MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 plasmid pHTUR01

Total Repeats: 2998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013744	TG	3	6	362581	362586	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013744	GA	3	6	362635	362640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013744	GCA	2	6	362721	362726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_013744	CGGT	2	8	362811	362818	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1505	NC_013744	CAG	2	6	362830	362835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_013744	CGG	2	6	362870	362875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013744	CAGC	2	8	362890	362897	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1508	NC_013744	TGA	2	6	362922	362927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013744	GAA	2	6	362950	362955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013744	TC	3	6	362965	362970	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_013744	AAC	2	6	362977	362982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_013744	CCGT	2	8	363024	363031	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_013744	TCA	2	6	363047	363052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_013744	TCC	2	6	363056	363061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1515	NC_013744	AACT	2	8	363101	363108	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_013744	CGTCT	2	10	363169	363178	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1517	NC_013744	TCT	3	9	363227	363235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_013744	GAAGC	2	10	363354	363363	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1519	NC_013744	TAC	2	6	363416	363421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_013744	CGG	2	6	363445	363450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_013744	TGT	2	6	363472	363477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013744	TCG	2	6	363478	363483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_013744	GA	3	6	363530	363535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013744	CAGC	2	8	363574	363581	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_013744	GCTG	2	8	363659	363666	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1526	NC_013744	ATAACT	2	12	363683	363694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1527	NC_013744	TTAC	2	8	363714	363721	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_013744	CAG	2	6	364328	364333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_013744	CGAA	2	8	364358	364365	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1530	NC_013744	AGG	2	6	365940	365945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013744	CGG	2	6	365990	365995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_013744	CTG	2	6	366034	366039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_013744	CT	4	8	366070	366077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_013744	GGC	2	6	366121	366126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_013744	CGCC	2	8	366155	366162	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1536	NC_013744	AGAGCG	2	12	366200	366211	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1537	NC_013744	TAT	2	6	366286	366291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013744	TGA	2	6	366413	366418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_013744	CCA	2	6	366466	366471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_013744	TGA	2	6	366547	366552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013744	TCG	2	6	366564	366569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_013744	GCT	2	6	366646	366651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_013744	TGT	2	6	366803	366808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013744	AGG	2	6	366852	366857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013744	GCC	2	6	366859	366864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_013744	ATACT	2	10	366885	366894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1547	NC_013744	AGC	2	6	366919	366924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_013744	GAG	2	6	366997	367002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013744	GGT	2	6	367009	367014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013744	CGA	2	6	367105	367110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_013744	ACCCAC	2	12	367113	367124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1552	NC_013744	GAC	2	6	367127	367132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_013744	GC	3	6	367150	367155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_013744	GGT	2	6	367192	367197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013744	CGT	2	6	367257	367262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_013744	AGGGG	2	10	367275	367284	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013744	G	6	6	367281	367286	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013744	ATCG	2	8	369024	369031	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_013744	CGA	2	6	369034	369039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_013744	CGG	2	6	371582	371587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_013744	GTC	2	6	371604	371609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_013744	CGAC	2	8	373561	373568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_013744	TCG	2	6	373611	373616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_013744	AG	3	6	373712	373717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013744	GTTCC	2	10	373724	373733	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1566	NC_013744	TGG	2	6	373736	373741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013744	GGA	2	6	373754	373759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_013744	T	7	7	373789	373795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013744	TAA	2	6	373853	373858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013744	TCT	2	6	373892	373897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_013744	TAT	2	6	373923	373928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013744	ATA	2	6	373940	373945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013744	CCTA	2	8	373946	373953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1574	NC_013744	CGA	2	6	373956	373961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_013744	CG	3	6	373962	373967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_013744	GCTG	2	8	374003	374010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1577	NC_013744	TAGT	2	8	374877	374884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013744	AAT	2	6	374890	374895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013744	ATCCA	2	10	374898	374907	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1580	NC_013744	TTC	2	6	374923	374928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_013744	ACT	2	6	374941	374946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_013744	CCGCA	2	10	375015	375024	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1583	NC_013744	CTC	2	6	375046	375051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_013744	TCTA	2	8	375080	375087	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1585	NC_013744	AAAC	2	8	375095	375102	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_013744	TAC	2	6	375125	375130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_013744	GAT	2	6	375333	375338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_013744	TC	3	6	375350	375355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_013744	CCG	2	6	375449	375454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_013744	GCC	2	6	375505	375510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_013744	CT	3	6	375515	375520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_013744	GCGT	2	8	375558	375565	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1593	NC_013744	TGA	2	6	375623	375628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_013744	TTA	2	6	375661	375666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013744	TTG	2	6	375712	375717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013744	GAT	2	6	376414	376419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013744	ATA	2	6	376428	376433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013744	AAC	2	6	376443	376448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1599	NC_013744	ATA	2	6	376457	376462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_013744	ATA	2	6	376570	376575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_013744	TAA	2	6	376605	376610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013744	GT	3	6	376623	376628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013744	GAG	2	6	376692	376697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013744	CAG	2	6	376803	376808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_013744	CTG	2	6	376812	376817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1606	NC_013744	CGA	2	6	376865	376870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_013744	TCT	2	6	376877	376882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_013744	TGC	2	6	376922	376927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_013744	TCGC	2	8	376962	376969	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1610	NC_013744	TGAG	2	8	377033	377040	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013744	CTGT	2	8	377131	377138	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1612	NC_013744	GGA	2	6	377161	377166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013744	AG	3	6	377187	377192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_013744	CGA	2	6	377305	377310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_013744	CGA	2	6	377429	377434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_013744	ACA	2	6	377435	377440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_013744	GCG	2	6	380376	380381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_013744	GAA	2	6	380399	380404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013744	ATC	2	6	380412	380417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013744	ATA	2	6	380425	380430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013744	TTC	3	9	380487	380495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_013744	AAC	2	6	380891	380896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_013744	GCC	2	6	380909	380914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1624	NC_013744	CT	3	6	381040	381045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_013744	TC	3	6	381076	381081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_013744	TGT	2	6	381129	381134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013744	GTC	2	6	381158	381163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_013744	ATT	2	6	381204	381209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013744	ACG	2	6	381262	381267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_013744	TCG	2	6	381268	381273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1631	NC_013744	CTG	2	6	381351	381356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_013744	TCA	2	6	381470	381475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_013744	ACG	2	6	381477	381482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_013744	CCT	2	6	381515	381520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_013744	AGT	2	6	381529	381534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1903	NC_013744	GT	3	6	450942	450947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1904	NC_013744	GAC	2	6	454488	454493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1905	NC_013744	ATC	2	6	455471	455476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1906	NC_013744	GCA	2	6	455477	455482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1907	NC_013744	TG	3	6	455508	455513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1908	NC_013744	CGA	2	6	455588	455593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1909	NC_013744	GT	3	6	455596	455601	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1910	NC_013744	GGC	2	6	455603	455608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1911	NC_013744	GGAC	2	8	455639	455646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1912	NC_013744	GACC	2	8	455659	455666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1913	NC_013744	CGAA	2	8	455667	455674	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1914	NC_013744	TCGA	2	8	455682	455689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1922	NC_013744	TCG	2	6	456737	456742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1925	NC_013744	TCCG	2	8	460140	460147	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1934	NC_013744	CGAC	2	8	460526	460533	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1935	NC_013744	CGA	2	6	460595	460600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1937	NC_013744	TCG	2	6	460992	460997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1938	NC_013744	GCGTCA	2	12	460998	461009	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1939	NC_013744	CCG	2	6	461040	461045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1943	NC_013744	GCC	2	6	463737	463742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1944	NC_013744	A	6	6	463785	463790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1945	NC_013744	TGT	2	6	463794	463799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1946	NC_013744	CGG	2	6	465258	465263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1947	NC_013744	CGA	2	6	465333	465338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1949	NC_013744	TTCG	2	8	466628	466635	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1952	NC_013744	ATTA	2	8	467661	467668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_013744	CCG	2	6	467707	467712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1964	NC_013744	TCGA	2	8	468162	468169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1965	NC_013744	GTT	2	6	468184	468189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1966	NC_013744	CAG	2	6	468235	468240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1971	NC_013744	AT	3	6	468472	468477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1974	NC_013744	CGAAC	2	10	469218	469227	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1975	NC_013744	ATT	2	6	469242	469247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1977	NC_013744	ACT	2	6	469261	469266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1978	NC_013744	T	6	6	469310	469315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1979	NC_013744	GTC	2	6	469420	469425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1982	NC_013744	GA	3	6	469550	469555	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1983	NC_013744	GCCG	2	8	469608	469615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1984	NC_013744	GGT	2	6	470505	470510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1986	NC_013744	TA	3	6	470549	470554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1987	NC_013744	ATTC	2	8	470606	470613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1988	NC_013744	AT	3	6	470665	470670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1990	NC_013744	ACAGC	2	10	470834	470843	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1992	NC_013744	CGA	2	6	472165	472170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1994	NC_013744	TTC	2	6	472376	472381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1995	NC_013744	CGTA	2	8	472388	472395	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1996	NC_013744	CTG	2	6	472423	472428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2000	NC_013744	AGC	2	6	472808	472813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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