MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Haloterrigena turkmenica DSM 5511 chromosome

Total Repeats: 13574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013743	ACG	2	6	1538203	1538208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_013743	GCC	2	6	1539049	1539054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5503	NC_013743	CGA	2	6	1539087	1539092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5504	NC_013743	CGT	2	6	1539100	1539105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_013743	CT	3	6	1540076	1540081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_013743	GGGT	2	8	1540340	1540347	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_013743	CCG	3	9	1540351	1540359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5508	NC_013743	GCCG	2	8	1540391	1540398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_013743	TAGC	2	8	1540429	1540436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_013743	CTC	2	6	1540713	1540718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_013743	TCG	3	9	1541168	1541176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_013743	CGC	3	9	1542945	1542953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_013743	CT	3	6	1543732	1543737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5514	NC_013743	GCGA	2	8	1543743	1543750	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_013743	GGTAC	2	10	1543799	1543808	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5516	NC_013743	GTC	2	6	1543814	1543819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_013743	GA	3	6	1543892	1543897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_013743	TCCG	2	8	1544881	1544888	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5519	NC_013743	TCGG	2	8	1544892	1544899	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5520	NC_013743	CGT	2	6	1544930	1544935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_013743	AT	3	6	1544979	1544984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_013743	TAC	2	6	1545002	1545007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_013743	GA	4	8	1545089	1545096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_013743	GA	3	6	1545108	1545113	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013743	CGA	2	6	1545148	1545153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_013743	GAC	2	6	1545154	1545159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_013743	GGA	2	6	1545754	1545759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_013743	CGT	2	6	1545796	1545801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_013743	CGC	2	6	1545802	1545807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_013743	GC	3	6	1545806	1545811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_013743	CCGT	2	8	1545818	1545825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5532	NC_013743	CGAT	2	8	1545845	1545852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_013743	AAG	2	6	1545915	1545920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_013743	CATA	2	8	1545956	1545963	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5535	NC_013743	GTTCG	2	10	1546191	1546200	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5536	NC_013743	GCT	2	6	1546448	1546453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_013743	GCGT	2	8	1546507	1546514	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5538	NC_013743	GA	4	8	1546560	1546567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_013743	GGTA	2	8	1547830	1547837	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_013743	T	6	6	1547867	1547872	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_013743	ACT	2	6	1548197	1548202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_013743	GATC	2	8	1548206	1548213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_013743	GCGTCG	2	12	1548217	1548228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_013743	GC	4	8	1548355	1548362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_013743	CGA	2	6	1548397	1548402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_013743	GCGA	2	8	1548409	1548416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5547	NC_013743	GGGA	2	8	1548425	1548432	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_013743	TTCG	2	8	1548555	1548562	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5549	NC_013743	CTCA	2	8	1548576	1548583	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5550	NC_013743	CGC	2	6	1548598	1548603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_013743	TCT	2	6	1548605	1548610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_013743	CCGA	2	8	1548658	1548665	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5553	NC_013743	GC	4	8	1548688	1548695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5554	NC_013743	CACCG	2	10	1548696	1548705	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5555	NC_013743	ACT	2	6	1548710	1548715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_013743	CTC	2	6	1548742	1548747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_013743	GTCG	2	8	1552988	1552995	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5558	NC_013743	CGA	2	6	1553007	1553012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_013743	CGA	2	6	1553035	1553040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_013743	GCCGC	2	10	1553056	1553065	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5561	NC_013743	GAC	2	6	1553074	1553079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_013743	GATC	2	8	1553599	1553606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5563	NC_013743	AGT	2	6	1553646	1553651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_013743	AGC	2	6	1554167	1554172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5565	NC_013743	A	6	6	1554177	1554182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_013743	GCG	2	6	1554210	1554215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_013743	GTC	2	6	1554388	1554393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_013743	TGG	2	6	1554399	1554404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_013743	TTG	2	6	1554453	1554458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_013743	GCG	2	6	1554492	1554497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5571	NC_013743	GT	3	6	1557312	1557317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_013743	TCGAGA	2	12	1557348	1557359	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5573	NC_013743	ATT	2	6	1557398	1557403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_013743	AAC	2	6	1558406	1558411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_013743	TAA	2	6	1558414	1558419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_013743	CCG	2	6	1561106	1561111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5577	NC_013743	TGT	2	6	1561139	1561144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_013743	GAC	2	6	1561189	1561194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_013743	GTC	2	6	1562320	1562325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_013743	CGG	2	6	1562336	1562341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_013743	AGGG	2	8	1562366	1562373	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_013743	GAC	2	6	1562392	1562397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_013743	CGG	2	6	1562904	1562909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_013743	GGGT	2	8	1563502	1563509	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_013743	ACGGA	2	10	1565499	1565508	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5586	NC_013743	CGT	2	6	1565537	1565542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_013743	TTCGC	2	10	1565546	1565555	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5588	NC_013743	ACC	2	6	1566904	1566909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_013743	GTC	2	6	1566968	1566973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5590	NC_013743	CAG	2	6	1566975	1566980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_013743	TTTCG	2	10	1567745	1567754	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5592	NC_013743	CGA	2	6	1567784	1567789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_013743	GACG	2	8	1568281	1568288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5594	NC_013743	CG	3	6	1568287	1568292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_013743	GCC	2	6	1568310	1568315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5596	NC_013743	TC	3	6	1568328	1568333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5597	NC_013743	ATT	2	6	1568437	1568442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_013743	CGA	2	6	1568498	1568503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_013743	AC	3	6	1568511	1568516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_013743	AC	3	6	1568569	1568574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_013743	GAA	2	6	1568580	1568585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_013743	GCG	2	6	1568605	1568610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_013743	ATG	2	6	1568611	1568616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_013743	CCG	2	6	1570145	1570150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5605	NC_013743	TC	3	6	1570283	1570288	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_013743	CTCG	2	8	1570318	1570325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_013743	CCGA	2	8	1570338	1570345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5608	NC_013743	ACG	2	6	1570749	1570754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_013743	GAC	2	6	1571135	1571140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_013743	CGA	2	6	1571176	1571181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5611	NC_013743	GT	3	6	1572143	1572148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_013743	CGA	2	6	1572182	1572187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_013743	TTC	2	6	1572215	1572220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_013743	CCGA	2	8	1572231	1572238	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_013743	C	6	6	1572246	1572251	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5616	NC_013743	GAC	2	6	1572345	1572350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5617	NC_013743	TAA	2	6	1572409	1572414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_013743	GCG	2	6	1573866	1573871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_013743	TCGA	2	8	1573897	1573904	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5620	NC_013743	CTG	2	6	1573905	1573910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_013743	TCG	2	6	1574562	1574567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_013743	TCG	2	6	1574586	1574591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_013743	TAG	2	6	1574645	1574650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_013743	ACG	2	6	1574680	1574685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_013743	GT	3	6	1574698	1574703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_013743	CTA	2	6	1574719	1574724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_013743	TAC	2	6	1574865	1574870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_013743	ACT	2	6	1576565	1576570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_013743	GGA	2	6	1576571	1576576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_013743	TTTC	2	8	1576966	1576973	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5762	NC_013743	ACA	2	6	1619187	1619192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5763	NC_013743	CGGA	2	8	1619222	1619229	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5888	NC_013743	CGGT	2	8	1649394	1649401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5889	NC_013743	ATCG	2	8	1649422	1649429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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