MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 13574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_013743	CGT	2	6	1962580	1962585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_013743	GTC	2	6	1962590	1962595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_013743	C	6	6	1962606	1962611	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7004	NC_013743	TCAG	2	8	1962618	1962625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7005	NC_013743	AGA	2	6	1963802	1963807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_013743	GGT	2	6	1963877	1963882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_013743	ACTCGA	2	12	1964156	1964167	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_013743	CCGT	2	8	1964172	1964179	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_013743	TCG	2	6	1964180	1964185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_013743	CCG	2	6	1964197	1964202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7011	NC_013743	CT	4	8	1964206	1964213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7012	NC_013743	CGG	2	6	1964251	1964256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_013743	GA	3	6	1964275	1964280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_013743	GTCG	2	8	1964533	1964540	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7015	NC_013743	AGG	2	6	1964541	1964546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_013743	CGA	3	9	1964558	1964566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7017	NC_013743	TACG	2	8	1966130	1966137	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7018	NC_013743	CTT	2	6	1966157	1966162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_013743	GTCT	2	8	1966208	1966215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7020	NC_013743	AACTGA	2	12	1966219	1966230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7021	NC_013743	TCC	2	6	1966292	1966297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7022	NC_013743	GC	4	8	1966405	1966412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7023	NC_013743	CAC	2	6	1966413	1966418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_013743	AGA	2	6	1966467	1966472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_013743	CG	3	6	1966500	1966505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7026	NC_013743	TAC	2	6	1966733	1966738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_013743	TCGT	2	8	1967595	1967602	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7028	NC_013743	TCGG	2	8	1967622	1967629	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7029	NC_013743	CGA	2	6	1967637	1967642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7030	NC_013743	GTT	2	6	1970867	1970872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_013743	TCG	2	6	1970874	1970879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_013743	ACTG	2	8	1970882	1970889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7033	NC_013743	AGG	2	6	1970973	1970978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_013743	GCC	2	6	1970996	1971001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7035	NC_013743	GAA	2	6	1971060	1971065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_013743	GACG	2	8	1971123	1971130	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7037	NC_013743	CGC	2	6	1972806	1972811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7038	NC_013743	CCG	2	6	1972821	1972826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7039	NC_013743	TCG	2	6	1974624	1974629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_013743	GAC	2	6	1974632	1974637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_013743	AGC	2	6	1978356	1978361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7042	NC_013743	ACT	2	6	1978378	1978383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_013743	CGC	2	6	1978419	1978424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7044	NC_013743	CG	3	6	1979021	1979026	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_013743	CGA	2	6	1979044	1979049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_013743	TTTC	2	8	1979061	1979068	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7047	NC_013743	GGCT	2	8	1979073	1979080	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7048	NC_013743	CGAT	2	8	1979742	1979749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7049	NC_013743	CGG	2	6	1979751	1979756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_013743	CGA	2	6	1979771	1979776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7051	NC_013743	TAA	2	6	1980299	1980304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_013743	CA	3	6	1980310	1980315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_013743	GTC	3	9	1980319	1980327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_013743	CA	3	6	1981903	1981908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7055	NC_013743	CGCT	2	8	1982032	1982039	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_013743	CCGT	2	8	1982040	1982047	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7057	NC_013743	TC	3	6	1982050	1982055	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_013743	ACC	2	6	1982090	1982095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7059	NC_013743	AGCG	2	8	1984427	1984434	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7060	NC_013743	AGAAC	2	10	1986416	1986425	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
7061	NC_013743	TCGG	2	8	1986634	1986641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7062	NC_013743	GTC	2	6	1986657	1986662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_013743	CGG	2	6	1986737	1986742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_013743	GAC	2	6	1988328	1988333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_013743	CCG	2	6	1988335	1988340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7066	NC_013743	T	6	6	1989698	1989703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7067	NC_013743	CA	3	6	1989730	1989735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7068	NC_013743	GGT	2	6	1989737	1989742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_013743	CGT	2	6	1989770	1989775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7070	NC_013743	GAG	2	6	1989854	1989859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_013743	CGAGG	2	10	1989866	1989875	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7072	NC_013743	CGG	2	6	1990897	1990902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_013743	CGA	2	6	1992533	1992538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_013743	CGG	2	6	1992579	1992584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_013743	AGA	2	6	1994067	1994072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_013743	TGAT	2	8	1994084	1994091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_013743	AT	3	6	1994090	1994095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_013743	CGT	2	6	1994149	1994154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_013743	CGA	2	6	1994161	1994166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_013743	TA	4	8	1994239	1994246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_013743	AT	3	6	1994279	1994284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_013743	CGGT	2	8	1994531	1994538	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7083	NC_013743	GATTC	2	10	1994563	1994572	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7084	NC_013743	CGA	3	9	1994592	1994600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7085	NC_013743	GTTC	2	8	1994634	1994641	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7086	NC_013743	GTA	2	6	1994665	1994670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_013743	CGT	2	6	1994702	1994707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7088	NC_013743	TCG	2	6	1994723	1994728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7089	NC_013743	TCGG	2	8	1994734	1994741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7090	NC_013743	GAC	2	6	1994752	1994757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7091	NC_013743	GAG	2	6	1994853	1994858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_013743	TA	4	8	1994882	1994889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_013743	CTGT	2	8	1994894	1994901	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7094	NC_013743	ATA	2	6	1994964	1994969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_013743	TAT	2	6	1994977	1994982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7096	NC_013743	CG	3	6	1995024	1995029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7097	NC_013743	TA	3	6	1995065	1995070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_013743	TCATA	2	10	1995129	1995138	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7099	NC_013743	CGTCT	2	10	1995368	1995377	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7100	NC_013743	AGT	2	6	1998186	1998191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7102	NC_013743	GAC	2	6	1998247	1998252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_013743	GACGG	2	10	2000924	2000933	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7104	NC_013743	GAG	2	6	2000979	2000984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7105	NC_013743	CCGAA	2	10	2000998	2001007	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7106	NC_013743	TC	3	6	2001023	2001028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7107	NC_013743	GC	4	8	2002085	2002092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_013743	CA	3	6	2002106	2002111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_013743	CGGC	2	8	2002122	2002129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7110	NC_013743	GGTG	2	8	2002140	2002147	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_013743	TCG	3	9	2002771	2002779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_013743	CGA	2	6	2003575	2003580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_013743	CGTC	2	8	2003589	2003596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7114	NC_013743	TCGG	2	8	2003615	2003622	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7115	NC_013743	CGG	2	6	2003903	2003908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7116	NC_013743	GTCC	2	8	2003931	2003938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7117	NC_013743	GTCG	2	8	2003942	2003949	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7118	NC_013743	CG	3	6	2003956	2003961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7119	NC_013743	TCG	2	6	2003962	2003967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7120	NC_013743	CGG	2	6	2005188	2005193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_013743	CG	3	6	2005430	2005435	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7122	NC_013743	CGC	2	6	2005943	2005948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7123	NC_013743	TCG	3	9	2005966	2005974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_013743	GTC	2	6	2006008	2006013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_013743	CAGT	2	8	2006039	2006046	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7126	NC_013743	GA	3	6	2008261	2008266	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_013743	GTG	2	6	2008283	2008288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_013743	GGCA	2	8	2008334	2008341	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7129	NC_013743	GGT	2	6	2008373	2008378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_013743	TCG	2	6	2009703	2009708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7131	NC_013743	TTCGG	2	10	2009748	2009757	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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7133	NC_013743	TCG	2	6	2012828	2012833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7257	NC_013743	ATC	2	6	2038833	2038838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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