MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SJM180 chromosome

Total Repeats: 3965

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014560	T	6	6	1464557	1464562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_014560	TCA	2	6	1465635	1465640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_014560	T	6	6	1465960	1465965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_014560	TTA	2	6	1466050	1466055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_014560	TGT	2	6	1466129	1466134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_014560	TCA	2	6	1466141	1466146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_014560	GCTT	2	8	1466790	1466797	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3508	NC_014560	ATT	2	6	1466808	1466813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_014560	TAT	2	6	1471083	1471088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_014560	TGT	2	6	1471393	1471398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_014560	T	6	6	1471460	1471465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_014560	T	6	6	1471474	1471479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_014560	AAC	2	6	1471488	1471493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_014560	CTAAGT	2	12	1471526	1471537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3515	NC_014560	CTA	2	6	1471538	1471543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_014560	TAAA	2	8	1471569	1471576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_014560	TCAA	2	8	1473961	1473968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_014560	ACCCCC	2	12	1474014	1474025	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
3519	NC_014560	TAAAA	2	10	1474041	1474050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_014560	A	6	6	1474059	1474064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_014560	A	6	6	1474074	1474079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_014560	CAAC	2	8	1474087	1474094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_014560	A	6	6	1474117	1474122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_014560	A	6	6	1474142	1474147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_014560	ATCA	2	8	1474166	1474173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_014560	A	6	6	1474210	1474215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_014560	CAA	2	6	1474247	1474252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_014560	AGG	2	6	1474320	1474325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_014560	TG	4	8	1474381	1474388	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_014560	GT	3	6	1474624	1474629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_014560	ATG	2	6	1474649	1474654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_014560	CGT	2	6	1474661	1474666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_014560	TCC	3	9	1474675	1474683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3534	NC_014560	CACGA	2	10	1474775	1474784	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3535	NC_014560	GAC	2	6	1474788	1474793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3536	NC_014560	GCA	2	6	1474800	1474805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_014560	TC	3	6	1474855	1474860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_014560	TTC	2	6	1474881	1474886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_014560	GA	3	6	1475009	1475014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_014560	CAA	2	6	1475025	1475030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_014560	CATC	2	8	1475035	1475042	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3542	NC_014560	CAG	2	6	1475120	1475125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_014560	ACCT	2	8	1475189	1475196	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3544	NC_014560	TAG	2	6	1475213	1475218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_014560	CTGA	2	8	1475260	1475267	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3546	NC_014560	GCT	2	6	1475336	1475341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_014560	TCT	2	6	1475385	1475390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_014560	TCC	2	6	1475425	1475430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_014560	TGC	2	6	1475440	1475445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_014560	CTG	2	6	1475479	1475484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_014560	GT	3	6	1475520	1475525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_014560	TTACC	2	10	1475573	1475582	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3553	NC_014560	ATC	2	6	1475653	1475658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_014560	CGC	2	6	1475778	1475783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_014560	T	6	6	1475846	1475851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_014560	TGT	2	6	1475859	1475864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_014560	AAC	2	6	1475872	1475877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_014560	ACA	3	9	1475946	1475954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_014560	AGAA	2	8	1475959	1475966	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_014560	TCA	2	6	1476026	1476031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3561	NC_014560	CAT	2	6	1476048	1476053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_014560	TGC	2	6	1484903	1484908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_014560	A	6	6	1484956	1484961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_014560	A	6	6	1485047	1485052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_014560	CT	3	6	1487349	1487354	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_014560	GTTT	2	8	1487555	1487562	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_014560	A	6	6	1487586	1487591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_014560	T	6	6	1487660	1487665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_014560	A	6	6	1487693	1487698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_014560	ACGCC	2	10	1487843	1487852	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3571	NC_014560	AAT	2	6	1487859	1487864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_014560	TGAA	2	8	1487878	1487885	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_014560	TCTAA	2	10	1490428	1490437	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3574	NC_014560	AC	3	6	1490438	1490443	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_014560	T	8	8	1490477	1490484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_014560	TTAA	2	8	1490558	1490565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_014560	T	6	6	1490572	1490577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_014560	AACA	2	8	1490578	1490585	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3579	NC_014560	T	6	6	1490612	1490617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3580	NC_014560	ATA	2	6	1490629	1490634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3581	NC_014560	A	6	6	1490666	1490671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3582	NC_014560	A	6	6	1490677	1490682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_014560	ACA	2	6	1490706	1490711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_014560	CCG	2	6	1491072	1491077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_014560	TACC	2	8	1495537	1495544	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_014560	A	6	6	1495552	1495557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_014560	GTG	2	6	1495577	1495582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_014560	ATT	2	6	1495584	1495589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_014560	TGG	2	6	1495596	1495601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3590	NC_014560	TAA	2	6	1495605	1495610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_014560	AAT	2	6	1496754	1496759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_014560	A	6	6	1496769	1496774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_014560	TAT	2	6	1496796	1496801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_014560	GT	3	6	1500465	1500470	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_014560	CTG	2	6	1500482	1500487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_014560	TGA	2	6	1500531	1500536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3597	NC_014560	TTG	2	6	1500575	1500580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3598	NC_014560	T	6	6	1500602	1500607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_014560	AACAA	2	10	1500617	1500626	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3600	NC_014560	A	6	6	1500625	1500630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_014560	ACA	2	6	1500647	1500652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3602	NC_014560	TCC	2	6	1501252	1501257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_014560	AT	3	6	1504668	1504673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_014560	TC	3	6	1504674	1504679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_014560	T	6	6	1507335	1507340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_014560	TATAT	2	10	1507352	1507361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_014560	ATA	3	9	1507396	1507404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3608	NC_014560	T	6	6	1507407	1507412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3609	NC_014560	A	7	7	1507426	1507432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_014560	AGCG	2	8	1510172	1510179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3611	NC_014560	A	6	6	1513461	1513466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_014560	CTT	2	6	1523971	1523976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_014560	T	6	6	1523975	1523980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_014560	T	6	6	1528237	1528242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_014560	AT	3	6	1531152	1531157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_014560	TCA	2	6	1532827	1532832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_014560	GTT	2	6	1532895	1532900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3618	NC_014560	GAT	2	6	1533234	1533239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3619	NC_014560	T	6	6	1536168	1536173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_014560	TTATT	2	10	1536189	1536198	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_014560	T	6	6	1543209	1543214	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_014560	ATT	2	6	1543216	1543221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_014560	TTA	2	6	1543222	1543227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_014560	CAAA	2	8	1543251	1543258	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3625	NC_014560	ACC	2	6	1543260	1543265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3626	NC_014560	ATA	2	6	1543278	1543283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_014560	TAG	2	6	1543313	1543318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3628	NC_014560	TTA	2	6	1549137	1549142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_014560	TTA	2	6	1549155	1549160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3630	NC_014560	TAATA	2	10	1549161	1549170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3631	NC_014560	C	6	6	1549171	1549176	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3632	NC_014560	TTAG	2	8	1549190	1549197	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3634	NC_014560	TAT	2	6	1553289	1553294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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