MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 chromosome

Total Repeats: 9379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013967	TGA	2	6	2159226	2159231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_013967	GCT	2	6	2159296	2159301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_013967	ATCA	2	8	2159311	2159318	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7004	NC_013967	GCT	2	6	2159341	2159346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_013967	CAG	2	6	2159407	2159412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_013967	GAG	2	6	2159566	2159571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_013967	AGG	2	6	2160230	2160235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_013967	GGA	2	6	2160346	2160351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_013967	CGG	2	6	2160401	2160406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_013967	TTCT	3	12	2160442	2160453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7011	NC_013967	TAC	2	6	2162016	2162021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_013967	AT	3	6	2162027	2162032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_013967	CAA	2	6	2162037	2162042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_013967	GA	3	6	2162051	2162056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_013967	CTG	2	6	2162976	2162981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_013967	TTC	2	6	2163055	2163060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_013967	TTC	2	6	2163076	2163081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_013967	CTA	2	6	2163108	2163113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_013967	TCC	2	6	2163209	2163214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_013967	AAGT	2	8	2163269	2163276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_013967	ATC	2	6	2163320	2163325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7022	NC_013967	TTC	2	6	2163363	2163368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_013967	TAC	2	6	2163400	2163405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_013967	CTC	2	6	2163422	2163427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7025	NC_013967	GTTA	2	8	2163542	2163549	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_013967	GTTCG	2	10	2163593	2163602	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7027	NC_013967	CGT	2	6	2163612	2163617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_013967	CGCC	2	8	2163667	2163674	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7029	NC_013967	CG	3	6	2164848	2164853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_013967	CGC	2	6	2164874	2164879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7031	NC_013967	C	8	8	2165264	2165271	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7032	NC_013967	CCG	2	6	2166099	2166104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7033	NC_013967	CGTC	2	8	2166114	2166121	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7034	NC_013967	CGA	2	6	2167269	2167274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_013967	GTG	2	6	2168080	2168085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_013967	GGT	2	6	2168124	2168129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_013967	CGG	2	6	2168139	2168144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_013967	CG	4	8	2168148	2168155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7039	NC_013967	CGG	2	6	2168159	2168164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_013967	TC	3	6	2169420	2169425	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_013967	CT	3	6	2169475	2169480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7042	NC_013967	GTCG	2	8	2169499	2169506	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7043	NC_013967	GT	3	6	2169950	2169955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_013967	CGG	2	6	2172085	2172090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_013967	CG	3	6	2172094	2172099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7046	NC_013967	GC	3	6	2172101	2172106	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7047	NC_013967	GCC	2	6	2172116	2172121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7048	NC_013967	CCG	3	9	2172141	2172149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_013967	C	6	6	2172172	2172177	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7050	NC_013967	CGC	2	6	2175329	2175334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_013967	T	6	6	2175384	2175389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_013967	GTCTCT	2	12	2176203	2176214	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_013967	ACA	2	6	2176907	2176912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_013967	TCG	2	6	2178168	2178173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_013967	TCGG	2	8	2178177	2178184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7056	NC_013967	TCG	2	6	2178195	2178200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_013967	AAG	2	6	2178223	2178228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_013967	GTC	2	6	2178234	2178239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_013967	CCGT	2	8	2181428	2181435	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7060	NC_013967	GCG	2	6	2181451	2181456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_013967	GCCCG	2	10	2181462	2181471	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7062	NC_013967	A	6	6	2181478	2181483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_013967	TCT	2	6	2181936	2181941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_013967	TCG	2	6	2181967	2181972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_013967	CGC	2	6	2181975	2181980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7066	NC_013967	GAC	2	6	2182022	2182027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_013967	CGG	2	6	2182028	2182033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_013967	TCT	2	6	2184384	2184389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_013967	TCAA	2	8	2184812	2184819	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7070	NC_013967	TG	3	6	2184824	2184829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_013967	GAG	2	6	2184835	2184840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_013967	CGC	2	6	2184854	2184859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7073	NC_013967	GCG	2	6	2185557	2185562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_013967	GTC	2	6	2185641	2185646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_013967	GTG	2	6	2188961	2188966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_013967	TA	3	6	2189013	2189018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_013967	TCGT	2	8	2189072	2189079	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7078	NC_013967	TCCG	2	8	2189122	2189129	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7079	NC_013967	CCG	3	9	2189140	2189148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7080	NC_013967	CCGA	2	8	2189967	2189974	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_013967	CGCGA	2	10	2189996	2190005	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7082	NC_013967	GTT	2	6	2190041	2190046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_013967	GAA	2	6	2190047	2190052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_013967	TTC	2	6	2190058	2190063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_013967	CTGC	2	8	2191887	2191894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7086	NC_013967	GGC	2	6	2192198	2192203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_013967	CGC	2	6	2192211	2192216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7088	NC_013967	CCG	2	6	2192223	2192228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_013967	GTC	2	6	2192259	2192264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7092	NC_013967	GTC	2	6	2192830	2192835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7093	NC_013967	C	6	6	2192862	2192867	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7094	NC_013967	GC	3	6	2192902	2192907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7095	NC_013967	GTC	2	6	2194304	2194309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_013967	CGC	2	6	2194315	2194320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7097	NC_013967	CCG	2	6	2194358	2194363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7098	NC_013967	TAT	2	6	2196035	2196040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7099	NC_013967	TTAG	2	8	2196068	2196075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_013967	CGG	2	6	2197309	2197314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_013967	GCC	3	9	2197317	2197325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7102	NC_013967	CCG	2	6	2197341	2197346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_013967	GTC	2	6	2197363	2197368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7104	NC_013967	CA	3	6	2197459	2197464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7105	NC_013967	TTA	2	6	2197465	2197470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_013967	TAC	2	6	2197549	2197554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7108	NC_013967	GAAGA	2	10	2197634	2197643	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_013967	GA	3	6	2197656	2197661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7110	NC_013967	GTG	2	6	2197662	2197667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_013967	T	6	6	2197682	2197687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_013967	AAG	2	6	2197774	2197779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_013967	TTC	2	6	2197782	2197787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7114	NC_013967	CAGCGG	2	12	2197802	2197813	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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7119	NC_013967	CCCA	2	8	2198144	2198151	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7120	NC_013967	GTC	2	6	2199099	2199104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_013967	T	6	6	2199106	2199111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_013967	CCGA	2	8	2199114	2199121	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7123	NC_013967	GGGCG	2	10	2200199	2200208	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7124	NC_013967	G	6	6	2200985	2200990	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_013967	GTC	2	6	2201029	2201034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7127	NC_013967	CGG	2	6	2202041	2202046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_013967	CCG	2	6	2202047	2202052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7129	NC_013967	TTCC	2	8	2202078	2202085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7131	NC_013967	AT	3	6	2202631	2202636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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