MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 14524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_014323	CAGC	2	8	2885412	2885419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7502	NC_014323	ATT	2	6	2885452	2885457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_014323	CGCC	2	8	2886410	2886417	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7504	NC_014323	GC	3	6	2887904	2887909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7505	NC_014323	TGC	2	6	2887924	2887929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_014323	GAC	2	6	2887937	2887942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7507	NC_014323	TTC	2	6	2887956	2887961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7508	NC_014323	TCC	2	6	2888034	2888039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7509	NC_014323	AGA	2	6	2890006	2890011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_014323	ACA	2	6	2891344	2891349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7511	NC_014323	CAG	2	6	2891377	2891382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7512	NC_014323	A	6	6	2892062	2892067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7513	NC_014323	GCAGC	2	10	2892071	2892080	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7514	NC_014323	ATC	2	6	2892107	2892112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_014323	CGC	2	6	2892135	2892140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7516	NC_014323	CAA	2	6	2892143	2892148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_014323	GCC	2	6	2892955	2892960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7518	NC_014323	C	6	6	2892964	2892969	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7519	NC_014323	CTG	2	6	2895684	2895689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_014323	GC	4	8	2897099	2897106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7521	NC_014323	GGCT	2	8	2897108	2897115	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7522	NC_014323	GC	3	6	2897124	2897129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7523	NC_014323	GCA	2	6	2897173	2897178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_014323	CGC	2	6	2897183	2897188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7525	NC_014323	GCC	2	6	2897203	2897208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7526	NC_014323	CTTGC	2	10	2897224	2897233	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7527	NC_014323	GC	4	8	2897274	2897281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7528	NC_014323	CTGGG	2	10	2897284	2897293	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7529	NC_014323	TTG	2	6	2897610	2897615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_014323	TCC	2	6	2897671	2897676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7531	NC_014323	CCAT	2	8	2897684	2897691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7532	NC_014323	CGC	2	6	2899839	2899844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7533	NC_014323	GAA	2	6	2899869	2899874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_014323	CTGC	2	8	2900886	2900893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7535	NC_014323	GGT	2	6	2901419	2901424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_014323	GCC	2	6	2901866	2901871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7537	NC_014323	TTGTC	2	10	2903979	2903988	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7538	NC_014323	GC	3	6	2904083	2904088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7539	NC_014323	GCC	2	6	2907738	2907743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7540	NC_014323	CAACA	2	10	2907898	2907907	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
7541	NC_014323	CTG	2	6	2907924	2907929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7542	NC_014323	GGGC	2	8	2907949	2907956	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7543	NC_014323	CAGG	2	8	2907957	2907964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7544	NC_014323	CCG	2	6	2908005	2908010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7545	NC_014323	GCC	2	6	2908017	2908022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7546	NC_014323	ATT	3	9	2910011	2910019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7547	NC_014323	TTA	2	6	2910053	2910058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_014323	TCT	2	6	2910066	2910071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_014323	CCATC	2	10	2910093	2910102	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7550	NC_014323	TCC	2	6	2910905	2910910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7551	NC_014323	C	6	6	2910989	2910994	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7552	NC_014323	TTG	2	6	2911111	2911116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7553	NC_014323	GGA	2	6	2911204	2911209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_014323	CGG	2	6	2911214	2911219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_014323	GGC	2	6	2915958	2915963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7556	NC_014323	GGC	2	6	2916007	2916012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_014323	GCCT	2	8	2916055	2916062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7558	NC_014323	TCA	2	6	2917248	2917253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_014323	CGT	2	6	2917270	2917275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_014323	GGCA	2	8	2917345	2917352	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7561	NC_014323	GCC	2	6	2917404	2917409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7562	NC_014323	GAA	2	6	2917412	2917417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7563	NC_014323	GCC	2	6	2917421	2917426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7564	NC_014323	TGC	2	6	2917452	2917457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_014323	TAT	2	6	2917892	2917897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_014323	T	7	7	2917897	2917903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7567	NC_014323	CAT	2	6	2917904	2917909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_014323	ATC	2	6	2917918	2917923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7569	NC_014323	CCGCGC	2	12	2917944	2917955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7570	NC_014323	GC	3	6	2917989	2917994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7571	NC_014323	ACC	2	6	2919449	2919454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7572	NC_014323	CCG	2	6	2919513	2919518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7573	NC_014323	GTGG	2	8	2919565	2919572	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_014323	A	6	6	2921757	2921762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7575	NC_014323	CGG	2	6	2921767	2921772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7576	NC_014323	CCG	2	6	2921792	2921797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7577	NC_014323	GTCTC	2	10	2923141	2923150	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7578	NC_014323	TGT	2	6	2923156	2923161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7579	NC_014323	CCT	3	9	2923196	2923204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7580	NC_014323	CTTG	2	8	2923210	2923217	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7581	NC_014323	GCG	2	6	2923220	2923225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7582	NC_014323	TGTTCC	2	12	2924315	2924326	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7583	NC_014323	CTTG	2	8	2924337	2924344	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7584	NC_014323	TCG	2	6	2924408	2924413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_014323	CA	3	6	2924416	2924421	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7586	NC_014323	CAAC	2	8	2924494	2924501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7587	NC_014323	CCAT	2	8	2924502	2924509	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7588	NC_014323	GTC	2	6	2925452	2925457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7589	NC_014323	TGCC	2	8	2925462	2925469	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7590	NC_014323	T	6	6	2925488	2925493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_014323	TGGTC	2	10	2926416	2926425	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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7594	NC_014323	CGGGA	2	10	2926467	2926476	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7595	NC_014323	TGC	2	6	2926482	2926487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7596	NC_014323	CTT	2	6	2928458	2928463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7599	NC_014323	CTGTC	2	10	2928590	2928599	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7600	NC_014323	AGCC	2	8	2928621	2928628	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7601	NC_014323	T	6	6	2928630	2928635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7602	NC_014323	GAT	2	6	2928638	2928643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7604	NC_014323	A	7	7	2929434	2929440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_014323	TGC	2	6	2929470	2929475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7609	NC_014323	GCC	2	6	2930070	2930075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7610	NC_014323	GCG	2	6	2930114	2930119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7611	NC_014323	ATT	2	6	2930217	2930222	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_014323	A	8	8	2930237	2930244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7613	NC_014323	CCTTT	2	10	2934344	2934353	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7614	NC_014323	TTA	3	9	2934621	2934629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7615	NC_014323	AATT	2	8	2934631	2934638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_014323	GCCT	2	8	2934673	2934680	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7617	NC_014323	AGC	2	6	2934723	2934728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7618	NC_014323	GC	3	6	2935212	2935217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7619	NC_014323	TGC	2	6	2935236	2935241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7622	NC_014323	TGT	2	6	2939027	2939032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7623	NC_014323	CTC	2	6	2939033	2939038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7624	NC_014323	GC	3	6	2939682	2939687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7625	NC_014323	ACA	2	6	2939753	2939758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7626	NC_014323	CTT	2	6	2939805	2939810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7627	NC_014323	T	8	8	2939825	2939832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7628	NC_014323	GGT	2	6	2939849	2939854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7629	NC_014323	GCC	3	9	2939871	2939879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7631	NC_014323	GCGGA	2	10	2939944	2939953	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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