MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 13574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_013743	GCAGC	2	10	2387327	2387336	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8502	NC_013743	CCG	2	6	2387384	2387389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8503	NC_013743	GTT	2	6	2387811	2387816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_013743	TCGA	2	8	2387855	2387862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8505	NC_013743	ATCGA	2	10	2388552	2388561	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8506	NC_013743	TCG	2	6	2388582	2388587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_013743	CCA	2	6	2388631	2388636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8508	NC_013743	GA	3	6	2388807	2388812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_013743	AGT	2	6	2388871	2388876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_013743	AGGT	2	8	2388961	2388968	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_013743	CAG	2	6	2388985	2388990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_013743	AT	3	6	2389098	2389103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_013743	TGA	2	6	2389141	2389146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_013743	TA	3	6	2389209	2389214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_013743	TA	3	6	2389223	2389228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_013743	CTGT	2	8	2389242	2389249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8517	NC_013743	CTT	2	6	2389259	2389264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8518	NC_013743	CGC	2	6	2389341	2389346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8519	NC_013743	CGT	2	6	2389387	2389392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_013743	CCGA	2	8	2390019	2390026	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8521	NC_013743	CTGA	2	8	2390100	2390107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8522	NC_013743	ACG	2	6	2390108	2390113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8523	NC_013743	TCG	2	6	2390118	2390123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_013743	GAT	2	6	2390171	2390176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_013743	CAT	2	6	2391000	2391005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_013743	CGGA	2	8	2391012	2391019	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8527	NC_013743	CGGC	2	8	2391085	2391092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8528	NC_013743	GGTC	2	8	2392372	2392379	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8529	NC_013743	CGT	2	6	2394340	2394345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_013743	GAC	2	6	2394368	2394373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8531	NC_013743	GT	3	6	2394375	2394380	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_013743	GCA	2	6	2394386	2394391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8533	NC_013743	CGA	2	6	2394413	2394418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_013743	CTC	2	6	2394494	2394499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8535	NC_013743	CG	3	6	2394516	2394521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8536	NC_013743	CCGC	2	8	2394616	2394623	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8537	NC_013743	ACG	2	6	2396214	2396219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8538	NC_013743	CGG	2	6	2396251	2396256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_013743	ATA	2	6	2396273	2396278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_013743	AGC	2	6	2396291	2396296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_013743	AATA	2	8	2396320	2396327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_013743	GGT	2	6	2396343	2396348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_013743	CGTG	2	8	2396365	2396372	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8544	NC_013743	GAAC	2	8	2397839	2397846	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8545	NC_013743	ACAT	2	8	2397871	2397878	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8546	NC_013743	AC	3	6	2399755	2399760	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8547	NC_013743	GCG	2	6	2401528	2401533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_013743	TCG	2	6	2401901	2401906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8549	NC_013743	GTC	2	6	2401909	2401914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_013743	ATC	3	9	2401915	2401923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_013743	GAC	2	6	2401962	2401967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_013743	CG	3	6	2401984	2401989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8553	NC_013743	TCCG	2	8	2402015	2402022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8554	NC_013743	TCGGT	2	10	2403760	2403769	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8555	NC_013743	CCG	2	6	2403897	2403902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8556	NC_013743	GTCG	2	8	2403926	2403933	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8557	NC_013743	CTCA	2	8	2403934	2403941	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8558	NC_013743	CGT	2	6	2403951	2403956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_013743	GC	4	8	2403991	2403998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8560	NC_013743	GCT	2	6	2404000	2404005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_013743	ACC	2	6	2405088	2405093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8562	NC_013743	CCGT	2	8	2405112	2405119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8563	NC_013743	CCG	2	6	2405135	2405140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8564	NC_013743	CGA	2	6	2405197	2405202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8565	NC_013743	TCGA	2	8	2405227	2405234	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8566	NC_013743	CGTCGC	2	12	2405248	2405259	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8567	NC_013743	ACG	2	6	2405270	2405275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8568	NC_013743	CAC	2	6	2405283	2405288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_013743	CGA	2	6	2405294	2405299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_013743	CGAC	2	8	2405333	2405340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8571	NC_013743	CGC	2	6	2405352	2405357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8572	NC_013743	GC	4	8	2405364	2405371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8573	NC_013743	GTA	2	6	2405422	2405427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_013743	CGG	2	6	2405443	2405448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8575	NC_013743	GCG	2	6	2405457	2405462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8576	NC_013743	TCCGT	2	10	2406277	2406286	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8577	NC_013743	AT	3	6	2406300	2406305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8578	NC_013743	CGGA	2	8	2408020	2408027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8579	NC_013743	GGAC	2	8	2408071	2408078	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8580	NC_013743	GATC	2	8	2408084	2408091	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8581	NC_013743	CA	3	6	2408154	2408159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8582	NC_013743	TC	3	6	2409645	2409650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8583	NC_013743	TGC	3	9	2409933	2409941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8584	NC_013743	TCG	2	6	2409950	2409955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8585	NC_013743	GCT	2	6	2410032	2410037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_013743	CGA	2	6	2410153	2410158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8587	NC_013743	CGAC	2	8	2410167	2410174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8588	NC_013743	TG	3	6	2410203	2410208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_013743	CCGGG	2	10	2410982	2410991	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8590	NC_013743	GC	3	6	2410998	2411003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8591	NC_013743	ACC	2	6	2411004	2411009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8592	NC_013743	GAT	2	6	2411868	2411873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_013743	GAG	2	6	2411910	2411915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8594	NC_013743	GTC	2	6	2413227	2413232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8595	NC_013743	CTCC	2	8	2413335	2413342	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8596	NC_013743	GTC	2	6	2413401	2413406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8597	NC_013743	CGTT	2	8	2413418	2413425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8598	NC_013743	CGAC	2	8	2413430	2413437	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8599	NC_013743	GC	3	6	2413441	2413446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8600	NC_013743	GGAC	2	8	2413455	2413462	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8601	NC_013743	AC	3	6	2414775	2414780	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8602	NC_013743	GA	3	6	2414854	2414859	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8603	NC_013743	CT	3	6	2414866	2414871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8604	NC_013743	TCA	2	6	2414874	2414879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_013743	GAC	2	6	2414900	2414905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8606	NC_013743	CT	3	6	2415028	2415033	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8607	NC_013743	CGC	2	6	2415047	2415052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8608	NC_013743	ACG	2	6	2415082	2415087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8609	NC_013743	CCACA	2	10	2415127	2415136	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8610	NC_013743	GTT	2	6	2415153	2415158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_013743	AGC	2	6	2415164	2415169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_013743	CGTG	2	8	2415181	2415188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8613	NC_013743	TCT	2	6	2415297	2415302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8614	NC_013743	CGT	2	6	2415335	2415340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8615	NC_013743	GTT	2	6	2415406	2415411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_013743	GTT	2	6	2415419	2415424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_013743	CGG	2	6	2415462	2415467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8618	NC_013743	CGAG	2	8	2415574	2415581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8619	NC_013743	TCG	3	9	2415609	2415617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_013743	GAC	2	6	2415844	2415849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8621	NC_013743	CTTT	2	8	2415862	2415869	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8622	NC_013743	TTC	2	6	2415870	2415875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8623	NC_013743	TGT	2	6	2415981	2415986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_013743	CG	3	6	2415999	2416004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8625	NC_013743	GTC	2	6	2416009	2416014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_013743	CAG	2	6	2416083	2416088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8627	NC_013743	CCG	2	6	2416089	2416094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8628	NC_013743	GTTA	2	8	2416148	2416155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_013743	GTC	2	6	2416267	2416272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8631	NC_013743	CTC	2	6	2416295	2416300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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