MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 14524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014323	CGC	2	6	5167687	5167692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13502	NC_014323	GGC	2	6	5168544	5168549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13503	NC_014323	A	6	6	5168601	5168606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_014323	CGC	2	6	5168683	5168688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13505	NC_014323	GGC	2	6	5169376	5169381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_014323	TTATCG	2	12	5170639	5170650	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13507	NC_014323	GCT	2	6	5170805	5170810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_014323	TCC	2	6	5170847	5170852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13509	NC_014323	GGC	2	6	5171418	5171423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_014323	GAT	2	6	5173915	5173920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_014323	GCG	2	6	5173937	5173942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_014323	TGGA	2	8	5173950	5173957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_014323	A	7	7	5174004	5174010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_014323	CCG	2	6	5174011	5174016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13515	NC_014323	AAG	2	6	5175597	5175602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_014323	TGA	2	6	5175617	5175622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13517	NC_014323	CGG	2	6	5175653	5175658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13518	NC_014323	GC	3	6	5175674	5175679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13519	NC_014323	GC	3	6	5175708	5175713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13520	NC_014323	GTT	2	6	5176605	5176610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_014323	AAAT	2	8	5176628	5176635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_014323	GTA	2	6	5176640	5176645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_014323	GCG	2	6	5177197	5177202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_014323	GA	3	6	5178193	5178198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13525	NC_014323	GC	3	6	5180599	5180604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13526	NC_014323	GAT	2	6	5180620	5180625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_014323	CTGCC	2	10	5180752	5180761	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13528	NC_014323	TC	3	6	5180773	5180778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13529	NC_014323	CCG	2	6	5180784	5180789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13530	NC_014323	GC	3	6	5181546	5181551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13531	NC_014323	GC	3	6	5181570	5181575	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13532	NC_014323	CCAT	2	8	5182048	5182055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13533	NC_014323	G	10	10	5182066	5182075	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_014323	GCG	2	6	5182459	5182464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_014323	ATCC	2	8	5182489	5182496	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13536	NC_014323	GCG	2	6	5185018	5185023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_014323	GGC	2	6	5185033	5185038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_014323	GCC	2	6	5185759	5185764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13539	NC_014323	GCC	2	6	5185771	5185776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13540	NC_014323	CGG	2	6	5186275	5186280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_014323	TGC	2	6	5186294	5186299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13542	NC_014323	GGC	2	6	5186318	5186323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_014323	AGA	2	6	5186361	5186366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_014323	CTT	2	6	5186373	5186378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_014323	GAA	2	6	5187336	5187341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_014323	CA	3	6	5187544	5187549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13547	NC_014323	AGC	2	6	5187550	5187555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_014323	CTC	2	6	5187573	5187578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13549	NC_014323	CATC	2	8	5187607	5187614	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13550	NC_014323	CCT	2	6	5187775	5187780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13551	NC_014323	GAA	2	6	5187784	5187789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_014323	ATT	2	6	5188849	5188854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_014323	GAAC	2	8	5188931	5188938	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13554	NC_014323	CCTTC	2	10	5188960	5188969	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13555	NC_014323	TGGC	2	8	5189033	5189040	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13556	NC_014323	TGG	2	6	5189060	5189065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_014323	A	9	9	5189717	5189725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_014323	GCG	2	6	5189787	5189792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_014323	GCC	3	9	5189796	5189804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13560	NC_014323	TTG	2	6	5190893	5190898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_014323	TCT	2	6	5190946	5190951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_014323	ACGG	2	8	5190987	5190994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13563	NC_014323	GAC	2	6	5194060	5194065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13564	NC_014323	CGC	2	6	5194073	5194078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13565	NC_014323	GAAC	2	8	5194129	5194136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13566	NC_014323	ATG	2	6	5194222	5194227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_014323	ATG	2	6	5194240	5194245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_014323	AAT	2	6	5194248	5194253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13569	NC_014323	TGA	4	12	5195371	5195382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_014323	CAG	2	6	5195433	5195438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_014323	GGCA	2	8	5196412	5196419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13572	NC_014323	ATG	2	6	5196448	5196453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_014323	T	7	7	5196468	5196474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13574	NC_014323	GCT	2	6	5196541	5196546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13575	NC_014323	CAC	2	6	5196595	5196600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13576	NC_014323	GCG	2	6	5198835	5198840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13577	NC_014323	C	6	6	5200660	5200665	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13578	NC_014323	GAAATA	3	18	5200669	5200686	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13579	NC_014323	AGT	2	6	5200694	5200699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13580	NC_014323	CGT	2	6	5200715	5200720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13581	NC_014323	GCA	2	6	5200747	5200752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_014323	CAAAA	2	10	5200764	5200773	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13583	NC_014323	CCG	2	6	5200774	5200779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13584	NC_014323	CGG	2	6	5200796	5200801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13585	NC_014323	GTTCT	2	10	5202510	5202519	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13586	NC_014323	CCGGA	2	10	5203814	5203823	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13587	NC_014323	T	6	6	5203849	5203854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13588	NC_014323	A	6	6	5203907	5203912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13589	NC_014323	GCG	2	6	5205307	5205312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13590	NC_014323	TGC	2	6	5205347	5205352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13591	NC_014323	GCC	2	6	5205353	5205358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13592	NC_014323	GC	3	6	5205362	5205367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13593	NC_014323	ACCC	2	8	5205379	5205386	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13594	NC_014323	CGC	2	6	5206150	5206155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13595	NC_014323	TTA	2	6	5206206	5206211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13596	NC_014323	GC	3	6	5206250	5206255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13597	NC_014323	CAACA	2	10	5206289	5206298	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
13598	NC_014323	GCA	2	6	5206309	5206314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13599	NC_014323	TCA	2	6	5206326	5206331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_014323	GGCCT	2	10	5208185	5208194	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13601	NC_014323	CGGGC	2	10	5208203	5208212	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13602	NC_014323	GCC	2	6	5208277	5208282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13603	NC_014323	TGA	2	6	5208318	5208323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13604	NC_014323	ACC	2	6	5208334	5208339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13605	NC_014323	TGCCGC	2	12	5209423	5209434	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13606	NC_014323	GGT	2	6	5210532	5210537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13607	NC_014323	TCT	2	6	5210614	5210619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13608	NC_014323	GCC	2	6	5212094	5212099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13609	NC_014323	GCC	2	6	5212101	5212106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13610	NC_014323	CG	3	6	5212107	5212112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13611	NC_014323	CGGC	2	8	5212134	5212141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13612	NC_014323	TGC	2	6	5212870	5212875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13613	NC_014323	TGCC	2	8	5214273	5214280	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13614	NC_014323	CTG	2	6	5214303	5214308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13615	NC_014323	AAG	2	6	5214366	5214371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13616	NC_014323	CTTAT	2	10	5214388	5214397	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13617	NC_014323	TGC	2	6	5214415	5214420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13618	NC_014323	CCA	2	6	5214422	5214427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13619	NC_014323	GCCC	2	8	5214453	5214460	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13620	NC_014323	TGC	2	6	5214463	5214468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13621	NC_014323	GGCCG	2	10	5214491	5214500	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13622	NC_014323	CAA	2	6	5214530	5214535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13623	NC_014323	GCG	2	6	5214583	5214588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_014323	TCG	2	6	5214608	5214613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13625	NC_014323	CCG	2	6	5214618	5214623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13626	NC_014323	ACCTG	2	10	5216041	5216050	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13627	NC_014323	TCCG	2	8	5216068	5216075	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13628	NC_014323	CG	3	6	5216074	5216079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13629	NC_014323	GCG	2	6	5217075	5217080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13997	NC_014323	TTG	2	6	5368815	5368820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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