MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 13574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013743	AGT	2	6	2234545	2234550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_013743	CTAT	2	8	2234556	2234563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8003	NC_013743	TAC	2	6	2234602	2234607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_013743	GAC	2	6	2234724	2234729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_013743	AGTGG	2	10	2234766	2234775	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_013743	GT	3	6	2234793	2234798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_013743	CGC	2	6	2235593	2235598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8008	NC_013743	AGTC	2	8	2235637	2235644	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8009	NC_013743	TTC	2	6	2235699	2235704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_013743	AAT	2	6	2235749	2235754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_013743	GCC	2	6	2236610	2236615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8012	NC_013743	CGCTC	2	10	2236655	2236664	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8013	NC_013743	CGT	3	9	2236716	2236724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_013743	CGT	2	6	2236737	2236742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_013743	TCGC	2	8	2236760	2236767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8016	NC_013743	GCC	2	6	2236954	2236959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8017	NC_013743	CGA	2	6	2236965	2236970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_013743	CGCC	2	8	2236975	2236982	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8019	NC_013743	TC	3	6	2237027	2237032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_013743	CGA	2	6	2237047	2237052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_013743	CGATC	2	10	2237061	2237070	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8022	NC_013743	CGGT	2	8	2237131	2237138	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8023	NC_013743	GAT	2	6	2240162	2240167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_013743	AAT	2	6	2240301	2240306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_013743	CG	3	6	2240323	2240328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8026	NC_013743	CA	3	6	2240329	2240334	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8027	NC_013743	ATC	2	6	2240360	2240365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_013743	TC	3	6	2240393	2240398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_013743	CGA	2	6	2240407	2240412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_013743	GCT	2	6	2240419	2240424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_013743	CAG	2	6	2240467	2240472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_013743	TAC	2	6	2240589	2240594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8033	NC_013743	TCG	2	6	2240638	2240643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_013743	GC	3	6	2240652	2240657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_013743	GTG	2	6	2241351	2241356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_013743	GAA	2	6	2241502	2241507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_013743	CCG	2	6	2241616	2241621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_013743	TCCC	2	8	2241667	2241674	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8039	NC_013743	TA	3	6	2241719	2241724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_013743	AGAA	2	8	2241725	2241732	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_013743	TAT	2	6	2241762	2241767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_013743	GTG	2	6	2241820	2241825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_013743	TTA	2	6	2241865	2241870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_013743	GATA	2	8	2241946	2241953	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_013743	GA	3	6	2241954	2241959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_013743	TG	3	6	2248765	2248770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_013743	GCCA	2	8	2248773	2248780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8048	NC_013743	CGG	2	6	2248829	2248834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_013743	GCC	2	6	2248853	2248858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_013743	GCC	2	6	2248968	2248973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_013743	TTA	2	6	2249757	2249762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_013743	CGCGG	2	10	2250859	2250868	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8053	NC_013743	CGGA	2	8	2250892	2250899	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_013743	CGGAA	2	10	2250962	2250971	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8055	NC_013743	CTAA	2	8	2252944	2252951	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8056	NC_013743	GTT	2	6	2252994	2252999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_013743	CTA	2	6	2253019	2253024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8058	NC_013743	CTT	2	6	2253071	2253076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_013743	CAA	2	6	2253854	2253859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_013743	TC	3	6	2253977	2253982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8061	NC_013743	CGA	2	6	2254019	2254024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_013743	CCCGT	2	10	2254053	2254062	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
8063	NC_013743	CGA	2	6	2254071	2254076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_013743	GAC	2	6	2254079	2254084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_013743	GAC	2	6	2254126	2254131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_013743	G	6	6	2255592	2255597	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_013743	TCT	2	6	2255614	2255619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_013743	CGC	2	6	2255620	2255625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8069	NC_013743	CGG	2	6	2255634	2255639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_013743	ACC	2	6	2255679	2255684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8071	NC_013743	ACCG	2	8	2255688	2255695	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_013743	ACG	2	6	2255757	2255762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8073	NC_013743	A	6	6	2255772	2255777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_013743	TCGA	2	8	2258098	2258105	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8075	NC_013743	ACCG	2	8	2258149	2258156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8076	NC_013743	TC	3	6	2258188	2258193	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8077	NC_013743	GTC	2	6	2258233	2258238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8078	NC_013743	TCG	2	6	2259185	2259190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_013743	TTCGA	2	10	2259207	2259216	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8080	NC_013743	CGG	2	6	2259253	2259258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8081	NC_013743	GGC	2	6	2259295	2259300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_013743	ACG	2	6	2259307	2259312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_013743	CCG	2	6	2259795	2259800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8084	NC_013743	GGCA	2	8	2259807	2259814	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8085	NC_013743	CCGG	2	8	2259852	2259859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8086	NC_013743	CG	3	6	2259863	2259868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8087	NC_013743	CGG	2	6	2259917	2259922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8088	NC_013743	CGG	3	9	2260019	2260027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_013743	CGCC	2	8	2260037	2260044	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8090	NC_013743	ACG	2	6	2260069	2260074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_013743	TTC	2	6	2260114	2260119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_013743	TCG	2	6	2260147	2260152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_013743	CCG	3	9	2260159	2260167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8094	NC_013743	TCG	2	6	2260183	2260188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_013743	CGAG	2	8	2260202	2260209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8096	NC_013743	CGC	2	6	2260216	2260221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_013743	CGGG	2	8	2260283	2260290	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8098	NC_013743	TCGCGC	2	12	2260375	2260386	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8099	NC_013743	TCG	2	6	2260387	2260392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8100	NC_013743	TCG	2	6	2260456	2260461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_013743	AGCG	2	8	2260502	2260509	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8102	NC_013743	CAGA	2	8	2260565	2260572	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8103	NC_013743	AT	3	6	2260573	2260578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_013743	GTT	2	6	2260597	2260602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_013743	CGG	2	6	2261360	2261365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8106	NC_013743	GCC	2	6	2261883	2261888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_013743	GCG	2	6	2262332	2262337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_013743	TA	3	6	2265008	2265013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_013743	TCT	2	6	2265016	2265021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_013743	TTG	2	6	2265027	2265032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_013743	AGA	2	6	2265042	2265047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_013743	AT	3	6	2265097	2265102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_013743	GCC	2	6	2265133	2265138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8114	NC_013743	CTC	2	6	2265151	2265156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8115	NC_013743	CGA	2	6	2265177	2265182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_013743	GACG	2	8	2265195	2265202	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_013743	CCGC	2	8	2265204	2265211	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8118	NC_013743	GCT	2	6	2266255	2266260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_013743	CGA	2	6	2267813	2267818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_013743	GTC	2	6	2267854	2267859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_013743	GCG	2	6	2267881	2267886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_013743	CG	3	6	2267885	2267890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_013743	TCG	2	6	2267947	2267952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_013743	AATC	2	8	2267956	2267963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8125	NC_013743	GCG	2	6	2269456	2269461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_013743	ACCG	2	8	2269465	2269472	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8127	NC_013743	GCC	2	6	2269483	2269488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8128	NC_013743	TCG	2	6	2269492	2269497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8129	NC_013743	GAG	2	6	2270179	2270184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_013743	GGT	2	6	2270235	2270240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_013743	GTC	2	6	2270258	2270263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8133	NC_013743	CCG	2	6	2270281	2270286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8247	NC_013743	T	6	6	2319743	2319748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8248	NC_013743	CGA	2	6	2319895	2319900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8250	NC_013743	CCGA	2	8	2320266	2320273	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8251	NC_013743	CGA	2	6	2320291	2320296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8253	NC_013743	ATCG	2	8	2322968	2322975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8254	NC_013743	ACAT	2	8	2322977	2322984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8255	NC_013743	TAT	2	6	2322999	2323004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8256	NC_013743	ATG	2	6	2323010	2323015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8257	NC_013743	GGT	2	6	2323048	2323053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8258	NC_013743	ACCG	2	8	2324144	2324151	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8259	NC_013743	CGAT	2	8	2324166	2324173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8261	NC_013743	TCG	2	6	2324238	2324243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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