MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 3965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014560	GTTT	2	8	2427	2434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014560	GGT	2	6	4085	4090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014560	TAT	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014560	TGG	2	6	4176	4181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014560	ATGC	2	8	4280	4287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014560	TGG	2	6	4296	4301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014560	GTG	2	6	4412	4417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014560	ACC	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_014560	GGT	2	6	4457	4462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014560	T	8	8	4596	4603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014560	AAT	2	6	4617	4622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014560	AAC	2	6	4676	4681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014560	TAA	2	6	4801	4806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014560	TTA	2	6	4810	4815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014560	T	7	7	4827	4833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014560	A	6	6	4838	4843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014560	A	6	6	4854	4859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014560	TGT	2	6	4893	4898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014560	A	6	6	7325	7330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014560	GA	7	14	7364	7377	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014560	T	7	7	7388	7394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014560	T	15	15	7480	7494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014560	T	6	6	7525	7530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014560	GTTT	2	8	7535	7542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014560	GGT	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014560	TAA	3	9	9367	9375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014560	ATAA	2	8	9759	9766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014560	TTA	2	6	9789	9794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014560	ACTATA	2	12	9853	9864	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014560	ATT	2	6	9868	9873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014560	A	6	6	9921	9926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014560	TTA	2	6	9933	9938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014560	TATT	2	8	9959	9966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014560	A	6	6	9997	10002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014560	AGG	2	6	12828	12833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014560	T	6	6	13673	13678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014560	GCTTT	2	10	13686	13695	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014560	T	6	6	13693	13698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014560	ACC	2	6	13718	13723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_014560	T	7	7	13756	13762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014560	TTAA	2	8	13785	13792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014560	A	6	6	16727	16732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014560	CA	3	6	16773	16778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_014560	CTG	2	6	16794	16799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014560	A	7	7	16937	16943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014560	A	7	7	18371	18377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014560	AAACAC	2	12	18412	18423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014560	AATC	2	8	22826	22833	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014560	GGT	2	6	22883	22888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014560	TGT	2	6	22915	22920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014560	TCA	2	6	22927	22932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014560	TTTA	2	8	23193	23200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014560	A	6	6	23207	23212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014560	T	6	6	23225	23230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014560	ATGAA	2	10	25478	25487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014560	ATTA	2	8	25582	25589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014560	A	13	13	25607	25619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014560	T	7	7	25797	25803	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014560	C	6	6	25832	25837	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_014560	A	6	6	25857	25862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014560	GGT	2	6	25865	25870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014560	A	6	6	25931	25936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014560	TTA	2	6	26061	26066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014560	GAT	2	6	27389	27394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014560	A	6	6	27413	27418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014560	T	6	6	27448	27453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014560	A	6	6	27491	27496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014560	TA	3	6	27510	27515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014560	T	6	6	28850	28855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014560	GGTT	2	8	31982	31989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014560	TAA	2	6	40623	40628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014560	A	6	6	40633	40638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014560	AG	3	6	40643	40648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014560	A	7	7	42080	42086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014560	CAAA	2	8	44267	44274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014560	CTT	2	6	44423	44428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014560	AAAC	2	8	44437	44444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014560	AG	4	8	44457	44464	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014560	TC	3	6	44507	44512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014560	CTGT	2	8	44542	44549	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014560	CTT	2	6	44619	44624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014560	AAAT	2	8	44641	44648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014560	GATT	2	8	44727	44734	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014560	TTTC	2	8	44934	44941	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014560	TAG	2	6	44956	44961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014560	AG	3	6	44997	45002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014560	A	6	6	51127	51132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014560	T	6	6	51235	51240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014560	GTA	2	6	51336	51341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014560	AAAG	2	8	51376	51383	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014560	CTT	2	6	51388	51393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014560	ATC	2	6	51408	51413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014560	TGA	2	6	51458	51463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014560	AATC	2	8	51498	51505	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014560	T	7	7	51533	51539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014560	TTG	2	6	51549	51554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014560	ATT	2	6	51561	51566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014560	TGT	2	6	51612	51617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014560	TAA	2	6	51637	51642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014560	CAT	2	6	51647	51652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014560	AGT	2	6	51660	51665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014560	AAAT	2	8	51736	51743	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014560	TAAAAT	2	12	51800	51811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014560	AAT	2	6	51848	51853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014560	AAG	2	6	51883	51888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014560	A	8	8	51901	51908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014560	TGC	2	6	51924	51929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014560	A	6	6	51940	51945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014560	T	6	6	51961	51966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014560	ATA	2	6	52000	52005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014560	GATTG	2	10	52143	52152	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014560	TTC	2	6	52207	52212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014560	AC	3	6	52246	52251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014560	CAA	2	6	52288	52293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014560	CAA	2	6	52342	52347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014560	T	6	6	52358	52363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014560	CTA	2	6	52415	52420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014560	GATAA	2	10	52443	52452	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014560	TTTA	2	8	61345	61352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014560	TAA	2	6	61406	61411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014560	ATTTTT	2	12	61414	61425	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014560	GTT	2	6	61428	61433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014560	ATT	2	6	61453	61458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014560	T	7	7	61467	61473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014560	ATT	2	6	61484	61489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014560	T	6	6	61517	61522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014560	ATC	2	6	61567	61572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014560	TTAAA	2	10	61616	61625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014560	ACAA	2	8	61645	61652	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014560	TTA	2	6	61877	61882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014560	A	6	6	61892	61897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014560	G	7	7	61898	61904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014560	TAA	2	6	61905	61910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014560	A	6	6	62127	62132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014560	AGA	2	6	62147	62152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014560	TC	3	6	62173	62178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014560	GCT	2	6	62188	62193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014560	T	6	6	62193	62198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014560	A	7	7	62243	62249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014560	AAG	2	6	62263	62268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014560	CTAG	2	8	62310	62317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014560	CAG	2	6	62377	62382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014560	A	6	6	62383	62388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014560	CTAA	2	8	62436	62443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014560	GAA	2	6	64015	64020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014560	AGA	2	6	64023	64028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014560	AGA	2	6	64058	64063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014560	TTA	2	6	64076	64081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014560	T	6	6	64082	64087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014560	AAAAGA	2	12	64112	64123	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014560	CAA	2	6	64133	64138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014560	ATC	2	6	64183	64188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014560	A	6	6	64193	64198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014560	A	6	6	64201	64206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014560	AAAAGA	2	12	64217	64228	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014560	A	7	7	64235	64241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_014560	A	6	6	72511	72516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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