MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 2314

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014299	CGA	2	6	165359	165364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_014299	TA	3	6	165404	165409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_014299	AT	3	6	165412	165417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014299	GCG	2	6	165422	165427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_014299	ACC	2	6	165431	165436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_014299	TCG	2	6	165470	165475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_014299	G	6	6	165489	165494	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014299	CAC	2	6	166376	166381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_014299	ACC	2	6	166396	166401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1010	NC_014299	CGGG	2	8	166416	166423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1011	NC_014299	G	6	6	166440	166445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014299	TCG	2	6	168393	168398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_014299	GCAC	2	8	168471	168478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_014299	TCG	2	6	168520	168525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_014299	GGCCC	2	10	168542	168551	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1016	NC_014299	ATCA	2	8	168562	168569	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1017	NC_014299	GCC	2	6	168602	168607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_014299	ACT	2	6	168658	168663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014299	GCG	2	6	168672	168677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014299	ATC	2	6	168764	168769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_014299	TAG	2	6	168810	168815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_014299	G	6	6	168890	168895	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014299	GCGG	2	8	168921	168928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_014299	GAA	2	6	169054	169059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014299	CCGCT	2	10	169085	169094	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1026	NC_014299	ACC	2	6	169105	169110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_014299	AGCC	2	8	169115	169122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_014299	ACCC	2	8	169128	169135	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1029	NC_014299	TAT	2	6	171765	171770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014299	ACC	2	6	173124	173129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_014299	TCA	2	6	173157	173162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_014299	TGT	2	6	173172	173177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014299	CA	3	6	173720	173725	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1034	NC_014299	TCG	2	6	173726	173731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_014299	TCA	2	6	173780	173785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_014299	GT	3	6	173823	173828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014299	TGCA	2	8	173860	173867	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_014299	CTGA	2	8	173878	173885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_014299	CCCCCT	2	12	173950	173961	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1040	NC_014299	CAG	2	6	174069	174074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_014299	CAT	2	6	174300	174305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_014299	CGGTAG	2	12	175538	175549	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1043	NC_014299	CGC	3	9	175563	175571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_014299	TCT	2	6	175596	175601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_014299	GGA	2	6	175641	175646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014299	GCTC	2	8	175684	175691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_014299	GTT	2	6	175773	175778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014299	AC	3	6	175864	175869	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_014299	AAG	2	6	175892	175897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014299	AACC	2	8	175948	175955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_014299	GT	3	6	175991	175996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014299	TGC	2	6	176044	176049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_014299	ACT	2	6	176167	176172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014299	AGC	2	6	176432	176437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_014299	TTC	2	6	176448	176453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_014299	AGT	2	6	176464	176469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014299	GAA	2	6	176476	176481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_014299	GAGAA	2	10	176482	176491	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014299	T	6	6	177664	177669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014299	AGC	2	6	177715	177720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014299	GGA	2	6	177722	177727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014299	ACC	2	6	177814	177819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_014299	TCT	2	6	177876	177881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_014299	ATCT	2	8	177908	177915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_014299	GCT	2	6	177988	177993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014299	ATG	2	6	178134	178139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014299	CATT	2	8	178189	178196	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_014299	GT	3	6	178227	178232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014299	CTGG	2	8	178302	178309	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1070	NC_014299	TCA	2	6	178348	178353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_014299	TGC	2	6	178378	178383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_014299	AG	3	6	178384	178389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014299	CGGT	2	8	178395	178402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_014299	CTT	2	6	178408	178413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_014299	TGC	2	6	178423	178428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_014299	AGA	2	6	178447	178452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_014299	TCGA	2	8	178490	178497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1078	NC_014299	TCG	2	6	178637	178642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_014299	CGGTG	2	10	178643	178652	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1080	NC_014299	GAC	2	6	178676	178681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_014299	GCG	2	6	178812	178817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014299	GCTG	2	8	178868	178875	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_014299	GCG	2	6	180562	180567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_014299	TCG	2	6	180614	180619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_014299	CG	3	6	180649	180654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1086	NC_014299	GGT	2	6	180671	180676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014299	TTGA	2	8	180680	180687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014299	CCT	2	6	180703	180708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_014299	GCGGT	2	10	180760	180769	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_014299	CTG	2	6	180775	180780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_014299	G	7	7	180785	180791	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014299	TATCT	2	10	180804	180813	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1093	NC_014299	CCG	2	6	180874	180879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1094	NC_014299	TTCT	2	8	180887	180894	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_014299	GGC	2	6	181220	181225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_014299	ATG	2	6	181243	181248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014299	TCG	2	6	181571	181576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_014299	CGT	2	6	181578	181583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_014299	CTC	2	6	181588	181593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_014299	TCG	2	6	181598	181603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_014299	TCC	2	6	181604	181609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_014299	GTA	2	6	181629	181634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_014299	GGA	2	6	181780	181785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014299	AAAC	2	8	181792	181799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_014299	ACC	2	6	182275	182280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_014299	AGT	2	6	182287	182292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014299	GCA	2	6	182331	182336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_014299	AT	3	6	182373	182378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014299	GTC	2	6	182384	182389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_014299	CAA	2	6	182508	182513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_014299	CTA	2	6	182528	182533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_014299	TTGCCG	2	12	182549	182560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_014299	TCT	2	6	182564	182569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_014299	TAG	4	12	182610	182621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014299	CAT	2	6	182786	182791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_014299	TTG	2	6	183101	183106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014299	CTA	2	6	183138	183143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_014299	GA	3	6	183178	183183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014299	ACA	2	6	183234	183239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_014299	GAT	2	6	183258	183263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_014299	ATA	2	6	183292	183297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_014299	GCG	2	6	183308	183313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014299	GCT	2	6	183363	183368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_014299	AAC	2	6	183429	183434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_014299	CGC	2	6	183437	183442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_014299	CTG	2	6	183462	183467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_014299	GTC	2	6	183917	183922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_014299	GGA	2	6	183946	183951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014299	GC	3	6	184011	184016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1130	NC_014299	GC	3	6	184026	184031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_014299	GGTCC	2	10	184052	184061	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1132	NC_014299	AAGG	2	8	184093	184100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014299	CCA	2	6	184117	184122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_014299	CGA	2	6	184126	184131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_014299	TA	3	6	184171	184176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_014299	CAC	2	6	231942	231947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1406	NC_014299	ATA	2	6	232031	232036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_014299	TTTGTT	2	12	233185	233196	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_014299	CTC	2	6	233272	233277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1409	NC_014299	AAG	2	6	233355	233360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1410	NC_014299	ACC	2	6	233374	233379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1411	NC_014299	AAT	2	6	233398	233403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1412	NC_014299	ATA	2	6	233430	233435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1413	NC_014299	CAT	2	6	233444	233449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1415	NC_014299	TCT	2	6	234117	234122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1416	NC_014299	GCA	2	6	234181	234186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1417	NC_014299	TGACG	2	10	234204	234213	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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1419	NC_014299	CCCAT	2	10	234318	234327	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1420	NC_014299	ATC	2	6	234370	234375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1421	NC_014299	TGA	2	6	234390	234395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_014299	GTCC	2	8	234414	234421	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1423	NC_014299	AT	3	6	235334	235339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_014299	ATG	2	6	235401	235406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_014299	GTG	2	6	235417	235422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_014299	ATG	2	6	235423	235428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_014299	ACC	2	6	235489	235494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1428	NC_014299	TCAA	2	8	235592	235599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1429	NC_014299	CAA	2	6	235627	235632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1430	NC_014299	TCT	2	6	236991	236996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1431	NC_014299	TAC	2	6	237035	237040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1432	NC_014299	AGAGT	2	10	239181	239190	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1433	NC_014299	ATA	2	6	239217	239222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1434	NC_014299	TCA	2	6	239226	239231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_014299	GTA	2	6	239265	239270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_014299	CAA	2	6	239305	239310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1437	NC_014299	CT	3	6	239345	239350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1438	NC_014299	TGTT	2	8	239370	239377	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_014299	C	6	6	239391	239396	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1440	NC_014299	CGG	2	6	239399	239404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1441	NC_014299	CTG	2	6	239425	239430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1442	NC_014299	CAA	2	6	239506	239511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_014299	TGT	2	6	239537	239542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_014299	ATT	2	6	239636	239641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_014299	GAT	2	6	239648	239653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1446	NC_014299	TCT	2	6	239673	239678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1447	NC_014299	AAT	2	6	239682	239687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1448	NC_014299	TAC	2	6	239712	239717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1449	NC_014299	TCTTG	2	10	239718	239727	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1450	NC_014299	TTA	2	6	239732	239737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_014299	TAT	2	6	239770	239775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_014299	TATGA	2	10	239788	239797	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_014299	GAA	2	6	239844	239849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_014299	TG	3	6	239886	239891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_014299	GTG	2	6	239898	239903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_014299	ATT	2	6	243955	243960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1462	NC_014299	CCA	2	6	243961	243966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1467	NC_014299	ATCCA	2	10	244078	244087	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1468	NC_014299	CTG	2	6	244101	244106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1472	NC_014299	ACCA	2	8	244337	244344	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1473	NC_014299	TCC	2	6	244379	244384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1475	NC_014299	GAGT	2	8	244403	244410	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1488	NC_014299	CTG	2	6	245388	245393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1489	NC_014299	CTG	2	6	245491	245496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1491	NC_014299	TCG	2	6	245527	245532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1493	NC_014299	TA	3	6	245667	245672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1498	NC_014299	TGGC	2	8	245753	245760	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1499	NC_014299	TCG	2	6	245811	245816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1500	NC_014299	GAG	2	6	245886	245891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

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