	2	6	1693	1698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014654	A	7	7	1697	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014654	TAA	2	6	1730	1735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014654	AGG	2	6	2876	2881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014654	TTA	3	9	6427	6435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014654	TA	3	6	6434	6439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014654	AAT	2	6	6450	6455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014654	AAT	2	6	9047	9052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014654	T	7	7	9114	9120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014654	ATA	2	6	9127	9132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014654	A	7	7	9132	9138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014654	CAG	2	6	9154	9159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014654	TAT	2	6	9244	9249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014654	AGA	2	6	9253	9258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014654	ATC	2	6	9292	9297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014654	TTA	2	6	9298	9303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014654	AGA	2	6	9316	9321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014654	ATC	2	6	9354	9359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014654	AGA	2	6	9376	9381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014654	ATT	2	6	9451	9456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014654	TA	3	6	9470	9475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014654	AAT	2	6	9476	9481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014654	CAAAT	2	10	9488	9497	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014654	GGC	2	6	9539	9544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014654	CA	3	6	9712	9717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014654	GAG	2	6	9746	9751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014654	TAGC	2	8	9767	9774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014654	GCA	2	6	9873	9878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014654	CGC	2	6	9920	9925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014654	GTGA	2	8	9926	9933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014654	GAA	2	6	9969	9974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014654	GGA	2	6	10015	10020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014654	CAG	2	6	10041	10046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014654	ATT	2	6	10082	10087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014654	TCAAG	2	10	10115	10124	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014654	TAGTG	2	10	10203	10212	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014654	GAA	2	6	10233	10238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014654	CT	3	6	10257	10262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014654	GAA	2	6	10495	10500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014654	GGT	2	6	10571	10576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014654	GTC	2	6	10585	10590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014654	TCGTG	2	10	10594	10603	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014654	AAG	2	6	10676	10681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014654	GGA	2	6	10698	10703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014654	AC	3	6	10749	10754	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014654	TGGT	2	8	10764	10771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014654	AC	3	6	10918	10923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014654	GT	3	6	10980	10985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014654	CCT	2	6	11044	11049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014654	GA	3	6	11057	11062	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014654	AATAAA	2	12	11107	11118	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014654	A	6	6	11116	11121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014654	A	6	6	11125	11130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014654	AAAT	2	8	11132	11139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014654	CCA	2	6	11257	11262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014654	ACT	2	6	11278	11283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014654	GCCT	2	8	11313	11320	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014654	AGG	2	6	11328	11333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014654	CCA	2	6	11358	11363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014654	A	6	6	11408	11413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014654	AACT	2	8	11417	11424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014654	ATA	2	6	11474	11479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014654	TGG	2	6	11503	11508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014654	GAA	2	6	11529	11534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014654	GCT	2	6	11566	11571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014654	CCA	2	6	11610	11615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_014654	TAT	2	6	11630	11635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014654	AAG	2	6	11643	11648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014654	TAG	2	6	11724	11729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014654	GCGA	2	8	11732	11739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014654	T	6	6	11842	11847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014654	AG	3	6	11878	11883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014654	AAG	2	6	11911	11916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014654	ACC	2	6	11973	11978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014654	ACA	2	6	12086	12091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014654	AGG	2	6	12095	12100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014654	ATG	2	6	12223	12228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014654	GTT	2	6	12306	12311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014654	A	6	6	12313	12318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014654	CAA	2	6	12451	12456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014654	ACC	2	6	12554	12559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014654	AGC	2	6	12634	12639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014654	CATT	2	8	12640	12647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014654	AG	3	6	12805	12810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014654	TG	3	6	12823	12828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014654	AGT	2	6	12852	12857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014654	AGA	2	6	12867	12872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014654	GA	3	6	12871	12876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014654	A	6	6	12895	12900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014654	ATTG	2	8	13036	13043	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014654	AAG	2	6	13064	13069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014654	AGG	2	6	13118	13123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014654	GC	3	6	13272	13277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014654	GA	3	6	13278	13283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014654	CGG	2	6	13515	13520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014654	CAA	2	6	13609	13614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014654	AAATT	2	10	13626	13635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014654	TGG	2	6	13777	13782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014654	ACC	2	6	13786	13791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_014654	ACAA	2	8	13967	13974	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014654	CGG	2	6	14008	14013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014654	CGT	2	6	14204	14209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014654	GGA	2	6	14240	14245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014654	GAG	2	6	14251	14256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014654	AC	3	6	14288	14293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014654	GTT	2	6	14307	14312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014654	CCA	2	6	14313	14318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014654	AAAC	2	8	14377	14384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014654	GAT	2	6	14432	14437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014654	GTA	2	6	14464	14469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014654	ATTT	2	8	14514	14521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014654	GGT	2	6	14553	14558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014654	TCC	2	6	14607	14612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014654	T	6	6	14669	14674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014654	AT	3	6	14686	14691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014654	A	7	7	14700	14706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014654	A	7	7	14720	14726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014654	ATA	2	6	14735	14740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014654	ATA	2	6	14757	14762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014654	ATA	3	9	14773	14781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014654	TAA	2	6	14788	14793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014654	ATC	2	6	14834	14839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014654	T	6	6	14873	14878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014654	AAT	2	6	14894	14899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014654	TA	3	6	14943	14948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014654	GAT	2	6	14962	14967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014654	ATT	2	6	15028	15033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014654	ATT	2	6	15040	15045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014654	A	7	7	15057	15063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014654	A	7	7	15085	15091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014654	A	6	6	15097	15102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014654	ATA	2	6	15145	15150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014654	GTT	2	6	15184	15189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014654	T	7	7	15200	15206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014654	AT	3	6	15220	15225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014654	AATT	2	8	15263	15270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014654	ATA	2	6	15273	15278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014654	TAT	2	6	15288	15293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014654	TAT	2	6	15297	15302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014654	AGG	2	6	15324	15329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014654	AATT	2	8	16233	16240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014654	TAT	2	6	17858	17863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014654	ATT	2	6	17864	17869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014654	T	6	6	17908	17913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014654	TTTA	2	8	17931	17938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014654	A	6	6	17949	17954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014654	AGG	2	6	17963	17968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014654	GTTT	2	8	21672	21679	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014654	TAA	2	6	21729	21734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014654	TAA	2	6	21756	21761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014654	ATT	2	6	21785	21790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_014654	AG	4	8	21822	21829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014654	AATT	2	8	21839	21846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014654	T	6	6	21880	21885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014654	AAAT	2	8	21888	21895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014654	ATA	2	6	21900	21905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_014654	AGG	2	6	22937	22942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_014654	T	6	6	24068	24073	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014654	TA	3	6	24105	24110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014654	AAACAA	2	12	24126	24137	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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176	NC_014654	TATT	2	8	26392	26399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014654	ATT	2	6	26406	26411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014654	ATT	2	6	26421	26426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014654	AGG	2	6	26458	26463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_014654	ATA	2	6	27896	27901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_014654	ATTG	2	8	27998	28005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014654	ATA	2	6	28031	28036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014654	A	7	7	28048	28054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_014654	AAT	2	6	29171	29176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_014654	A	6	6	30585	30590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_014654	TAA	2	6	45060	45065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_014654	TTA	2	6	45095	45100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014654	ATA	2	6	45112	45117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014654	GGT	2	6	45202	45207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
280	NC_014654	TGG	2	6	45209	45214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014654	GTT	2	6	45270	45275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014654	TACACT	2	12	45286	45297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
283	NC_014654	ATT	2	6	45301	45306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014654	TA	7	14	45307	45320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_014654	CCA	2	6	45387	45392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
286	NC_014654	ACC	2	6	45394	45399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
287	NC_014654	TGACA	2	10	45406	45415	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_014654	GTGG	2	8	45447	45454	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014654	ATT	2	6	45484	45489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014654	T	8	8	45492	45499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014654	TGC	2	6	45512	45517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
292	NC_014654	AT	3	6	45565	45570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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