MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_013967	CGA	2	6	2308780	2308785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7502	NC_013967	CGA	2	6	2308856	2308861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7503	NC_013967	CGT	2	6	2308898	2308903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_013967	AGG	2	6	2308909	2308914	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_013967	CAA	2	6	2308996	2309001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_013967	TC	3	6	2309006	2309011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7507	NC_013967	ACCT	2	8	2309039	2309046	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7508	NC_013967	GAG	2	6	2309072	2309077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7509	NC_013967	TCAG	2	8	2309094	2309101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7510	NC_013967	ACTCG	2	10	2309128	2309137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7511	NC_013967	GAG	2	6	2309150	2309155	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7512	NC_013967	GTC	2	6	2309156	2309161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_013967	ACT	2	6	2309178	2309183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7514	NC_013967	CGG	2	6	2309196	2309201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7515	NC_013967	CCGCG	2	10	2309218	2309227	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7516	NC_013967	CG	3	6	2309241	2309246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7517	NC_013967	CAAC	2	8	2309248	2309255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7518	NC_013967	GACC	2	8	2309269	2309276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7519	NC_013967	CGC	2	6	2309292	2309297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7520	NC_013967	AGG	2	6	2309298	2309303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7521	NC_013967	CG	4	8	2309329	2309336	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7522	NC_013967	CGC	2	6	2309338	2309343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7523	NC_013967	CAT	2	6	2309359	2309364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_013967	ACG	2	6	2309382	2309387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7525	NC_013967	CGG	2	6	2309467	2309472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7526	NC_013967	GC	3	6	2309478	2309483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7527	NC_013967	TCG	2	6	2309511	2309516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7528	NC_013967	ACCCGT	2	12	2309535	2309546	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7529	NC_013967	CGA	2	6	2309674	2309679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7530	NC_013967	GCCC	2	8	2309759	2309766	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7531	NC_013967	GGCGA	2	10	2309789	2309798	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7532	NC_013967	CGG	2	6	2309806	2309811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_013967	TC	3	6	2309830	2309835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7534	NC_013967	ACG	2	6	2309852	2309857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7535	NC_013967	GAG	2	6	2309867	2309872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7536	NC_013967	GCT	2	6	2309881	2309886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7537	NC_013967	GAG	2	6	2309912	2309917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7538	NC_013967	CAG	2	6	2309980	2309985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7539	NC_013967	ACG	2	6	2310005	2310010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7540	NC_013967	TCG	4	12	2311150	2311161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7541	NC_013967	TGG	2	6	2311168	2311173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_013967	CCG	2	6	2311245	2311250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7543	NC_013967	ACG	2	6	2311263	2311268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7544	NC_013967	AG	3	6	2311275	2311280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_013967	CGT	2	6	2311304	2311309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_013967	GTC	2	6	2311326	2311331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_013967	CGAG	2	8	2311394	2311401	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7548	NC_013967	CAT	2	6	2311415	2311420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_013967	TCG	2	6	2311444	2311449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_013967	TCGC	2	8	2311464	2311471	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7551	NC_013967	TCG	2	6	2311489	2311494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7552	NC_013967	CGG	2	6	2311501	2311506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_013967	GAC	2	6	2311527	2311532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_013967	CAT	2	6	2311553	2311558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_013967	CTCG	2	8	2311572	2311579	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7556	NC_013967	TCG	2	6	2311595	2311600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7557	NC_013967	TCG	2	6	2311640	2311645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7558	NC_013967	CGG	2	6	2311673	2311678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7559	NC_013967	GTC	2	6	2311708	2311713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7560	NC_013967	TCG	3	9	2311730	2311738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7561	NC_013967	GAG	3	9	2311798	2311806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7562	NC_013967	GCGA	2	8	2311834	2311841	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7563	NC_013967	TCC	2	6	2311865	2311870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7564	NC_013967	CGA	2	6	2311901	2311906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_013967	GCC	2	6	2311915	2311920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7566	NC_013967	ATC	2	6	2311921	2311926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_013967	CGGC	2	8	2311998	2312005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7568	NC_013967	GTG	2	6	2312022	2312027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_013967	CGA	2	6	2312033	2312038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7570	NC_013967	TCG	2	6	2312054	2312059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7571	NC_013967	TCG	2	6	2312081	2312086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7572	NC_013967	AGGGG	2	10	2312124	2312133	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_013967	G	6	6	2312130	2312135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_013967	CGA	2	6	2314670	2314675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7575	NC_013967	CGC	2	6	2314693	2314698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7576	NC_013967	GC	3	6	2315705	2315710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7577	NC_013967	CGA	2	6	2316157	2316162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_013967	GGC	2	6	2316224	2316229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_013967	TGT	2	6	2316331	2316336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7581	NC_013967	GAA	2	6	2316422	2316427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7583	NC_013967	TCG	2	6	2316474	2316479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_013967	CGG	2	6	2316529	2316534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_013967	TC	3	6	2316712	2316717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7586	NC_013967	CGGTC	2	10	2316792	2316801	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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7589	NC_013967	GC	3	6	2317852	2317857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7590	NC_013967	GA	3	6	2318461	2318466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_013967	GAA	2	6	2318689	2318694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7593	NC_013967	CG	3	6	2318756	2318761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7594	NC_013967	GAA	2	6	2318806	2318811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_013967	TCGC	2	8	2319762	2319769	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7596	NC_013967	GTC	2	6	2319789	2319794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7597	NC_013967	GT	3	6	2319832	2319837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7598	NC_013967	GA	4	8	2319961	2319968	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7599	NC_013967	TTTCT	2	10	2320001	2320010	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7600	NC_013967	TCG	2	6	2320020	2320025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7601	NC_013967	CGGT	2	8	2320036	2320043	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7602	NC_013967	CGA	2	6	2320086	2320091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7603	NC_013967	GA	3	6	2320090	2320095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_013967	CGGAG	2	10	2320114	2320123	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7605	NC_013967	GAAC	2	8	2320142	2320149	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7606	NC_013967	TAC	2	6	2320176	2320181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7607	NC_013967	TCCC	2	8	2323298	2323305	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7608	NC_013967	CGAG	2	8	2323320	2323327	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7609	NC_013967	GT	4	8	2323375	2323382	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_013967	TGGT	2	8	2323387	2323394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_013967	CCG	2	6	2323421	2323426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7612	NC_013967	ACG	3	9	2323450	2323458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7613	NC_013967	CGA	2	6	2323461	2323466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7614	NC_013967	ACG	2	6	2323492	2323497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7615	NC_013967	GTAG	2	8	2323516	2323523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7616	NC_013967	AAT	2	6	2323552	2323557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7617	NC_013967	G	6	6	2323593	2323598	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7618	NC_013967	CA	3	6	2323682	2323687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7619	NC_013967	CGG	2	6	2323749	2323754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7621	NC_013967	CGG	2	6	2323864	2323869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7623	NC_013967	GCCGTC	2	12	2323913	2323924	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7624	NC_013967	TCG	2	6	2323932	2323937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7626	NC_013967	TCG	2	6	2323986	2323991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7627	NC_013967	GC	3	6	2323995	2324000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7628	NC_013967	GC	3	6	2324044	2324049	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7630	NC_013967	GCG	2	6	2324086	2324091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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