MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR02

Total Repeats: 2468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013745	CCGT	2	8	240199	240206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_013745	GTG	2	6	240252	240257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013745	TTC	2	6	240267	240272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_013745	CGT	2	6	240363	240368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_013745	TCG	2	6	240410	240415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_013745	CGA	2	6	240542	240547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013745	CTGA	2	8	240556	240563	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_013745	GAA	2	6	240573	240578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013745	AC	3	6	240655	240660	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_013745	GACCG	2	10	240712	240721	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1511	NC_013745	ACG	2	6	240724	240729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_013745	AGA	2	6	240734	240739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013745	CGAGAC	2	12	240741	240752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_013745	CGA	2	6	240882	240887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013745	CGA	2	6	240952	240957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_013745	AGAT	2	8	242277	242284	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013745	ATA	3	9	242302	242310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013745	TCA	2	6	242361	242366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_013745	GA	3	6	242387	242392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013745	ACA	2	6	242414	242419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_013745	ACCG	2	8	243763	243770	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_013745	GAC	2	6	243814	243819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_013745	CG	3	6	243821	243826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_013745	CGA	2	6	243847	243852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_013745	C	6	6	243934	243939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1526	NC_013745	GTC	2	6	244003	244008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_013745	GCC	2	6	244066	244071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_013745	CGG	2	6	244082	244087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_013745	CGAC	2	8	244088	244095	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_013745	CGTC	2	8	244124	244131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_013745	ATGG	2	8	244171	244178	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013745	TCG	3	9	244183	244191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_013745	CGA	2	6	244222	244227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_013745	GGA	2	6	244280	244285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013745	CGAC	2	8	245123	245130	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_013745	CGTC	2	8	245398	245405	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_013745	GAC	2	6	245450	245455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_013745	CGA	2	6	245481	245486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_013745	TAC	2	6	249655	249660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_013745	TAA	2	6	251500	251505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013745	GCA	2	6	251573	251578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_013745	CGA	2	6	251622	251627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_013745	TG	3	6	251663	251668	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013745	CG	3	6	251675	251680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_013745	GTTC	2	8	251695	251702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1546	NC_013745	GCG	2	6	251708	251713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_013745	CGA	2	6	251747	251752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_013745	AAC	2	6	251891	251896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_013745	CCGG	2	8	251966	251973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1550	NC_013745	TGA	2	6	251993	251998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013745	CGAT	2	8	252025	252032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_013745	ATC	2	6	254157	254162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_013745	AGC	2	6	254196	254201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_013745	AGGG	2	8	254247	254254	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013745	TAG	2	6	254273	254278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013745	ACT	2	6	254292	254297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_013745	AGT	2	6	254835	254840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013745	TCGG	2	8	254844	254851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_013745	TGT	2	6	254882	254887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_013745	ATCCC	2	10	254917	254926	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1561	NC_013745	ATT	2	6	254940	254945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013745	GC	3	6	257556	257561	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_013745	ACC	2	6	257572	257577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_013745	CGC	2	6	257586	257591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1565	NC_013745	TTA	2	6	258686	258691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013745	GCG	2	6	259957	259962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1567	NC_013745	ACC	2	6	261416	261421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1568	NC_013745	CGA	2	6	261431	261436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_013745	CGTT	2	8	261478	261485	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_013745	AGG	2	6	261510	261515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013745	GA	3	6	261599	261604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013745	TCGA	2	8	261622	261629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_013745	TCGT	2	8	261630	261637	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_013745	GAC	2	6	261687	261692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013745	CAT	2	6	261713	261718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_013745	CGG	2	6	261821	261826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_013745	GT	3	6	261904	261909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013745	AG	3	6	261925	261930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013745	GAAA	2	8	261945	261952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013745	GA	3	6	261978	261983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013745	GAC	2	6	261987	261992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_013745	GAT	2	6	261993	261998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013745	ACC	2	6	262007	262012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_013745	CCGA	2	8	263697	263704	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_013745	GAG	2	6	263807	263812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013745	GTC	2	6	263859	263864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_013745	GCC	2	6	263910	263915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1588	NC_013745	CTTCGA	2	12	263916	263927	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_013745	ACCG	2	8	263952	263959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_013745	CG	3	6	263975	263980	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_013745	AT	3	6	264033	264038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_013745	GT	3	6	264061	264066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013745	TCC	2	6	264081	264086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_013745	GCA	2	6	264107	264112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1595	NC_013745	CA	3	6	264111	264116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1596	NC_013745	AGA	2	6	264244	264249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013745	GTT	2	6	264314	264319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013745	GA	3	6	264326	264331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013745	TTC	2	6	264341	264346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_013745	TCA	2	6	264369	264374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_013745	AT	3	6	264391	264396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013745	GCTA	2	8	264399	264406	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_013745	CCG	2	6	264421	264426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_013745	TGA	2	6	264453	264458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013745	CGAT	2	8	264480	264487	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_013745	GCG	2	6	264549	264554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_013745	GCT	2	6	264568	264573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_013745	TC	3	6	264606	264611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1609	NC_013745	TCGA	2	8	264692	264699	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_013745	AG	3	6	264784	264789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013745	ACT	2	6	264809	264814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_013745	AC	3	6	264818	264823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1613	NC_013745	ACAG	2	8	264845	264852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_013745	CAG	2	6	264857	264862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_013745	T	6	6	264902	264907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013745	TTC	2	6	264914	264919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_013745	TAA	2	6	264931	264936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013745	TCG	2	6	264948	264953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_013745	GAC	2	6	264972	264977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013745	TCA	2	6	265151	265156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_013745	AATC	2	8	265169	265176	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_013745	CGA	2	6	265250	265255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_013745	GTC	2	6	265281	265286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_013745	TCC	2	6	265417	265422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_013745	GGC	2	6	265469	265474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_013745	CGAT	2	8	265582	265589	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1627	NC_013745	ACG	2	6	265608	265613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_013745	AGA	2	6	265663	265668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013745	GGC	2	6	265758	265763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_013745	CGAA	2	8	265871	265878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1631	NC_013745	GCGG	2	8	265949	265956	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1632	NC_013745	AC	3	6	265975	265980	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_013745	CAG	2	6	266003	266008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_013745	AG	3	6	266007	266012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013745	GTCT	2	8	266144	266151	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1770	NC_013745	CGT	2	6	284948	284953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1771	NC_013745	TCCG	2	8	284983	284990	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1772	NC_013745	TCCG	2	8	285002	285009	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1773	NC_013745	CGA	2	6	285088	285093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1775	NC_013745	CCG	2	6	285125	285130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1777	NC_013745	CGAT	2	8	285296	285303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1778	NC_013745	CG	3	6	285359	285364	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1779	NC_013745	CA	3	6	285379	285384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1802	NC_013745	GTA	2	6	288374	288379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1896	NC_013745	GT	4	8	306306	306313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1897	NC_013745	AC	3	6	306315	306320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1899	NC_013745	CGAT	2	8	306973	306980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1900	NC_013745	GAC	2	6	306999	307004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1902	NC_013745	CGG	2	6	307011	307016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1903	NC_013745	GTCG	2	8	307058	307065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1904	NC_013745	TCG	3	9	307063	307071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1905	NC_013745	TCG	2	6	307134	307139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1907	NC_013745	CCG	2	6	307204	307209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1935	NC_013745	ATA	2	6	316281	316286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1936	NC_013745	GCT	2	6	316316	316321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1987	NC_013745	TCCG	2	8	323444	323451	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1988	NC_013745	ACC	2	6	323468	323473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1997	NC_013745	GGAT	2	8	328105	328112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1998	NC_013745	GAG	2	6	328126	328131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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