MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR02

Total Repeats: 2468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013745	TGG	2	6	28	33	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013745	TTCT	2	8	82	89	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013745	AG	3	6	94	99	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013745	GAC	2	6	107	112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013745	GGTC	2	8	128	135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013745	CTG	2	6	390	395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013745	ACG	2	6	418	423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013745	TCCGG	2	10	426	435	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013745	CGTT	2	8	500	507	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_013745	GAC	2	6	518	523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013745	AT	3	6	1192	1197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013745	GTT	2	6	1258	1263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013745	GATC	2	8	2358	2365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013745	GTC	2	6	2385	2390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013745	CGA	2	6	2396	2401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013745	AACAA	2	10	2407	2416	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013745	CCGT	2	8	3522	3529	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013745	CCG	2	6	3535	3540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_013745	TAT	2	6	3633	3638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013745	ATTT	2	8	3655	3662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013745	GA	3	6	3664	3669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013745	CCG	2	6	6201	6206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013745	CCGC	2	8	6234	6241	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_013745	TTCG	2	8	6246	6253	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013745	TCC	2	6	7325	7330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_013745	ACCG	2	8	7335	7342	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013745	CCGT	2	8	8397	8404	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013745	TCCC	2	8	8943	8950	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_013745	GAA	2	6	8980	8985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013745	TCAG	2	8	8999	9006	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013745	TCTCC	2	10	9033	9042	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_013745	TTAG	2	8	9347	9354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013745	CGG	2	6	9359	9364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013745	TCG	2	6	9385	9390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013745	CCG	2	6	10911	10916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_013745	GC	3	6	10932	10937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013745	GTTCGA	2	12	10939	10950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013745	TTC	2	6	10951	10956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013745	TC	3	6	10955	10960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_013745	GTTCG	2	10	10974	10983	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013745	T	6	6	11050	11055	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013745	GACCG	2	10	11083	11092	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013745	TCGA	2	8	11128	11135	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_013745	CT	3	6	11156	11161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013745	CGC	2	6	11189	11194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_013745	CGA	2	6	11198	11203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013745	CG	3	6	11228	11233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013745	GC	3	6	12123	12128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013745	CGTC	2	8	12242	12249	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_013745	CGG	2	6	12258	12263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013745	TCGTCC	2	12	12316	12327	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013745	CGC	2	6	12434	12439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013745	CAG	2	6	12448	12453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013745	TAT	2	6	12538	12543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013745	TTCG	2	8	12559	12566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013745	CGA	2	6	12576	12581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013745	TAC	2	6	12708	12713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_013745	GAT	2	6	12718	12723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013745	TGT	2	6	12738	12743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013745	TCG	2	6	12755	12760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013745	CCG	2	6	12793	12798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_013745	GCC	2	6	13706	13711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013745	TGGC	2	8	14225	14232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013745	CGA	2	6	14261	14266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013745	TCCG	2	8	14281	14288	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_013745	CGG	2	6	14294	14299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013745	CCG	2	6	14307	14312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_013745	CGG	2	6	15532	15537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013745	TCG	2	6	15559	15564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013745	CTGA	2	8	16560	16567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013745	ATC	2	6	17883	17888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013745	TCG	2	6	17896	17901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_013745	ACC	2	6	17917	17922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013745	CCG	2	6	17946	17951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_013745	GCCG	2	8	17976	17983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_013745	GCTC	3	12	18039	18050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_013745	GTC	2	6	18061	18066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013745	CGGC	2	8	18071	18078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013745	TCC	2	6	18112	18117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_013745	CCG	2	6	18215	18220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_013745	CGT	2	6	18297	18302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013745	CGC	3	9	18561	18569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_013745	TCG	2	6	18570	18575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013745	GCC	2	6	20550	20555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_013745	T	6	6	20725	20730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013745	TCT	2	6	20735	20740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013745	ATT	2	6	20749	20754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013745	TGT	2	6	20772	20777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013745	GAC	2	6	22502	22507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013745	CGA	2	6	22513	22518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013745	CGA	2	6	23754	23759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013745	TCGAAT	2	12	24531	24542	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013745	TTC	2	6	24583	24588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013745	TTTCG	2	10	24628	24637	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013745	GCC	2	6	25762	25767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_013745	CGA	2	6	25769	25774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013745	GAC	2	6	25828	25833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013745	CG	3	6	25834	25839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013745	TA	3	6	25861	25866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013745	CT	3	6	26915	26920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013745	GCCGTC	2	12	26922	26933	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_013745	CGC	2	6	26934	26939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_013745	GGC	2	6	26940	26945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013745	TTC	2	6	26958	26963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013745	TA	3	6	27061	27066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013745	CCG	2	6	27820	27825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_013745	CGC	2	6	28727	28732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_013745	CGT	2	6	28772	28777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013745	CTG	2	6	28819	28824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_013745	AGC	2	6	30644	30649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013745	TCGA	2	8	30660	30667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013745	GAC	2	6	30809	30814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013745	AT	3	6	30858	30863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013745	CCG	2	6	32713	32718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013745	GAT	2	6	32766	32771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013745	CGAA	2	8	32794	32801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_013745	GGC	2	6	32811	32816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013745	GTCC	2	8	32886	32893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_013745	TA	4	8	32921	32928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013745	CCGTC	2	10	34768	34777	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
121	NC_013745	CGA	3	9	34785	34793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013745	GTC	2	6	35044	35049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013745	T	6	6	35133	35138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013745	AATA	2	8	35209	35216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013745	CGAC	2	8	39577	39584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013745	ACCG	2	8	39616	39623	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_013745	TTC	2	6	42271	42276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013745	ATT	2	6	42290	42295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013745	CCG	2	6	42310	42315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013745	GAC	2	6	42344	42349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013745	TCG	2	6	42356	42361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013745	CCG	2	6	42403	42408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013745	TAT	2	6	42458	42463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013745	GCG	2	6	43461	43466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013745	GAC	2	6	43510	43515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_013745	CCG	2	6	43525	43530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_013745	TCG	2	6	43544	43549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013745	GAC	2	6	43593	43598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_013745	AGGA	2	8	43625	43632	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013745	CG	3	6	43675	43680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013745	CT	3	6	43720	43725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_013745	CGCC	2	8	43801	43808	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
143	NC_013745	CGAT	2	8	43907	43914	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013745	CGG	2	6	43921	43926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_013745	CGAT	2	8	43946	43953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013745	TGT	2	6	43999	44004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013745	TCGG	2	8	44037	44044	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_013745	CGC	2	6	44055	44060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_013745	ACC	2	6	44073	44078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_013745	CGAA	2	8	44111	44118	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_013745	GAGC	2	8	44189	44196	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_013745	GGC	2	6	44234	44239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013745	GTC	2	6	44244	44249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_013745	GATCG	2	10	44317	44326	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_013745	GCG	2	6	44353	44358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_013745	GACCG	2	10	44384	44393	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
157	NC_013745	GTG	2	6	45090	45095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_013745	CGG	2	6	45126	45131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_013745	CGG	2	6	45143	45148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_013745	CGCA	2	8	45175	45182	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_013745	GACC	2	8	46899	46906	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_013745	CCG	2	6	46945	46950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_013745	ACGG	2	8	46957	46964	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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167	NC_013745	CTT	2	6	47143	47148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_013745	ATC	2	6	47358	47363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_013745	GTACG	2	10	47380	47389	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
172	NC_013745	CGA	2	6	47399	47404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_013745	A	6	6	55953	55958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_013745	GA	3	6	55966	55971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_013745	ATATCT	2	12	55985	55996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
178	NC_013745	TAC	2	6	56001	56006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_013745	AATT	2	8	56048	56055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_013745	TG	3	6	56082	56087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_013745	TAA	2	6	56166	56171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_013745	CT	3	6	56353	56358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
185	NC_013745	GA	3	6	56397	56402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013745	TCGA	2	8	56443	56450	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_013745	CG	3	6	58456	58461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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194	NC_013745	TCGA	2	8	58531	58538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
195	NC_013745	CGG	2	6	58569	58574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_013745	TAA	2	6	82319	82324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_013745	GTAC	2	8	82451	82458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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288	NC_013745	ATG	2	6	82516	82521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013745	CCGAA	2	10	85693	85702	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
290	NC_013745	CGA	2	6	85729	85734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_013745	GCC	2	6	86980	86985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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332	NC_013745	A	6	6	97926	97931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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414	NC_013745	TCGA	2	8	109865	109872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
415	NC_013745	GA	3	6	109903	109908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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421	NC_013745	CGG	2	6	110244	110249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
422	NC_013745	GAA	2	6	110322	110327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
423	NC_013745	TC	3	6	110337	110342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
424	NC_013745	TCA	2	6	110377	110382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_013745	CCG	2	6	110387	110392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
426	NC_013745	GCGA	2	8	110416	110423	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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428	NC_013745	GGTCGG	2	12	110887	110898	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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452	NC_013745	CGG	2	6	114047	114052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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459	NC_013745	AT	3	6	114341	114346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_013745	ATCG	2	8	114922	114929	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
463	NC_013745	CG	3	6	115036	115041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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