MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 14524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_014323	CGC	2	6	4774917	4774922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12502	NC_014323	CCG	2	6	4774925	4774930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12503	NC_014323	GCCCC	2	10	4774952	4774961	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
12504	NC_014323	CAC	2	6	4775004	4775009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12505	NC_014323	GCCC	2	8	4775011	4775018	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12506	NC_014323	CCGAG	2	10	4775019	4775028	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12507	NC_014323	CGA	2	6	4775041	4775046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_014323	CCG	2	6	4775079	4775084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12509	NC_014323	GCA	2	6	4775936	4775941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_014323	CCG	2	6	4775945	4775950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12511	NC_014323	A	6	6	4776021	4776026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_014323	CAC	2	6	4777657	4777662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12513	NC_014323	A	6	6	4778920	4778925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_014323	CCG	2	6	4778926	4778931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_014323	GCG	2	6	4778941	4778946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12516	NC_014323	GCAG	2	8	4778961	4778968	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12517	NC_014323	ATA	2	6	4778975	4778980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_014323	GGC	2	6	4778997	4779002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12519	NC_014323	ATCAG	2	10	4779024	4779033	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12520	NC_014323	CCG	3	9	4781450	4781458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12521	NC_014323	GCCGGA	2	12	4781497	4781508	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_014323	GGC	2	6	4783197	4783202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_014323	TGC	2	6	4783248	4783253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_014323	CTG	2	6	4783271	4783276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12525	NC_014323	CTG	3	9	4783292	4783300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_014323	GGA	2	6	4783315	4783320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_014323	CGCCAG	2	12	4783337	4783348	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12528	NC_014323	GCAG	2	8	4783369	4783376	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12529	NC_014323	GGCC	2	8	4783399	4783406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12530	NC_014323	CAG	2	6	4783415	4783420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12531	NC_014323	GCC	2	6	4783469	4783474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12532	NC_014323	CTG	2	6	4783490	4783495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_014323	GC	3	6	4783508	4783513	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12534	NC_014323	CGC	2	6	4783516	4783521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12535	NC_014323	GC	3	6	4783527	4783532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12536	NC_014323	CGC	2	6	4783573	4783578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12537	NC_014323	CTG	2	6	4783607	4783612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_014323	TCG	2	6	4783617	4783622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_014323	CAGC	2	8	4783630	4783637	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12540	NC_014323	TGC	2	6	4783650	4783655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12541	NC_014323	GCCC	2	8	4783682	4783689	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12542	NC_014323	TCC	2	6	4783725	4783730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12543	NC_014323	C	6	6	4783729	4783734	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12544	NC_014323	GTC	2	6	4783736	4783741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_014323	CG	3	6	4786395	4786400	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12546	NC_014323	G	6	6	4786400	4786405	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_014323	T	6	6	4786415	4786420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_014323	GGCG	2	8	4786470	4786477	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12549	NC_014323	CCG	2	6	4786484	4786489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12550	NC_014323	CGCC	2	8	4786507	4786514	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12551	NC_014323	GCA	2	6	4786543	4786548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12552	NC_014323	GCC	2	6	4789536	4789541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12553	NC_014323	CGG	2	6	4789559	4789564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_014323	CGC	2	6	4789646	4789651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12555	NC_014323	T	6	6	4789669	4789674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_014323	ATT	2	6	4789681	4789686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_014323	TCG	2	6	4789690	4789695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_014323	CGA	2	6	4789700	4789705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12559	NC_014323	CGC	2	6	4789723	4789728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12560	NC_014323	GCC	2	6	4789847	4789852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12561	NC_014323	CTT	2	6	4789904	4789909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12562	NC_014323	TGC	2	6	4789918	4789923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_014323	CTTT	2	8	4789933	4789940	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12564	NC_014323	GC	3	6	4790699	4790704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12565	NC_014323	TGC	2	6	4790726	4790731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12568	NC_014323	AG	4	8	4790862	4790869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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12576	NC_014323	GCC	2	6	4791249	4791254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12577	NC_014323	GA	3	6	4791264	4791269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_014323	AG	3	6	4791294	4791299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_014323	AAG	2	6	4791378	4791383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12584	NC_014323	ACA	2	6	4791509	4791514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_014323	GAA	2	6	4791527	4791532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12591	NC_014323	GCATT	2	10	4791737	4791746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12592	NC_014323	GAGG	2	8	4791788	4791795	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_014323	CTT	2	6	4791799	4791804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12599	NC_014323	CGG	2	6	4794546	4794551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12601	NC_014323	CGC	2	6	4794585	4794590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12602	NC_014323	CG	3	6	4794599	4794604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12603	NC_014323	TTG	2	6	4794613	4794618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_014323	TACC	2	8	4795203	4795210	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12605	NC_014323	CGG	2	6	4795213	4795218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_014323	T	6	6	4795259	4795264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_014323	TCAAA	2	10	4796055	4796064	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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12609	NC_014323	CTTG	2	8	4796191	4796198	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12610	NC_014323	TACCT	2	10	4796210	4796219	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12611	NC_014323	CGC	2	6	4796225	4796230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12612	NC_014323	T	6	6	4797522	4797527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_014323	GGT	2	6	4797600	4797605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_014323	CCA	2	6	4797622	4797627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12615	NC_014323	CCG	2	6	4797743	4797748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12616	NC_014323	GAC	2	6	4798109	4798114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_014323	GC	3	6	4803241	4803246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12618	NC_014323	TCA	2	6	4807374	4807379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_014323	CCT	2	6	4813939	4813944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12620	NC_014323	C	6	6	4813973	4813978	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12621	NC_014323	ATC	2	6	4813985	4813990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12622	NC_014323	TC	3	6	4814020	4814025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12623	NC_014323	CGT	2	6	4814044	4814049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12624	NC_014323	AAC	2	6	4815527	4815532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12625	NC_014323	GTT	2	6	4815538	4815543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_014323	CTG	2	6	4815551	4815556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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