MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR03

Total Repeats: 1509

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013746	GCC	2	6	51574	51579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
502	NC_013746	CT	3	6	51598	51603	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
503	NC_013746	GTC	2	6	51642	51647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013746	AGG	2	6	51648	51653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013746	TCG	2	6	51839	51844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_013746	AGC	2	6	51866	51871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_013746	CCG	2	6	51890	51895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_013746	CA	3	6	52993	52998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
509	NC_013746	TGG	2	6	53028	53033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013746	TAGA	2	8	53034	53041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013746	TAG	2	6	53497	53502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013746	TTCT	2	8	53604	53611	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_013746	CAAC	2	8	53626	53633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_013746	CGA	2	6	53650	53655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_013746	TTG	2	6	53673	53678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013746	TG	3	6	54625	54630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013746	CT	3	6	54635	54640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
518	NC_013746	ACT	2	6	54710	54715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_013746	TC	3	6	54792	54797	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
520	NC_013746	TTG	2	6	55799	55804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013746	CT	3	6	56078	56083	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
522	NC_013746	GTC	2	6	56195	56200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013746	AT	3	6	56257	56262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013746	TA	3	6	57560	57565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013746	TTC	2	6	57611	57616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_013746	TGG	2	6	57659	57664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013746	AACT	2	8	58598	58605	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
528	NC_013746	TGA	2	6	58653	58658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013746	AGG	2	6	58671	58676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013746	CA	4	8	58709	58716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
531	NC_013746	ACG	2	6	58726	58731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013746	AAG	2	6	58779	58784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013746	CA	3	6	58810	58815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_013746	AGG	2	6	58842	58847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013746	ATAA	2	8	58895	58902	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013746	AT	3	6	58907	58912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013746	AT	3	6	58940	58945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013746	TA	4	8	58951	58958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013746	TGG	2	6	58999	59004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013746	AACA	2	8	59047	59054	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
541	NC_013746	GTG	2	6	59124	59129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013746	GTC	2	6	59173	59178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_013746	TC	4	8	59205	59212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
544	NC_013746	TAT	2	6	59254	59259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013746	TCG	2	6	59261	59266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013746	A	6	6	59330	59335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013746	GTA	2	6	59642	59647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013746	TCGGC	2	10	59700	59709	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
549	NC_013746	TGAC	2	8	59719	59726	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
550	NC_013746	GA	3	6	59790	59795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013746	GGCC	2	8	59801	59808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
552	NC_013746	AGT	2	6	59822	59827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013746	ATT	2	6	60034	60039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013746	TTC	2	6	60343	60348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_013746	TCT	2	6	60353	60358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_013746	GGA	2	6	60393	60398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013746	CGA	2	6	60469	60474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013746	CGC	2	6	60497	60502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_013746	TCA	2	6	60535	60540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_013746	TGCT	2	8	60591	60598	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_013746	GT	3	6	60690	60695	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013746	TTC	2	6	60711	60716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_013746	CAT	2	6	60746	60751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_013746	ATG	2	6	60756	60761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013746	CGC	2	6	60831	60836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_013746	GAG	2	6	60870	60875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013746	TGG	2	6	60923	60928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013746	TAA	2	6	62490	62495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013746	ACC	2	6	62540	62545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_013746	TCC	2	6	62686	62691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_013746	CTT	2	6	63667	63672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_013746	TAGA	2	8	63681	63688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013746	T	7	7	63701	63707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013746	TA	3	6	63709	63714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013746	GAA	2	6	63734	63739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013746	GAAT	2	8	63755	63762	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013746	TTC	2	6	63775	63780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_013746	CTA	2	6	63796	63801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_013746	GT	3	6	63840	63845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013746	GTC	2	6	63876	63881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_013746	GAT	2	6	63891	63896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013746	TGAT	2	8	63907	63914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_013746	ATTT	2	8	63949	63956	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013746	AGT	2	6	64007	64012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013746	AT	3	6	64148	64153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013746	AAG	2	6	64198	64203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013746	AGA	2	6	64255	64260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013746	CCTC	2	8	64298	64305	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
589	NC_013746	ACGT	2	8	64307	64314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_013746	TC	3	6	64325	64330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_013746	GTC	2	6	64357	64362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_013746	ACT	2	6	64390	64395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013746	CGC	2	6	64543	64548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_013746	CTA	2	6	64776	64781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_013746	CGT	2	6	64912	64917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_013746	GGGAAT	2	12	64945	64956	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013746	CCAG	2	8	65025	65032	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_013746	CTGC	2	8	65063	65070	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_013746	GAA	2	6	65119	65124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013746	TCAG	2	8	66237	66244	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
601	NC_013746	TAAG	2	8	66252	66259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013746	GTGC	2	8	66327	66334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
603	NC_013746	TCGA	2	8	66356	66363	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
604	NC_013746	CAA	2	6	66464	66469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_013746	T	6	6	66485	66490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013746	CTC	2	6	66534	66539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_013746	TGG	2	6	66902	66907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013746	GAT	2	6	68223	68228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013746	GTG	2	6	68678	68683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013746	CGG	2	6	68703	68708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_013746	CGC	2	6	68794	68799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_013746	TCA	2	6	68809	68814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_013746	GCCG	2	8	68925	68932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_013746	GAC	2	6	68961	68966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013746	CGA	2	6	68978	68983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013746	GCG	2	6	69022	69027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013746	CCAT	2	8	69049	69056	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_013746	GA	3	6	69078	69083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013746	CTT	2	6	69098	69103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_013746	TCA	2	6	69118	69123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_013746	TCGACA	2	12	69128	69139	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013746	GGA	2	6	69156	69161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013746	GGA	2	6	69203	69208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013746	CGA	2	6	69227	69232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_013746	GCA	2	6	69233	69238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_013746	GCC	2	6	69246	69251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013746	ACC	2	6	69259	69264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_013746	ACCG	2	8	69282	69289	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
629	NC_013746	TGCC	2	8	69332	69339	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
630	NC_013746	GAC	2	6	69402	69407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_013746	AGA	2	6	69446	69451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013746	CGA	2	6	69494	69499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_013746	GCGCGA	2	12	69500	69511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_013746	TGA	2	6	69674	69679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013746	GCC	2	6	69688	69693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_013746	GAC	2	6	69738	69743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_013746	CCG	2	6	69748	69753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_013746	ACG	2	6	69808	69813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_013746	GAT	2	6	69819	69824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_013746	AAT	2	6	69835	69840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_013746	CTG	2	6	69960	69965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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