MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 14524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_014323	CCTC	2	8	3870139	3870146	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10002	NC_014323	CTT	2	6	3870194	3870199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10003	NC_014323	GGC	2	6	3870206	3870211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_014323	CTT	2	6	3870221	3870226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_014323	GAAT	2	8	3870307	3870314	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_014323	CAG	2	6	3870330	3870335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_014323	ATC	2	6	3870337	3870342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_014323	GC	4	8	3870346	3870353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_014323	GCG	2	6	3870377	3870382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10010	NC_014323	TTC	2	6	3876476	3876481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_014323	GC	3	6	3876507	3876512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10012	NC_014323	CCCCT	2	10	3876556	3876565	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
10013	NC_014323	TGC	2	6	3876571	3876576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_014323	GGC	2	6	3876630	3876635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_014323	CAG	2	6	3877388	3877393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_014323	GC	3	6	3877455	3877460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10017	NC_014323	CG	3	6	3877546	3877551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10018	NC_014323	CAT	2	6	3877603	3877608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10019	NC_014323	CCT	2	6	3877656	3877661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_014323	TCA	2	6	3877665	3877670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10021	NC_014323	GCG	2	6	3879111	3879116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_014323	A	7	7	3879795	3879801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_014323	CGA	2	6	3879844	3879849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_014323	TGC	2	6	3879850	3879855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10025	NC_014323	TGA	2	6	3879933	3879938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_014323	C	6	6	3879956	3879961	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10027	NC_014323	GCC	2	6	3879970	3879975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10028	NC_014323	CATA	2	8	3880003	3880010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10029	NC_014323	TCA	2	6	3880021	3880026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_014323	GCCA	2	8	3880027	3880034	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10031	NC_014323	AGCC	2	8	3880063	3880070	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10032	NC_014323	ATT	2	6	3883082	3883087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_014323	CAA	2	6	3885531	3885536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_014323	GC	3	6	3886440	3886445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10035	NC_014323	CCT	2	6	3887532	3887537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10036	NC_014323	GCA	2	6	3887586	3887591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10037	NC_014323	GCC	2	6	3888692	3888697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10038	NC_014323	AAG	2	6	3888732	3888737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_014323	A	6	6	3888761	3888766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_014323	GCAAC	2	10	3888781	3888790	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10041	NC_014323	GA	3	6	3888870	3888875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_014323	A	6	6	3888902	3888907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_014323	GC	3	6	3891161	3891166	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10044	NC_014323	GCCCT	2	10	3891186	3891195	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10045	NC_014323	CTG	2	6	3891233	3891238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_014323	C	6	6	3891246	3891251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10047	NC_014323	TTCC	2	8	3892573	3892580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10048	NC_014323	GCC	2	6	3892602	3892607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10049	NC_014323	CGG	2	6	3892627	3892632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_014323	ACC	2	6	3898934	3898939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10051	NC_014323	CCA	2	6	3903911	3903916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10052	NC_014323	A	6	6	3903916	3903921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_014323	TTC	2	6	3903926	3903931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_014323	ACT	2	6	3904132	3904137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_014323	GAG	2	6	3904138	3904143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_014323	GAAA	3	12	3904157	3904168	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_014323	CTG	2	6	3904244	3904249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10058	NC_014323	GAG	2	6	3906783	3906788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_014323	TCA	2	6	3906822	3906827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_014323	TGG	2	6	3906843	3906848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_014323	A	8	8	3911287	3911294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_014323	ACG	2	6	3911321	3911326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_014323	CAGT	2	8	3912504	3912511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_014323	AT	3	6	3912580	3912585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_014323	T	6	6	3912663	3912668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_014323	GCC	2	6	3912789	3912794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10067	NC_014323	CGC	2	6	3912842	3912847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10068	NC_014323	CCAGG	2	10	3912863	3912872	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10069	NC_014323	CTA	2	6	3913049	3913054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_014323	C	6	6	3913509	3913514	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10071	NC_014323	GCAA	2	8	3913806	3913813	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10072	NC_014323	AGT	2	6	3915230	3915235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_014323	GAC	2	6	3915278	3915283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_014323	TTCA	2	8	3915342	3915349	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10075	NC_014323	TCG	2	6	3915355	3915360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_014323	AGCA	2	8	3915365	3915372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10077	NC_014323	GTC	2	6	3915838	3915843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_014323	TGT	2	6	3915977	3915982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_014323	TTA	2	6	3916011	3916016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_014323	AT	4	8	3916059	3916066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_014323	CAT	2	6	3916094	3916099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_014323	GA	3	6	3916126	3916131	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_014323	GTG	2	6	3916148	3916153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_014323	GCT	2	6	3916163	3916168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_014323	CAGC	2	8	3916170	3916177	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10086	NC_014323	G	6	6	3916200	3916205	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_014323	TGG	2	6	3916259	3916264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_014323	TGC	2	6	3916351	3916356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10089	NC_014323	TTC	2	6	3916421	3916426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_014323	ACG	2	6	3916450	3916455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_014323	CTG	2	6	3917224	3917229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_014323	CTG	2	6	3917258	3917263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_014323	ACG	2	6	3917272	3917277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_014323	ATCT	2	8	3917727	3917734	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10095	NC_014323	GGCCG	2	10	3917760	3917769	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10096	NC_014323	GAT	2	6	3917771	3917776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_014323	CGC	2	6	3917786	3917791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10098	NC_014323	TCT	2	6	3918615	3918620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_014323	CAGC	2	8	3918637	3918644	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_014323	AGCC	2	8	3918647	3918654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_014323	CTC	2	6	3919575	3919580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10102	NC_014323	T	7	7	3919614	3919620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_014323	GCT	2	6	3919660	3919665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_014323	TCA	2	6	3919743	3919748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_014323	GGA	2	6	3921342	3921347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_014323	GGA	2	6	3921352	3921357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_014323	GGC	2	6	3921364	3921369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_014323	AAG	2	6	3921385	3921390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_014323	AAC	2	6	3921415	3921420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_014323	GCCTTT	2	12	3925238	3925249	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_014323	TCG	2	6	3925278	3925283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_014323	TGTC	2	8	3927119	3927126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10113	NC_014323	GGCA	2	8	3927152	3927159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10114	NC_014323	TGCC	2	8	3927166	3927173	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_014323	GGA	2	6	3927251	3927256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_014323	GGC	2	6	3927315	3927320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10117	NC_014323	GCG	2	6	3927423	3927428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_014323	GCCGC	2	10	3927444	3927453	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10119	NC_014323	CGG	2	6	3927487	3927492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_014323	CAC	2	6	3928297	3928302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_014323	AGC	2	6	3928449	3928454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_014323	C	6	6	3928498	3928503	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10123	NC_014323	TGA	2	6	3928519	3928524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_014323	TCG	2	6	3928582	3928587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10125	NC_014323	T	7	7	3928599	3928605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_014323	GC	3	6	3928627	3928632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10127	NC_014323	TGCG	2	8	3928634	3928641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10128	NC_014323	ATC	2	6	3930277	3930282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_014323	TCCC	2	8	3930592	3930599	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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10251	NC_014323	T	6	6	3982788	3982793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_014323	CTT	2	6	3982825	3982830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10372	NC_014323	TTGCA	2	10	4019936	4019945	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10373	NC_014323	TGACC	2	10	4020011	4020020	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10374	NC_014323	GTCG	2	8	4020039	4020046	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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10380	NC_014323	CA	3	6	4024507	4024512	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10384	NC_014323	TGC	2	6	4024623	4024628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10391	NC_014323	CCT	2	6	4028602	4028607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10392	NC_014323	TGCCTT	2	12	4029969	4029980	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10393	NC_014323	CGTTG	2	10	4030030	4030039	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10394	NC_014323	AT	3	6	4030095	4030100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10395	NC_014323	T	7	7	4030133	4030139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10396	NC_014323	GCG	2	6	4030180	4030185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10422	NC_014323	CATC	2	8	4035330	4035337	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10500	NC_014323	GC	3	6	4060107	4060112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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