MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 13574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_013743	CGA	2	6	3219138	3219143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_013743	GAC	2	6	3219191	3219196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_013743	GTC	2	6	3219247	3219252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_013743	GA	3	6	3219253	3219258	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11505	NC_013743	TCG	2	6	3219263	3219268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_013743	CGA	2	6	3219271	3219276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11507	NC_013743	A	6	6	3219288	3219293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_013743	TACC	2	8	3219332	3219339	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11509	NC_013743	ATCG	2	8	3220698	3220705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11510	NC_013743	CGT	2	6	3220804	3220809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_013743	GCCC	2	8	3220829	3220836	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11512	NC_013743	TCG	2	6	3222731	3222736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_013743	TTCG	2	8	3223551	3223558	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11514	NC_013743	CGT	2	6	3223640	3223645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_013743	GAA	2	6	3223742	3223747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_013743	GCCG	2	8	3223753	3223760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11517	NC_013743	GGT	2	6	3223801	3223806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_013743	GCCG	2	8	3224812	3224819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11519	NC_013743	TCT	2	6	3224830	3224835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_013743	GCG	2	6	3224891	3224896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_013743	CGC	2	6	3224979	3224984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11522	NC_013743	CAT	2	6	3226169	3226174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_013743	CGA	2	6	3226205	3226210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11524	NC_013743	TC	3	6	3226693	3226698	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11525	NC_013743	CGG	2	6	3226715	3226720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_013743	ACG	2	6	3226729	3226734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_013743	GAGCGC	2	12	3227090	3227101	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_013743	CGGA	2	8	3227106	3227113	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11529	NC_013743	CAC	2	6	3227137	3227142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11530	NC_013743	AGT	2	6	3227155	3227160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11531	NC_013743	CCGA	2	8	3228001	3228008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11532	NC_013743	GGC	2	6	3228068	3228073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_013743	CGC	2	6	3228503	3228508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_013743	AGG	2	6	3228514	3228519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11535	NC_013743	GGC	2	6	3229321	3229326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_013743	GACGG	2	10	3229358	3229367	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11537	NC_013743	GA	3	6	3229388	3229393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_013743	GTG	2	6	3230799	3230804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_013743	CGGAAC	2	12	3230830	3230841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_013743	GCGG	2	8	3230860	3230867	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11541	NC_013743	CG	3	6	3230895	3230900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11542	NC_013743	TC	3	6	3230934	3230939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11543	NC_013743	CCG	2	6	3230968	3230973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11544	NC_013743	CGT	2	6	3231002	3231007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_013743	GTC	2	6	3231080	3231085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_013743	CAGA	2	8	3231153	3231160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11547	NC_013743	AAT	2	6	3231208	3231213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_013743	CTGT	2	8	3231230	3231237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11549	NC_013743	ACT	2	6	3231249	3231254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11550	NC_013743	ACG	2	6	3231873	3231878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11551	NC_013743	CG	3	6	3231900	3231905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11552	NC_013743	CG	3	6	3236354	3236359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11553	NC_013743	GCC	2	6	3237822	3237827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11554	NC_013743	GAAAC	2	10	3237835	3237844	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11555	NC_013743	GCT	2	6	3237876	3237881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_013743	CCA	2	6	3237942	3237947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11557	NC_013743	TCG	2	6	3237969	3237974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_013743	GCG	2	6	3237981	3237986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_013743	CGA	2	6	3238023	3238028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_013743	GAG	2	6	3238104	3238109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_013743	CCTCG	2	10	3238970	3238979	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11562	NC_013743	CGA	2	6	3240324	3240329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_013743	TCT	2	6	3240758	3240763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_013743	TAC	2	6	3240804	3240809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_013743	GC	4	8	3240819	3240826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_013743	CGAA	2	8	3240837	3240844	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11567	NC_013743	GAGC	2	8	3240930	3240937	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11568	NC_013743	AGCG	2	8	3240940	3240947	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11569	NC_013743	GGA	2	6	3240958	3240963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_013743	GTA	2	6	3240986	3240991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_013743	TCC	2	6	3241009	3241014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11572	NC_013743	TTCG	2	8	3241043	3241050	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11573	NC_013743	CCG	2	6	3241063	3241068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11574	NC_013743	GA	4	8	3242356	3242363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_013743	CGG	2	6	3242461	3242466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_013743	CGGC	2	8	3242611	3242618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11577	NC_013743	AG	3	6	3242636	3242641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_013743	GAACC	2	10	3242672	3242681	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11579	NC_013743	AC	4	8	3242785	3242792	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11580	NC_013743	GGTG	2	8	3242820	3242827	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_013743	CGG	2	6	3242904	3242909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_013743	GACG	2	8	3242948	3242955	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11583	NC_013743	ATC	2	6	3243000	3243005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_013743	GCT	2	6	3243012	3243017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_013743	GA	3	6	3243068	3243073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_013743	GCG	2	6	3243124	3243129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_013743	TAG	2	6	3243203	3243208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_013743	CAG	2	6	3243251	3243256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_013743	TC	3	6	3243299	3243304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11590	NC_013743	GT	3	6	3243329	3243334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_013743	ACT	2	6	3243350	3243355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_013743	AAC	2	6	3243451	3243456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_013743	AAC	2	6	3243505	3243510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11594	NC_013743	AGC	2	6	3243512	3243517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11595	NC_013743	GAT	2	6	3243527	3243532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_013743	GA	3	6	3243538	3243543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_013743	AGTCG	2	10	3243552	3243561	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11598	NC_013743	GCG	2	6	3244269	3244274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11599	NC_013743	TGC	2	6	3244337	3244342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_013743	TCGG	2	8	3244348	3244355	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11601	NC_013743	CCT	2	6	3244994	3244999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11602	NC_013743	GTG	2	6	3245087	3245092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_013743	CCCA	2	8	3245108	3245115	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11604	NC_013743	GTTAT	2	10	3245980	3245989	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_013743	CAG	2	6	3246047	3246052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_013743	ACA	2	6	3246053	3246058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11607	NC_013743	GCGA	2	8	3246059	3246066	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11608	NC_013743	GGCC	2	8	3246088	3246095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11609	NC_013743	GAG	2	6	3246826	3246831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11610	NC_013743	GA	3	6	3246840	3246845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_013743	GTG	2	6	3247032	3247037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_013743	TTA	2	6	3248385	3248390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_013743	AGTC	2	8	3248412	3248419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11614	NC_013743	TCC	2	6	3248458	3248463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11615	NC_013743	GCT	2	6	3248489	3248494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11616	NC_013743	GC	3	6	3248588	3248593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11617	NC_013743	CGC	2	6	3249981	3249986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11618	NC_013743	CGG	2	6	3250039	3250044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_013743	GATC	2	8	3250080	3250087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11620	NC_013743	CGAT	2	8	3250093	3250100	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11621	NC_013743	CGGTGA	2	12	3250171	3250182	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11622	NC_013743	GCC	2	6	3250775	3250780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11623	NC_013743	TA	3	6	3251000	3251005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_013743	CGA	2	6	3251101	3251106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_013743	GAC	2	6	3251127	3251132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_013743	CGC	2	6	3251152	3251157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11627	NC_013743	CGC	2	6	3252468	3252473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11629	NC_013743	CG	3	6	3252507	3252512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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