MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloferax volcanii DS2 plasmid pHV4

Total Repeats: 2599

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013966	TG	3	6	352486	352491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013966	ATC	2	6	352498	352503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_013966	CGAGA	2	10	352508	352517	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1504	NC_013966	C	6	6	352580	352585	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1505	NC_013966	CTG	2	6	352762	352767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_013966	CATG	2	8	352800	352807	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_013966	CGA	2	6	354119	354124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_013966	TCC	2	6	354167	354172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_013966	TCGAC	2	10	354195	354204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1510	NC_013966	CGT	2	6	354231	354236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_013966	TC	3	6	354265	354270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_013966	CGCC	2	8	354285	354292	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1513	NC_013966	GAC	2	6	354314	354319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_013966	AGT	2	6	354366	354371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013966	ACC	2	6	355377	355382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_013966	CGAC	2	8	355471	355478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_013966	AT	3	6	355667	355672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013966	TCG	2	6	355743	355748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_013966	GAC	2	6	355874	355879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_013966	GGGGC	2	10	355932	355941	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1521	NC_013966	GTC	2	6	355958	355963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_013966	ATA	2	6	355972	355977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013966	ATT	2	6	355983	355988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013966	ACCG	2	8	356011	356018	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_013966	TAC	2	6	356198	356203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_013966	CGT	2	6	356276	356281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_013966	GTC	2	6	356300	356305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_013966	CCG	2	6	356323	356328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1529	NC_013966	TCGG	2	8	356343	356350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_013966	CGT	2	6	356408	356413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_013966	TG	3	6	356452	356457	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013966	ACG	4	12	356458	356469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_013966	CG	3	6	356468	356473	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_013966	TCG	2	6	356521	356526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_013966	AGG	2	6	356527	356532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013966	CGT	2	6	356555	356560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_013966	CGC	2	6	356594	356599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_013966	CCG	2	6	356609	356614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_013966	CCT	2	6	356648	356653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_013966	CGGGG	2	10	356682	356691	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1541	NC_013966	GTC	2	6	356740	356745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_013966	GTGA	2	8	356757	356764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013966	CTC	2	6	356821	356826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_013966	CT	3	6	356848	356853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_013966	GAC	2	6	356902	356907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_013966	CGT	2	6	356908	356913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_013966	GAG	2	6	356920	356925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013966	ACC	2	6	356945	356950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_013966	CGG	2	6	356991	356996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1550	NC_013966	GCG	2	6	357063	357068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_013966	CGA	3	9	357073	357081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_013966	CGA	2	6	357115	357120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_013966	GAC	2	6	357152	357157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_013966	ACG	2	6	357178	357183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_013966	CGAC	2	8	357203	357210	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1556	NC_013966	CGA	2	6	357217	357222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_013966	ACG	2	6	357262	357267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_013966	TCCG	2	8	357285	357292	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_013966	CGA	2	6	357301	357306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_013966	GAC	2	6	357308	357313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_013966	CGA	2	6	357325	357330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013966	GCGCGA	2	12	357331	357342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_013966	CGC	2	6	357426	357431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_013966	TCG	2	6	357482	357487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_013966	CCG	2	6	357507	357512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_013966	CGT	2	6	357537	357542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_013966	CGGG	2	8	357543	357550	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_013966	CCG	2	6	357569	357574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_013966	TGT	2	6	357602	357607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013966	AT	3	6	357620	357625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013966	GGGT	2	8	357649	357656	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013966	CGC	2	6	357677	357682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_013966	CGT	2	6	357688	357693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_013966	CGA	2	6	357700	357705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013966	GA	3	6	357704	357709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013966	TCCG	2	8	357719	357726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1577	NC_013966	TGCA	2	8	357737	357744	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1578	NC_013966	ACGCG	2	10	357762	357771	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1579	NC_013966	CGGG	2	8	357782	357789	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1580	NC_013966	GTTC	2	8	359314	359321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1581	NC_013966	CGG	2	6	359330	359335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_013966	AGC	2	6	359337	359342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_013966	AC	3	6	359361	359366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_013966	CAG	2	6	359371	359376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_013966	CAG	3	9	359407	359415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_013966	GCC	2	6	359437	359442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1587	NC_013966	TTGA	2	8	359528	359535	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013966	ACT	2	6	359563	359568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_013966	TCG	2	6	359616	359621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_013966	GTC	2	6	359630	359635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_013966	TCG	2	6	359646	359651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_013966	GTC	2	6	359728	359733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_013966	GAC	2	6	359905	359910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_013966	ATTCG	2	10	359918	359927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1595	NC_013966	GTT	2	6	359932	359937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013966	AAT	2	6	359998	360003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013966	GCC	2	6	360123	360128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_013966	TGC	2	6	360280	360285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_013966	GAA	2	6	360334	360339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_013966	ACG	2	6	360354	360359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_013966	TCTGC	2	10	360365	360374	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1602	NC_013966	GTC	2	6	360436	360441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_013966	TC	3	6	360449	360454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1604	NC_013966	TTC	2	6	360457	360462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_013966	TTC	2	6	360490	360495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_013966	AGA	3	9	360732	360740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013966	TTC	2	6	360823	360828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_013966	AGT	2	6	360839	360844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013966	CAA	2	6	360882	360887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_013966	AGC	2	6	360907	360912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_013966	CTC	2	6	360944	360949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_013966	AG	3	6	361031	361036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013966	TC	3	6	361079	361084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_013966	GAT	2	6	361128	361133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013966	GTT	2	6	361141	361146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013966	ACTG	2	8	361169	361176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1617	NC_013966	TAGA	2	8	361261	361268	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013966	AGG	2	6	361280	361285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013966	ACG	2	6	361301	361306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013966	TGA	2	6	361311	361316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013966	CGC	2	6	361402	361407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_013966	TCAA	2	8	361482	361489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1623	NC_013966	CGA	2	6	361597	361602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_013966	CGG	2	6	361620	361625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_013966	CGG	3	9	361640	361648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_013966	GCC	2	6	361651	361656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_013966	CAT	2	6	362995	363000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_013966	AGG	2	6	363061	363066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013966	ATA	2	6	364465	364470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013966	GA	3	6	364484	364489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013966	TGCT	2	8	364552	364559	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1633	NC_013966	AGCA	2	8	364582	364589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1903	NC_013966	TTG	2	6	418931	418936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1904	NC_013966	CCT	2	6	418953	418958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1905	NC_013966	CTC	2	6	418959	418964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1906	NC_013966	TG	3	6	419205	419210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1911	NC_013966	TGTC	2	8	421592	421599	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1912	NC_013966	AGC	2	6	421620	421625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_013966	CCG	3	9	453915	453923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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