MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 13574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_013743	GAC	2	6	2798991	2798996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_013743	AACC	2	8	2799051	2799058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10003	NC_013743	ACC	2	6	2799065	2799070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10004	NC_013743	CGCA	2	8	2799097	2799104	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_013743	CGAC	2	8	2799843	2799850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10006	NC_013743	CCG	2	6	2799857	2799862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10007	NC_013743	CGG	2	6	2799868	2799873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_013743	TCT	2	6	2799883	2799888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_013743	GGAAC	2	10	2800522	2800531	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
10010	NC_013743	CCG	2	6	2800560	2800565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_013743	CGA	2	6	2800585	2800590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_013743	GGGAC	2	10	2800608	2800617	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10013	NC_013743	TTCG	2	8	2800622	2800629	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10014	NC_013743	CAT	2	6	2800716	2800721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10015	NC_013743	CGA	2	6	2800781	2800786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_013743	CGCT	2	8	2800840	2800847	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10017	NC_013743	ACC	2	6	2800866	2800871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10018	NC_013743	GCC	2	6	2800885	2800890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10019	NC_013743	GAC	2	6	2800895	2800900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10020	NC_013743	CG	4	8	2801327	2801334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10021	NC_013743	TTCG	2	8	2801381	2801388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10022	NC_013743	ATCG	2	8	2801412	2801419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10023	NC_013743	TAG	2	6	2801469	2801474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_013743	ACC	2	6	2801494	2801499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_013743	CGC	2	6	2801503	2801508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10026	NC_013743	TGG	2	6	2803045	2803050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_013743	TG	3	6	2803058	2803063	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_013743	CAG	2	6	2803072	2803077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_013743	GA	3	6	2803096	2803101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_013743	TCA	2	6	2803125	2803130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10031	NC_013743	GTG	2	6	2803146	2803151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_013743	GTC	2	6	2803220	2803225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_013743	CTC	2	6	2804037	2804042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_013743	GCT	2	6	2804088	2804093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_013743	CCGGA	2	10	2804094	2804103	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10036	NC_013743	CGC	2	6	2804108	2804113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10037	NC_013743	CGA	2	6	2804138	2804143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10038	NC_013743	GGT	2	6	2804146	2804151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_013743	TC	3	6	2804159	2804164	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_013743	GCC	2	6	2804203	2804208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_013743	TGC	2	6	2804696	2804701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10042	NC_013743	ACG	2	6	2804890	2804895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_013743	GTGG	2	8	2804927	2804934	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_013743	CCGAT	2	10	2805334	2805343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10045	NC_013743	GTCG	2	8	2805394	2805401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10046	NC_013743	GCG	2	6	2809609	2809614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_013743	CTC	2	6	2809697	2809702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_013743	TACG	2	8	2809716	2809723	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10049	NC_013743	GCG	2	6	2809824	2809829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_013743	GCG	2	6	2809842	2809847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10051	NC_013743	TCCC	2	8	2809945	2809952	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10052	NC_013743	CCGTC	2	10	2809966	2809975	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10053	NC_013743	TC	3	6	2809998	2810003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10054	NC_013743	CGC	2	6	2810657	2810662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_013743	CGA	2	6	2811402	2811407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_013743	GCC	3	9	2811413	2811421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10057	NC_013743	ACC	2	6	2811424	2811429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10058	NC_013743	GCCGA	2	10	2812155	2812164	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10059	NC_013743	CGA	2	6	2812212	2812217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10060	NC_013743	CCGG	2	8	2812300	2812307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10061	NC_013743	CGCGGT	2	12	2813831	2813842	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_013743	CGCA	2	8	2813850	2813857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10063	NC_013743	CGC	2	6	2814263	2814268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10064	NC_013743	CGTT	2	8	2814324	2814331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10065	NC_013743	GTC	2	6	2814418	2814423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_013743	AC	3	6	2814537	2814542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_013743	GTA	2	6	2815991	2815996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_013743	GT	3	6	2816045	2816050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_013743	ACG	2	6	2817982	2817987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_013743	CCAG	2	8	2818072	2818079	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10071	NC_013743	TCGA	2	8	2818082	2818089	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10072	NC_013743	ATCG	2	8	2818090	2818097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10073	NC_013743	GCG	2	6	2818107	2818112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_013743	GAC	2	6	2818150	2818155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10075	NC_013743	CGG	2	6	2820261	2820266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_013743	TTCCG	2	10	2820268	2820277	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10077	NC_013743	CGG	2	6	2820329	2820334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_013743	CGC	2	6	2820356	2820361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10079	NC_013743	G	6	6	2820470	2820475	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_013743	GAC	2	6	2820477	2820482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10081	NC_013743	CGA	2	6	2820502	2820507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10082	NC_013743	GTC	2	6	2820578	2820583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10083	NC_013743	CCA	2	6	2820598	2820603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10084	NC_013743	CGA	2	6	2820640	2820645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10085	NC_013743	GAC	2	6	2822336	2822341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10086	NC_013743	ATT	2	6	2822423	2822428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_013743	GA	3	6	2822531	2822536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_013743	GAT	2	6	2822621	2822626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_013743	GGC	2	6	2822647	2822652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10090	NC_013743	CGA	2	6	2822676	2822681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_013743	AC	3	6	2822715	2822720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10092	NC_013743	CGG	2	6	2822758	2822763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_013743	ACCGC	2	10	2822790	2822799	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10094	NC_013743	TCG	2	6	2822943	2822948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_013743	GTC	2	6	2822983	2822988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_013743	TTC	2	6	2823023	2823028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_013743	ATC	2	6	2823065	2823070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_013743	CGG	2	6	2823130	2823135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_013743	TC	3	6	2823735	2823740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10100	NC_013743	ACC	2	6	2824526	2824531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10101	NC_013743	GTTC	2	8	2824554	2824561	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10102	NC_013743	GCA	2	6	2824595	2824600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10103	NC_013743	CGA	2	6	2824655	2824660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10104	NC_013743	TGG	2	6	2824672	2824677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_013743	GAAG	2	8	2824700	2824707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_013743	AGA	2	6	2824755	2824760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_013743	CGG	2	6	2824825	2824830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10108	NC_013743	TGC	2	6	2824832	2824837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_013743	GTT	2	6	2824844	2824849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_013743	GCA	2	6	2824851	2824856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_013743	TCT	2	6	2824995	2825000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_013743	GACT	2	8	2825006	2825013	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10113	NC_013743	CGA	2	6	2826022	2826027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10114	NC_013743	CGC	2	6	2826049	2826054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10115	NC_013743	AGC	2	6	2826088	2826093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_013743	CCG	2	6	2826119	2826124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_013743	CAGT	2	8	2826609	2826616	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10118	NC_013743	CCGC	2	8	2826626	2826633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10119	NC_013743	CCG	2	6	2826651	2826656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10120	NC_013743	CGT	2	6	2826675	2826680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10121	NC_013743	GTC	2	6	2826696	2826701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_013743	ACA	2	6	2826703	2826708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_013743	CGAT	2	8	2826711	2826718	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10124	NC_013743	CCG	2	6	2826918	2826923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10125	NC_013743	CAC	2	6	2828722	2828727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10126	NC_013743	TG	3	6	2829835	2829840	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_013743	GCG	2	6	2829871	2829876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10128	NC_013743	GA	3	6	2829883	2829888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_013743	TGTT	2	8	2834131	2834138	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_013743	AT	3	6	2834148	2834153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10230	NC_013743	TTA	2	6	2867205	2867210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10238	NC_013743	CCGT	2	8	2870321	2870328	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10244	NC_013743	TCGAG	2	10	2870676	2870685	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10245	NC_013743	TC	3	6	2870711	2870716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10246	NC_013743	GA	3	6	2870805	2870810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_013743	TCG	2	6	2870828	2870833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_013743	GGT	2	6	2870948	2870953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10251	NC_013743	GT	3	6	2871018	2871023	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10252	NC_013743	ACG	2	6	2871043	2871048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_013743	GTTC	2	8	2871087	2871094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10254	NC_013743	CGG	2	6	2871157	2871162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10379	NC_013743	GCGA	2	8	2899829	2899836	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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