MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013967	TCG	2	6	2427440	2427445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_013967	TCGGTC	2	12	2428062	2428073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_013967	GGT	2	6	2428097	2428102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_013967	GCG	2	6	2428117	2428122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_013967	CCG	2	6	2428124	2428129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_013967	TCGG	2	8	2428136	2428143	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8007	NC_013967	CGA	2	6	2428977	2428982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_013967	GCG	2	6	2429014	2429019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_013967	CGAGC	2	10	2429029	2429038	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8010	NC_013967	GC	3	6	2429037	2429042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8011	NC_013967	GCC	2	6	2429045	2429050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_013967	ACG	2	6	2430278	2430283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_013967	CGG	4	12	2430305	2430316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_013967	CAC	2	6	2433913	2433918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8015	NC_013967	TGG	2	6	2434010	2434015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_013967	GAA	2	6	2434066	2434071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_013967	CGC	2	6	2434090	2434095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8018	NC_013967	GGC	2	6	2434737	2434742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_013967	GCG	2	6	2434754	2434759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_013967	GTCG	2	8	2434760	2434767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8021	NC_013967	GCCG	2	8	2434779	2434786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8022	NC_013967	GGC	2	6	2434794	2434799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_013967	GAA	2	6	2434805	2434810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_013967	CAG	2	6	2436083	2436088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_013967	GTT	2	6	2436114	2436119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_013967	TCC	2	6	2436129	2436134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_013967	TCG	2	6	2436146	2436151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_013967	TTCACT	3	18	2436152	2436169	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_013967	CGTC	2	8	2436220	2436227	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_013967	CGA	2	6	2436306	2436311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_013967	ACG	3	9	2436314	2436322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_013967	CG	3	6	2436321	2436326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_013967	GCGCTC	2	12	2436334	2436345	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_013967	CGT	2	6	2436369	2436374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_013967	CTC	2	6	2436400	2436405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8036	NC_013967	GC	3	6	2436407	2436412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8037	NC_013967	GCTCGC	2	12	2436421	2436432	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8038	NC_013967	CTG	2	6	2436437	2436442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_013967	TCGC	2	8	2436448	2436455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8040	NC_013967	CGG	3	9	2437022	2437030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_013967	GCGA	2	8	2437049	2437056	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8042	NC_013967	CGG	2	6	2437083	2437088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_013967	CGG	2	6	2437097	2437102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_013967	ATTT	2	8	2437103	2437110	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_013967	GT	3	6	2437518	2437523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_013967	G	6	6	2437527	2437532	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_013967	GAG	2	6	2437582	2437587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_013967	TCA	2	6	2437609	2437614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_013967	GC	3	6	2437679	2437684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8050	NC_013967	AGC	2	6	2437708	2437713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8051	NC_013967	CGG	2	6	2438246	2438251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_013967	GAT	2	6	2438301	2438306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_013967	TC	3	6	2438313	2438318	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8054	NC_013967	GCG	2	6	2438865	2438870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_013967	GCG	2	6	2438881	2438886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8056	NC_013967	GA	4	8	2438897	2438904	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_013967	TG	3	6	2438908	2438913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_013967	GCT	2	6	2438961	2438966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_013967	AG	3	6	2438968	2438973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_013967	TCG	2	6	2440312	2440317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_013967	CGG	2	6	2441424	2441429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_013967	CGC	2	6	2441431	2441436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_013967	TCGGT	2	10	2441447	2441456	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8064	NC_013967	CAC	2	6	2442409	2442414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_013967	GCG	2	6	2442456	2442461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_013967	CGG	2	6	2442915	2442920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8067	NC_013967	GAC	2	6	2442925	2442930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_013967	GGTC	2	8	2442955	2442962	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8069	NC_013967	TC	3	6	2443614	2443619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8070	NC_013967	AG	3	6	2443683	2443688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_013967	GAG	2	6	2443700	2443705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_013967	T	6	6	2446553	2446558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_013967	GAG	2	6	2448813	2448818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_013967	CGG	3	9	2448825	2448833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_013967	CGC	2	6	2448843	2448848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8076	NC_013967	CGT	2	6	2448852	2448857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8077	NC_013967	CGC	2	6	2448858	2448863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8078	NC_013967	TC	3	6	2449593	2449598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_013967	TA	3	6	2449653	2449658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_013967	CACG	2	8	2449676	2449683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8081	NC_013967	CG	3	6	2449685	2449690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8082	NC_013967	GCC	2	6	2449692	2449697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8083	NC_013967	CGA	2	6	2449700	2449705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_013967	CGGA	2	8	2450659	2450666	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_013967	ACCG	2	8	2450685	2450692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8086	NC_013967	GCC	2	6	2450732	2450737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8087	NC_013967	GAC	2	6	2452353	2452358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_013967	GAC	2	6	2452363	2452368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_013967	CGTCG	2	10	2452983	2452992	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
8090	NC_013967	TTG	2	6	2453002	2453007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_013967	CGGCGT	2	12	2453009	2453020	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_013967	GA	3	6	2453021	2453026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_013967	CGG	2	6	2453531	2453536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8094	NC_013967	GC	3	6	2453552	2453557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8095	NC_013967	ACCG	2	8	2453559	2453566	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8096	NC_013967	CGC	2	6	2454893	2454898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8098	NC_013967	GTC	2	6	2454951	2454956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8099	NC_013967	GC	3	6	2454958	2454963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8100	NC_013967	CGC	2	6	2454981	2454986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8101	NC_013967	GTC	2	6	2457643	2457648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_013967	CGC	2	6	2457963	2457968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_013967	GCC	2	6	2457978	2457983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_013967	GC	3	6	2458702	2458707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8105	NC_013967	CGA	2	6	2458724	2458729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8107	NC_013967	CCT	2	6	2459467	2459472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_013967	GCC	2	6	2460303	2460308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8109	NC_013967	CGACC	2	10	2460384	2460393	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8110	NC_013967	GCC	2	6	2461323	2461328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8111	NC_013967	CGC	2	6	2461336	2461341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_013967	TCG	2	6	2461380	2461385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8113	NC_013967	CGG	2	6	2461922	2461927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8114	NC_013967	TCGG	2	8	2461929	2461936	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8115	NC_013967	C	6	6	2461965	2461970	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8116	NC_013967	CGT	2	6	2461981	2461986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8117	NC_013967	GA	4	8	2464184	2464191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_013967	AGC	2	6	2464201	2464206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_013967	TC	3	6	2465466	2465471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8120	NC_013967	CGT	2	6	2465525	2465530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8122	NC_013967	GTC	2	6	2468575	2468580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8123	NC_013967	C	6	6	2468580	2468585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8124	NC_013967	GACG	2	8	2468618	2468625	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8125	NC_013967	GAC	2	6	2468664	2468669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_013967	CGGGA	2	10	2468701	2468710	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8127	NC_013967	GA	3	6	2468709	2468714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_013967	CGGGA	2	10	2468734	2468743	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8129	NC_013967	GA	4	8	2468755	2468762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_013967	ACGGA	2	10	2468763	2468772	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8131	NC_013967	GA	3	6	2468771	2468776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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