MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 14524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014323	TA	3	6	581139	581144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014323	GCC	2	6	581195	581200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_014323	GAG	2	6	581204	581209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014323	GCC	2	6	583108	583113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_014323	T	7	7	583132	583138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014323	GC	3	6	583154	583159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_014323	CCG	2	6	585105	585110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_014323	TGGCG	2	10	585114	585123	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1509	NC_014323	T	7	7	585137	585143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014323	CTT	2	6	585195	585200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_014323	T	6	6	585199	585204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014323	CAT	2	6	585233	585238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_014323	CGCGC	2	10	587447	587456	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1514	NC_014323	TGG	2	6	587477	587482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_014323	GCG	2	6	587502	587507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_014323	GGAG	2	8	587517	587524	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014323	GCC	2	6	590582	590587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_014323	TTCT	2	8	590708	590715	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1519	NC_014323	CAA	2	6	590726	590731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_014323	TC	3	6	590815	590820	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_014323	GGA	2	6	590843	590848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_014323	AC	3	6	590862	590867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1523	NC_014323	TTC	2	6	592521	592526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_014323	GGC	2	6	595687	595692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_014323	GGT	2	6	595706	595711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014323	GGT	2	6	595732	595737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_014323	TCGG	2	8	595758	595765	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_014323	GGC	2	6	595786	595791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_014323	AAC	2	6	595800	595805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_014323	TGA	2	6	595887	595892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014323	GCA	2	6	595922	595927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_014323	TCT	2	6	597375	597380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_014323	TGC	2	6	597412	597417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_014323	CCGG	2	8	597434	597441	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1535	NC_014323	GTC	2	6	597446	597451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_014323	GC	3	6	597459	597464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_014323	TGT	2	6	597699	597704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_014323	GGTC	2	8	597706	597713	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1539	NC_014323	CTG	2	6	599519	599524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_014323	CT	4	8	600494	600501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1541	NC_014323	TGGC	2	8	600540	600547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1542	NC_014323	GGT	2	6	600578	600583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014323	GT	3	6	600588	600593	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014323	TGC	2	6	600668	600673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_014323	AGC	2	6	600709	600714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_014323	AG	3	6	600727	600732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_014323	GCG	2	6	600744	600749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_014323	GGCGC	2	10	602436	602445	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1549	NC_014323	TCA	2	6	605117	605122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_014323	TCG	2	6	607303	607308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_014323	CAG	3	9	607317	607325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_014323	TCCA	2	8	607396	607403	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1553	NC_014323	GCT	2	6	607404	607409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_014323	TCA	2	6	607471	607476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_014323	CCG	2	6	607502	607507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_014323	GGC	2	6	607527	607532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_014323	GGAAAG	2	12	607561	607572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014323	GCC	2	6	607573	607578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_014323	GGC	2	6	607584	607589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_014323	G	6	6	608170	608175	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014323	CAG	2	6	608176	608181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_014323	GCT	2	6	608188	608193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_014323	CGC	2	6	609246	609251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_014323	CTG	2	6	609442	609447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_014323	CAG	2	6	609478	609483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014323	GTC	2	6	609504	609509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_014323	CGG	2	6	610482	610487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_014323	CGC	3	9	610496	610504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_014323	A	7	7	611099	611105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014323	CCG	2	6	611110	611115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_014323	ACGG	2	8	611123	611130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_014323	GCT	2	6	611131	611136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_014323	GC	3	6	611137	611142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_014323	ATG	2	6	611669	611674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014323	A	6	6	611691	611696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014323	AAAG	2	8	611724	611731	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_014323	A	6	6	612014	612019	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014323	GCCA	2	8	612070	612077	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_014323	ACT	2	6	612109	612114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_014323	GAA	2	6	612136	612141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_014323	GCGA	2	8	612176	612183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_014323	GCA	2	6	612254	612259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_014323	CTCC	2	8	612278	612285	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1584	NC_014323	ACG	2	6	612344	612349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_014323	CG	3	6	612353	612358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_014323	CGT	2	6	612427	612432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_014323	TGGCG	2	10	612529	612538	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1588	NC_014323	CGTT	2	8	612540	612547	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1589	NC_014323	GCC	2	6	612575	612580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_014323	GCG	2	6	612832	612837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_014323	TACTG	2	10	612901	612910	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1592	NC_014323	GAA	3	9	612922	612930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014323	GGC	2	6	612979	612984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_014323	CGCC	2	8	613357	613364	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1595	NC_014323	GGTTGC	2	12	613365	613376	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1596	NC_014323	GT	3	6	613395	613400	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014323	TTG	2	6	613416	613421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014323	TCC	2	6	613440	613445	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_014323	CAT	2	6	613531	613536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_014323	GCC	2	6	614063	614068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_014323	GC	3	6	614069	614074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_014323	TCG	2	6	614180	614185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_014323	CCGC	2	8	614193	614200	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1604	NC_014323	GC	3	6	614204	614209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1605	NC_014323	CAA	2	6	614251	614256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_014323	CGC	2	6	614304	614309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_014323	AGGC	2	8	614314	614321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1608	NC_014323	GCC	2	6	615527	615532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_014323	CA	3	6	615642	615647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_014323	ACC	2	6	615651	615656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1611	NC_014323	GCAG	2	8	615685	615692	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_014323	ATC	2	6	615740	615745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_014323	TC	3	6	616730	616735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_014323	CCCA	2	8	617883	617890	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1615	NC_014323	TCC	2	6	618613	618618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1616	NC_014323	TGG	2	6	618629	618634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014323	TCC	2	6	618649	618654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_014323	ATT	2	6	618668	618673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_014323	ATT	2	6	618680	618685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_014323	GGA	2	6	618729	618734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_014323	GAA	2	6	620541	620546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_014323	A	6	6	621135	621140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014323	ATC	2	6	621202	621207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_014323	TC	3	6	621206	621211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_014323	GC	3	6	621254	621259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_014323	TTGT	2	8	621282	621289	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014323	GA	3	6	621322	621327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_014323	GCTCCT	2	12	621426	621437	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_014323	CTT	2	6	621493	621498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_014323	CCT	2	6	621913	621918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_014323	ACCAT	2	10	621937	621946	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1632	NC_014323	ATT	2	6	621971	621976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_014323	ACG	2	6	622635	622640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_014323	GAA	2	6	622643	622648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_014323	AAT	3	9	623404	623412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_014323	GCA	2	6	625127	625132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_014323	CGG	3	9	625134	625142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_014323	GATC	2	8	627111	627118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1639	NC_014323	TTG	2	6	628649	628654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1661	NC_014323	AGT	2	6	636338	636343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1756	NC_014323	ACCTG	2	10	677844	677853	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1757	NC_014323	CGC	3	9	677865	677873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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