MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 14524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014323	GCA	2	6	5369617	5369622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14002	NC_014323	CTA	2	6	5369638	5369643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14003	NC_014323	GCG	2	6	5370818	5370823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14004	NC_014323	CGG	2	6	5370881	5370886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14005	NC_014323	TCC	2	6	5370964	5370969	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14006	NC_014323	TCC	2	6	5370997	5371002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14007	NC_014323	CCAGC	2	10	5371575	5371584	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14008	NC_014323	CTC	2	6	5371642	5371647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14009	NC_014323	GC	3	6	5371663	5371668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14010	NC_014323	CATG	2	8	5372538	5372545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14011	NC_014323	TTC	2	6	5372568	5372573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14012	NC_014323	CGC	2	6	5373544	5373549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14013	NC_014323	GCC	2	6	5373565	5373570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14014	NC_014323	CAG	2	6	5374152	5374157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14015	NC_014323	TCA	3	9	5374181	5374189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14016	NC_014323	GCTC	2	8	5374192	5374199	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14017	NC_014323	GTCA	2	8	5374207	5374214	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14018	NC_014323	GTCA	2	8	5374216	5374223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14019	NC_014323	CAT	2	6	5376909	5376914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14020	NC_014323	CCG	2	6	5376923	5376928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14021	NC_014323	GAA	2	6	5376939	5376944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14022	NC_014323	CAC	2	6	5376949	5376954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14023	NC_014323	CAC	2	6	5376961	5376966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14024	NC_014323	GAG	2	6	5376971	5376976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14025	NC_014323	AG	3	6	5379293	5379298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14026	NC_014323	GAG	2	6	5380955	5380960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14027	NC_014323	ATC	2	6	5384518	5384523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14028	NC_014323	CAGA	2	8	5384528	5384535	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14029	NC_014323	GCCC	2	8	5384541	5384548	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14030	NC_014323	CGC	2	6	5385503	5385508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14031	NC_014323	TCA	2	6	5385515	5385520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_014323	CAGA	2	8	5385551	5385558	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14033	NC_014323	GCGCTG	2	12	5385583	5385594	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14034	NC_014323	CAG	2	6	5385601	5385606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14035	NC_014323	CTG	2	6	5385616	5385621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14036	NC_014323	CCG	2	6	5385628	5385633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14037	NC_014323	CG	3	6	5385666	5385671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14038	NC_014323	CGC	2	6	5385679	5385684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14039	NC_014323	CTT	2	6	5385691	5385696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14040	NC_014323	CCGCC	2	10	5385717	5385726	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14041	NC_014323	ACG	2	6	5385731	5385736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14042	NC_014323	GCC	2	6	5385740	5385745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_014323	GAT	2	6	5385751	5385756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14044	NC_014323	CAA	2	6	5385802	5385807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14045	NC_014323	TCGG	2	8	5385922	5385929	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14046	NC_014323	ATAA	2	8	5385942	5385949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14047	NC_014323	CAA	2	6	5385974	5385979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14048	NC_014323	GA	3	6	5386074	5386079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14049	NC_014323	GC	3	6	5387060	5387065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14050	NC_014323	GC	3	6	5387069	5387074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14051	NC_014323	CTTT	2	8	5387124	5387131	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14052	NC_014323	T	7	7	5387129	5387135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14053	NC_014323	CCG	2	6	5387212	5387217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14054	NC_014323	C	6	6	5387228	5387233	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14055	NC_014323	TCA	2	6	5387274	5387279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14056	NC_014323	GGC	2	6	5387292	5387297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14057	NC_014323	CTG	2	6	5387302	5387307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_014323	AGA	2	6	5387400	5387405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_014323	ATCG	2	8	5387515	5387522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_014323	GC	3	6	5387533	5387538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14061	NC_014323	CGG	2	6	5387625	5387630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14062	NC_014323	TGA	2	6	5387634	5387639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_014323	AAGG	2	8	5387647	5387654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_014323	GC	3	6	5387661	5387666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14065	NC_014323	GCC	2	6	5387676	5387681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14066	NC_014323	AGC	2	6	5387684	5387689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14067	NC_014323	GGA	2	6	5387709	5387714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_014323	GGCC	2	8	5387716	5387723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14069	NC_014323	AGA	2	6	5388451	5388456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_014323	TAT	2	6	5389720	5389725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14071	NC_014323	CGG	2	6	5389769	5389774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14072	NC_014323	G	6	6	5389787	5389792	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_014323	CGG	2	6	5389804	5389809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14074	NC_014323	TCAACG	2	12	5389824	5389835	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14075	NC_014323	GAC	2	6	5389880	5389885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14076	NC_014323	GCG	3	9	5389900	5389908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14077	NC_014323	TCG	2	6	5392687	5392692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14078	NC_014323	TCC	2	6	5392704	5392709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14079	NC_014323	AG	3	6	5392740	5392745	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14080	NC_014323	GC	3	6	5392797	5392802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14081	NC_014323	GAAA	3	12	5392807	5392818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14082	NC_014323	GAA	2	6	5392823	5392828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14083	NC_014323	AGA	2	6	5392833	5392838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14084	NC_014323	A	6	6	5392845	5392850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14085	NC_014323	CGC	2	6	5392851	5392856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14086	NC_014323	CG	3	6	5392879	5392884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14087	NC_014323	CTG	2	6	5392914	5392919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14088	NC_014323	GCC	2	6	5394065	5394070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14089	NC_014323	CGG	2	6	5394852	5394857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14090	NC_014323	GTG	2	6	5394871	5394876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14091	NC_014323	GCT	2	6	5395564	5395569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14092	NC_014323	GTC	2	6	5395626	5395631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14093	NC_014323	TGA	2	6	5395633	5395638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14094	NC_014323	GGC	2	6	5395649	5395654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14095	NC_014323	A	6	6	5395691	5395696	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14096	NC_014323	GCC	2	6	5395704	5395709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14097	NC_014323	GC	3	6	5398056	5398061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14098	NC_014323	GCC	2	6	5399080	5399085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14099	NC_014323	TGC	2	6	5399124	5399129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14100	NC_014323	GC	3	6	5399128	5399133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14101	NC_014323	CGC	2	6	5399268	5399273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14102	NC_014323	GGCG	2	8	5399274	5399281	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14103	NC_014323	A	9	9	5399303	5399311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_014323	CGC	2	6	5399312	5399317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14105	NC_014323	GCG	2	6	5399329	5399334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14106	NC_014323	TGC	2	6	5399338	5399343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14107	NC_014323	GGTC	2	8	5401993	5402000	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14108	NC_014323	ATG	2	6	5403243	5403248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_014323	GCC	2	6	5403281	5403286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14110	NC_014323	CAA	2	6	5403349	5403354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14111	NC_014323	TC	3	6	5403386	5403391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14112	NC_014323	AGCG	2	8	5403464	5403471	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14113	NC_014323	GAG	2	6	5403474	5403479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_014323	AGC	2	6	5406701	5406706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14115	NC_014323	CGC	2	6	5406715	5406720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14116	NC_014323	CAT	2	6	5406753	5406758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_014323	CAA	2	6	5407679	5407684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14118	NC_014323	CG	4	8	5407692	5407699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14119	NC_014323	GCC	2	6	5407748	5407753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14120	NC_014323	TTG	2	6	5407811	5407816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14121	NC_014323	CCTC	2	8	5407878	5407885	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14122	NC_014323	A	6	6	5407961	5407966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14123	NC_014323	TTC	2	6	5407967	5407972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14124	NC_014323	CAC	2	6	5407993	5407998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14125	NC_014323	TTG	3	9	5409261	5409269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14126	NC_014323	TTC	2	6	5409282	5409287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14127	NC_014323	CGC	2	6	5409303	5409308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14128	NC_014323	CAA	2	6	5409347	5409352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14129	NC_014323	GGC	2	6	5409380	5409385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14130	NC_014323	TCCG	2	8	5409399	5409406	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14131	NC_014323	CGA	2	6	5409438	5409443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14132	NC_014323	GCCCG	2	10	5409466	5409475	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14133	NC_014323	CAT	2	6	5413118	5413123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14141	NC_014323	GCCG	2	8	5415063	5415070	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14144	NC_014323	TGCT	2	8	5424140	5424147	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14169	NC_014323	AGC	2	6	5428711	5428716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14241	NC_014323	CT	3	6	5433470	5433475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14242	NC_014323	CAG	3	9	5433669	5433677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14245	NC_014323	T	6	6	5433720	5433725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14246	NC_014323	ACT	2	6	5433769	5433774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14247	NC_014323	ACT	2	6	5433804	5433809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14248	NC_014323	TCG	2	6	5433827	5433832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14249	NC_014323	CTTCG	2	10	5433846	5433855	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14250	NC_014323	CAG	2	6	5433866	5433871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14251	NC_014323	CCA	2	6	5433890	5433895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14252	NC_014323	AAT	2	6	5433921	5433926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14253	NC_014323	AGA	2	6	5433938	5433943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14254	NC_014323	CAG	2	6	5433968	5433973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14256	NC_014323	ACC	2	6	5434015	5434020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14257	NC_014323	GACGG	2	10	5434049	5434058	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14258	NC_014323	TTC	2	6	5434070	5434075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14259	NC_014323	TA	3	6	5434469	5434474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14260	NC_014323	TA	3	6	5434492	5434497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14261	NC_014323	CAG	2	6	5434532	5434537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14274	NC_014323	TGC	2	6	5439656	5439661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14370	NC_014323	GC	3	6	5475792	5475797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14371	NC_014323	T	7	7	5475816	5475822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14378	NC_014323	CAA	3	9	5476376	5476384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14380	NC_014323	CCCG	2	8	5478557	5478564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14381	NC_014323	TGG	2	6	5480370	5480375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14387	NC_014323	GGCC	2	8	5480564	5480571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14388	NC_014323	CAT	2	6	5483006	5483011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14499	NC_014323	CCG	2	6	5512473	5512478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14500	NC_014323	GCCA	2	8	5512490	5512497	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

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