MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 13574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013743	ACTG	2	8	3098807	3098814	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11002	NC_013743	AGTG	2	8	3098837	3098844	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_013743	CCG	2	6	3101385	3101390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11004	NC_013743	CGC	2	6	3101556	3101561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11005	NC_013743	GTA	2	6	3101562	3101567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11006	NC_013743	GAA	2	6	3101671	3101676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11007	NC_013743	AT	3	6	3103105	3103110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_013743	GTA	2	6	3104855	3104860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_013743	TTC	2	6	3104899	3104904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11010	NC_013743	CGT	2	6	3104918	3104923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_013743	CGTTC	2	10	3104938	3104947	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11012	NC_013743	CGAT	2	8	3104975	3104982	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11013	NC_013743	CAG	3	9	3105003	3105011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_013743	TA	3	6	3105089	3105094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_013743	GATA	2	8	3105116	3105123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_013743	TCG	2	6	3105131	3105136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_013743	CCGT	2	8	3105155	3105162	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11018	NC_013743	GACG	2	8	3105165	3105172	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11019	NC_013743	GGT	2	6	3105194	3105199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_013743	CGGT	2	8	3105223	3105230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11021	NC_013743	TAA	2	6	3106080	3106085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_013743	AT	3	6	3106086	3106091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_013743	AAG	2	6	3106096	3106101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_013743	GATT	2	8	3106107	3106114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_013743	GAT	2	6	3106128	3106133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_013743	TGG	2	6	3106139	3106144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_013743	CTA	2	6	3107023	3107028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_013743	TAA	2	6	3107034	3107039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_013743	ATCAA	2	10	3107053	3107062	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11030	NC_013743	TATC	2	8	3107099	3107106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11031	NC_013743	GAGT	2	8	3107130	3107137	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_013743	A	7	7	3107254	3107260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_013743	ATG	2	6	3109055	3109060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_013743	TCG	2	6	3109062	3109067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_013743	GCGA	2	8	3109068	3109075	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11036	NC_013743	CGG	2	6	3109082	3109087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11037	NC_013743	CCG	2	6	3109092	3109097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11038	NC_013743	GC	3	6	3109102	3109107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11039	NC_013743	GCC	2	6	3109114	3109119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11040	NC_013743	GGC	2	6	3109148	3109153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_013743	TCGA	2	8	3109243	3109250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11042	NC_013743	ACA	2	6	3109293	3109298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_013743	CGC	2	6	3110259	3110264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11044	NC_013743	CAC	2	6	3110296	3110301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11045	NC_013743	AGCT	2	8	3110313	3110320	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11046	NC_013743	GTT	2	6	3112163	3112168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_013743	CGC	2	6	3112172	3112177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11048	NC_013743	ACG	2	6	3112263	3112268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11049	NC_013743	ACG	2	6	3112363	3112368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_013743	TCA	2	6	3112521	3112526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_013743	TCG	2	6	3112531	3112536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_013743	GTC	2	6	3112541	3112546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_013743	GCGA	2	8	3112679	3112686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11054	NC_013743	CCTCGG	2	12	3112701	3112712	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11055	NC_013743	AGC	2	6	3112724	3112729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11056	NC_013743	ATT	2	6	3113933	3113938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_013743	TTCA	2	8	3113985	3113992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11058	NC_013743	CGTC	2	8	3114231	3114238	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11059	NC_013743	GGC	2	6	3114925	3114930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_013743	CGG	2	6	3114961	3114966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_013743	TGG	2	6	3115252	3115257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_013743	CGTA	2	8	3115289	3115296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11063	NC_013743	GCG	2	6	3116751	3116756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11064	NC_013743	GAC	2	6	3116785	3116790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11065	NC_013743	GTC	2	6	3117276	3117281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11066	NC_013743	A	6	6	3117302	3117307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_013743	CTCG	2	8	3117312	3117319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11068	NC_013743	ATT	2	6	3118638	3118643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_013743	CCG	2	6	3119348	3119353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11070	NC_013743	CGCC	2	8	3119477	3119484	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11071	NC_013743	CGG	2	6	3119498	3119503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_013743	TCGG	2	8	3119548	3119555	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11073	NC_013743	CCG	2	6	3119574	3119579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11074	NC_013743	CGGA	2	8	3119587	3119594	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11075	NC_013743	ACGAG	2	10	3119645	3119654	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11076	NC_013743	TCG	3	9	3119658	3119666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11077	NC_013743	TCG	2	6	3123412	3123417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11078	NC_013743	GTC	2	6	3123423	3123428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_013743	CCCGG	2	10	3123488	3123497	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11080	NC_013743	CGC	2	6	3123609	3123614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11081	NC_013743	GGCG	2	8	3123695	3123702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11082	NC_013743	ACT	2	6	3123706	3123711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_013743	CGC	2	6	3123712	3123717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11084	NC_013743	CGA	2	6	3123822	3123827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11085	NC_013743	TC	3	6	3123829	3123834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11086	NC_013743	GAGG	2	8	3123851	3123858	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_013743	GCC	2	6	3124290	3124295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11088	NC_013743	GAAT	2	8	3124331	3124338	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11089	NC_013743	ACG	2	6	3124428	3124433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11090	NC_013743	GGAC	2	8	3124440	3124447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11091	NC_013743	GAT	2	6	3124498	3124503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_013743	TA	3	6	3125304	3125309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_013743	ACG	2	6	3126663	3126668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11094	NC_013743	GCG	2	6	3126682	3126687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11095	NC_013743	CGTC	2	8	3126699	3126706	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11096	NC_013743	GA	3	6	3126764	3126769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11097	NC_013743	AGT	2	6	3127469	3127474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_013743	CTA	2	6	3130050	3130055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11099	NC_013743	CGA	2	6	3130070	3130075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11100	NC_013743	AAT	2	6	3130104	3130109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_013743	GTC	2	6	3130141	3130146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11102	NC_013743	GCGA	2	8	3130790	3130797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11103	NC_013743	GGC	2	6	3130801	3130806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11104	NC_013743	CGT	2	6	3130817	3130822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11105	NC_013743	GTCG	2	8	3130841	3130848	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11106	NC_013743	GGC	2	6	3130935	3130940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11107	NC_013743	ACGGT	2	10	3132275	3132284	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11108	NC_013743	GCC	3	9	3132386	3132394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11109	NC_013743	AGG	2	6	3133078	3133083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_013743	GCC	2	6	3133129	3133134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_013743	TCG	2	6	3133389	3133394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11112	NC_013743	ATC	2	6	3133418	3133423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_013743	TAC	2	6	3135186	3135191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_013743	CG	3	6	3135215	3135220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11115	NC_013743	GA	3	6	3135221	3135226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_013743	CTC	2	6	3135293	3135298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11117	NC_013743	CTA	2	6	3135776	3135781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11118	NC_013743	GCCG	2	8	3135825	3135832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_013743	TGA	2	6	3135909	3135914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11120	NC_013743	CGAT	3	12	3135941	3135952	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11121	NC_013743	GAC	3	9	3135961	3135969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11122	NC_013743	CGG	2	6	3136007	3136012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11123	NC_013743	TCG	2	6	3136195	3136200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11124	NC_013743	CAGC	2	8	3136220	3136227	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11125	NC_013743	GATTC	2	10	3136262	3136271	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11126	NC_013743	GTC	2	6	3136292	3136297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11127	NC_013743	GCT	2	6	3136394	3136399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11128	NC_013743	TCGG	2	8	3136407	3136414	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11129	NC_013743	GGT	2	6	3136453	3136458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11131	NC_013743	CGC	2	6	3136490	3136495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11152	NC_013743	CGGA	2	8	3137731	3137738	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11241	NC_013743	TCGA	2	8	3151732	3151739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11246	NC_013743	GTCC	2	8	3151912	3151919	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11247	NC_013743	GTCGA	2	10	3151929	3151938	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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11252	NC_013743	CGCC	2	8	3155446	3155453	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11253	NC_013743	CGC	2	6	3155461	3155466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11254	NC_013743	AGCG	2	8	3155537	3155544	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11387	NC_013743	CAA	2	6	3198529	3198534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11498	NC_013743	CCGAT	2	10	3218964	3218973	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11499	NC_013743	CCG	2	6	3218995	3219000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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