MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori B8 plasmid HPB8p

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014257	GC	4	8	178	185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014257	ACA	2	6	205	210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014257	GTT	2	6	213	218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014257	TAA	2	6	227	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014257	AAC	2	6	234	239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014257	T	6	6	283	288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014257	TTGC	2	8	324	331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014257	CGCTT	2	10	397	406	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014257	CGCT	2	8	463	470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014257	T	7	7	576	582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014257	GTT	2	6	595	600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014257	T	6	6	605	610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014257	CAAC	2	8	640	647	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014257	A	6	6	655	660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014257	TAC	2	6	671	676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014257	A	6	6	686	691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014257	GAA	2	6	738	743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014257	A	6	6	742	747	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014257	T	6	6	754	759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014257	ACTAG	2	10	800	809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014257	A	7	7	823	829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014257	CAAA	2	8	904	911	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014257	T	8	8	947	954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014257	AAG	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014257	CTTAA	2	10	1554	1563	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014257	ATA	2	6	1570	1575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014257	ATA	2	6	1609	1614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014257	ACC	2	6	1693	1698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_014257	CAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014257	A	6	6	4090	4095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014257	TAA	2	6	5731	5736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014257	CCT	2	6	5871	5876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014257	CT	3	6	5891	5896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014257	TCC	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_014257	CAA	2	6	5916	5921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014257	TTA	2	6	5991	5996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.