MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Herbaspirillum seropedicae SmR1 chromosome

Total Repeats: 14524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_014323	TCCA	2	8	2420223	2420230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_014323	ATC	2	6	2420258	2420263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_014323	CATTGT	2	12	2420320	2420331	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6504	NC_014323	GCT	2	6	2420335	2420340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_014323	GTC	2	6	2420409	2420414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_014323	T	7	7	2420751	2420757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_014323	TC	3	6	2420784	2420789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6508	NC_014323	A	6	6	2421474	2421479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_014323	TCCG	2	8	2421508	2421515	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_014323	CGC	2	6	2422382	2422387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6511	NC_014323	GCC	2	6	2422403	2422408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_014323	ATG	2	6	2422409	2422414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_014323	GGCT	2	8	2422438	2422445	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6514	NC_014323	AGCG	2	8	2424510	2424517	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6515	NC_014323	GCC	2	6	2425436	2425441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_014323	ACG	2	6	2426977	2426982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_014323	GAC	2	6	2426999	2427004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_014323	CGGCG	2	10	2427005	2427014	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6519	NC_014323	ATG	2	6	2429298	2429303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_014323	TGAA	2	8	2429329	2429336	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_014323	GAGAA	2	10	2429474	2429483	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_014323	GC	3	6	2431326	2431331	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6523	NC_014323	CCG	2	6	2431390	2431395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_014323	GGCC	2	8	2431401	2431408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6525	NC_014323	TGC	3	9	2431414	2431422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_014323	GTC	2	6	2435144	2435149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6527	NC_014323	ATTG	2	8	2435185	2435192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_014323	TCT	2	6	2435246	2435251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_014323	CTGG	2	8	2435277	2435284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6530	NC_014323	CGA	2	6	2435311	2435316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_014323	CTT	2	6	2435373	2435378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_014323	AGC	2	6	2435384	2435389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_014323	CCGC	2	8	2435435	2435442	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6534	NC_014323	CCT	2	6	2436802	2436807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6535	NC_014323	GCA	2	6	2438920	2438925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6536	NC_014323	CAG	2	6	2439877	2439882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_014323	CCGG	2	8	2439889	2439896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6538	NC_014323	CGC	2	6	2440495	2440500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_014323	TCTTGA	2	12	2443133	2443144	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6540	NC_014323	CCGG	2	8	2443164	2443171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6541	NC_014323	CGG	2	6	2443174	2443179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_014323	GT	3	6	2445385	2445390	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_014323	TGC	2	6	2445403	2445408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_014323	GGCCC	2	10	2445468	2445477	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6545	NC_014323	GCC	2	6	2445498	2445503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_014323	GCCA	2	8	2445523	2445530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6547	NC_014323	CAGG	2	8	2445622	2445629	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6548	NC_014323	GATCG	2	10	2445689	2445698	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6549	NC_014323	TTCA	2	8	2448872	2448879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6550	NC_014323	GCG	2	6	2449671	2449676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_014323	GCC	2	6	2449703	2449708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6552	NC_014323	GCA	2	6	2449717	2449722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_014323	CCG	2	6	2449729	2449734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6554	NC_014323	CGGG	2	8	2452323	2452330	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6555	NC_014323	TGC	2	6	2452429	2452434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_014323	GAC	2	6	2453314	2453319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_014323	GGTT	2	8	2453322	2453329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_014323	CG	3	6	2453351	2453356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6559	NC_014323	TTC	2	6	2453494	2453499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_014323	GTA	2	6	2454376	2454381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_014323	GTA	2	6	2454384	2454389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_014323	T	8	8	2454428	2454435	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_014323	GCC	2	6	2454461	2454466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_014323	T	7	7	2455419	2455425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_014323	GGCA	2	8	2455495	2455502	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6566	NC_014323	GGC	2	6	2455509	2455514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_014323	GCA	2	6	2455527	2455532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_014323	GCA	2	6	2455536	2455541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_014323	GCA	2	6	2455561	2455566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_014323	TCC	2	6	2455591	2455596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6571	NC_014323	CGA	2	6	2455600	2455605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_014323	GC	3	6	2455608	2455613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6573	NC_014323	GTGC	2	8	2455632	2455639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6574	NC_014323	CAA	2	6	2455648	2455653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_014323	GAAA	2	8	2455668	2455675	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_014323	TGC	2	6	2456413	2456418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_014323	GGCC	2	8	2456435	2456442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_014323	AGC	2	6	2456516	2456521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_014323	GCCGC	2	10	2457115	2457124	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6580	NC_014323	GAAA	2	8	2457158	2457165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_014323	GGA	2	6	2457177	2457182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_014323	AAT	2	6	2457260	2457265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_014323	T	6	6	2461455	2461460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_014323	GTT	2	6	2461488	2461493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_014323	TGA	2	6	2461575	2461580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_014323	TCA	2	6	2463969	2463974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_014323	GGC	2	6	2464544	2464549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_014323	GCC	2	6	2464580	2464585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_014323	GGC	2	6	2464609	2464614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6590	NC_014323	ACGCA	2	10	2464625	2464634	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6591	NC_014323	AGGC	2	8	2466227	2466234	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6592	NC_014323	TTG	2	6	2466286	2466291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_014323	TTG	2	6	2466295	2466300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_014323	CAG	2	6	2468365	2468370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_014323	AAG	2	6	2468378	2468383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_014323	GGC	2	6	2469863	2469868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_014323	CAT	2	6	2469944	2469949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_014323	GGC	2	6	2469957	2469962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_014323	GCCAGC	2	12	2469975	2469986	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6600	NC_014323	CCGA	2	8	2470005	2470012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6601	NC_014323	GCCC	2	8	2470016	2470023	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6602	NC_014323	GGCC	2	8	2470074	2470081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6603	NC_014323	TC	3	6	2470090	2470095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_014323	CTG	2	6	2470182	2470187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_014323	CGC	2	6	2470208	2470213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6606	NC_014323	ATC	2	6	2470216	2470221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_014323	TCA	2	6	2470291	2470296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_014323	ACC	2	6	2470326	2470331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6609	NC_014323	CCG	2	6	2470334	2470339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_014323	GCG	2	6	2470357	2470362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_014323	TGG	2	6	2471235	2471240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_014323	ATT	2	6	2471243	2471248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_014323	A	7	7	2471266	2471272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_014323	TGA	2	6	2471341	2471346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_014323	TGA	2	6	2471380	2471385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_014323	GC	3	6	2471416	2471421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6617	NC_014323	GCC	2	6	2471462	2471467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_014323	ATC	2	6	2471527	2471532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_014323	GCA	2	6	2473942	2473947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_014323	AAG	2	6	2473955	2473960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_014323	AAG	2	6	2474004	2474009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_014323	CCTC	2	8	2474049	2474056	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6623	NC_014323	TTC	2	6	2474087	2474092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_014323	GTCCTT	2	12	2474550	2474561	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_014323	C	6	6	2474570	2474575	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6626	NC_014323	CTTTGG	2	12	2476874	2476885	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6627	NC_014323	GTC	2	6	2476889	2476894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_014323	ACA	2	6	2476895	2476900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6629	NC_014323	CCTG	2	8	2476909	2476916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6630	NC_014323	GCA	2	6	2476919	2476924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6631	NC_014323	TTG	2	6	2476931	2476936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6633	NC_014323	GGA	2	6	2476962	2476967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6895	NC_014323	GTCA	2	8	2578165	2578172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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